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日本人の染色体地図作製に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 63870105
研究種目

試験研究(B)

配分区分補助金
研究分野 人類遺伝学
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

安河内 幸雄  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (60037398)

研究分担者 小林 靖  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助手 (70225548)
北嶋 繁孝  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教授 (30186241)
大塚 毅  九州大学, 医学部, 助手 (50213773)
沢田 育久  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助手 (30215909)
川口 達夫  東京医科学歯科大学, 難治疾患研究所, 助手 (70191997)
横田 英介  九州大学, 医学部, 助手 (60167723)
研究期間 (年度) 1988 – 1990
研究課題ステータス 完了 (1990年度)
配分額 *注記
11,500千円 (直接経費: 11,500千円)
1990年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
1989年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
1988年度: 5,900千円 (直接経費: 5,900千円)
キーワードBsuEメチレ-ス / Nan II / MHC / リンキングライブラリ- / X染色体 / MHCマッピング / メチル化 / メチル化抵抗性NotIリンキングクロ-ン / Linking Library / Jumping Library / NanII / BsuEメチレース / 精製
研究概要

1.rare cutter酵素系の開発:BsuEメチレ-スーNot I系及びTaq Iメチレ-スーDpn I(NanII)系の開発を行なった。BsuEメチレ-スをBactllus subtilis ISE15より精製した。SDSーPAGEにより46Kのペプチドであることが判明した。ヒトMHCのマッピングに応用してその有用性を検討した。Not Iで切断される6つの断片のうち5つがメチル化によりブロックされた。ブロックされなかった1つの断片はCGCGのオ-バ-ラッピングの塩基配列を持たなかった。以上により、その有用性がヒトゲノムのレベルで証明された。次にNan IIの精製をNeisseria animalis より試みたが、含量が少なかったため成功しなかった。しかしゲノムを分解しないような酵素標品を得ることはできた。この系を大腸菌ゲノムに応用したところ、PFGE上Not Iと匹敵する大きな断片を確認できた。現在より複雑で大きなヒトゲノムへの応用について検討している。
2.リンキングライブラリ-の開発:BsuEメチレ-スによるメチル化抵抗性Not Iリンキングクロ-ンをX染色体について、またNot Iリンキングクロ-ンを第6染色体について開発した。まずX染色体特異的なDNAクロ-ンをBsuEメチレ-スでメチル化し、Not Iで切断できるクロ-ンにカナマイシン遺伝子を挿入することにより、メチル化抵抗性Not Iクロ-ンを選択した。630のクロ-ンのうち114が特異的なクロ-ンであることがDNAシ-ケンスにより判明した。ヒトX染色体を持つ雑種細胞から調製したDNAブロットとハイブリダイゼ-ションした結果、56%くらいがX染色体由来、20%くらいが常染色体由来、そして23%くらいがどちら由来か判断されないことが明らかとなった。同様に第6染色体に特異的なNot Iリンキングクロ-ンでは、少なくとも10個の異なったクロ-ンが短腕に、29個が長腕にハイブリダイゼ-ションにより位置付けされた。

報告書

(4件)
  • 1990 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1989 実績報告書
  • 1988 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (9件)

  • [文献書誌] H.P. Arenstorf, et al.: "Construction and Characterization of a NotーBsuE Linking Library from fhe Human X Chromosome." Submitted to Genomics.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. Shukla, et al.: "Purification of BsuE Methylase and Its Application in Genome Mapping." Submitted to Nucleic Acids Research.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y. Chifu, et al.: "Genetic Analysis of β^0 Thalassemia in Japanese Family.Abstract." Acta Haematol. Jpn.53. 379 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. P. Arenstorf, et al.: "Construction and Characterization of a Not-BsuE Linking Library from the Human X Chromosome" Genomics.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. Shukla, et al.: "Purification of BsuE Methylose and Its Application in Genome Mapping" Nucleic Acids Research.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y. Chifu, et al.: "Genetic Analysis of beta^0 Thalassemia in Japanese Family" Acta Haematol. Jpn.53(2). 379 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.P.Arenstorf,et al.: "Construction and Characterization of a NotーBsuE Linking Library from the Human X Chromosome." Genomics.

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] H.Shukla,et al.: "Purification of BsuE Methylase and Its Application in Genome Mapping." Nucleic Acids Research.

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Chifu,et al.: "Genetic Analysis of β^0 Thalassemia in Japanese Family.Abstract." Acta Haematol.Jpn.53. 379 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書

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公開日: 1988-04-01   更新日: 2016-04-21  

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