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DNA計算による制御系設計法の構築と制御系設計支援ツールの開発

公募研究

研究領域感覚と知能を備えた分子ロボットの創成
研究課題/領域番号 15H00823
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関九州工業大学

研究代表者

中茎 隆  九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 准教授 (30435664)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードDNA回路 / 遡及性 / モジュール性 / フィードバックレギュレータ / 制御工学 / 分子ロボティクス / フィードバック制御系 / 安定性解析 / DNA論理回路 / DNAアナログ回路
研究実績の概要

アメーバ型分子ロボットの制御問題として、DNA濃度のレギュレーションを検討した。センサからの指令値とアクチュエータからのフィードバック信号は、共に1本鎖DNAの濃度と仮定し、これらの量が一致するようにアクチュエータに与える操作量を調整する制御問題である。本研究では,DNA反応系が持つ非負性、モジュール性、有限性を考慮した制御系設計法と特異摂動理論をベースとする解析手法の提案を行った。より高性能な制御器を設計するためには、既存のDNA論理回路、演算回路(以後、DNA回路と呼ぶ)の組み合わせ回路が自在に設計できる必要がある。このように、基本的な部品を組み合わせて複雑な回路を設計する手法はボトムアップデザインと呼ばれる。しかしながら、DNA回路のモジュール性は一般に低く、回路単体では正常に動作していても、組み合わせ回路を構築するために回路同士を接続すると個々のDNA回路の機能が損なわれるため、組み合わせ回路のボトムアップデザインには何らかの工夫が必要となる。本研究では、上述のDNA濃度レギュレータの設計の際に用いた遡及性理論と特異摂動理論を用いて、DNA回路のモジュール性を担保する設計手法を提案した。
また、制御系設計支援ツールの開発のため、除算型フィードバックを有する生化学反応系の安定性に関するモデルベース解析手法を提案した。一般に、生化学反応系は高次元の非線形系でモデル化され、特にフィードバックループが含まれる場合は、リミットサイクルを引き起こす可能性がある。本研究では、フィードバックループの安定余裕を定量評価できるナイキスト安定判別法に着目し、複数存在するフィードバックループの中から特定の1つのループに対して適用する手法を提案した。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] DNA Switcher for a Molecular Robot2016

    • 著者名/発表者名
      Katsuhiro Nishijima, Takashi Nakakuki, Yusuke Sato, Shin-ichiro Nomura
    • 雑誌名

      Proc. of ICT-ROBOT2016

      巻: -

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 除算型フィードバックを有する生化学反応系の安定性解析手法2016

    • 著者名/発表者名
      中茎隆
    • 雑誌名

      電気学会論文誌C(電子・情報・システム部門誌)

      巻: 136 号: 5 ページ: 617-624

    • DOI

      10.1541/ieejeiss.136.617

    • NAID

      130005149216

    • ISSN
      0385-4221, 1348-8155
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書 2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Molecular Governor: DNA Feedback Regulator for Molecular Robotics2016

    • 著者名/発表者名
      T. Nakakuki, J. Imura
    • 雑誌名

      SICE Journal of Control, Measurement, and System Integration (SICE JCMSI)

      巻: 9 号: 2 ページ: 60-69

    • DOI

      10.9746/jcmsi.9.60

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 分子ネットワークを創成する分子ロボティクスと解明するシステムバイオロジー2017

    • 著者名/発表者名
      中茎隆
    • 学会等名
      第4回制御部門マルチシンポジウム
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2017-03-06
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA鎖置換反応で創られるシステムの解析法2017

    • 著者名/発表者名
      中茎隆,井村順一
    • 学会等名
      第4回制御部門マルチシンポジウム
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2017-03-06
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] DNA鎖置換反応で創られるシステムのロバスト性2017

    • 著者名/発表者名
      中茎隆,川又生吹,村田智
    • 学会等名
      第29回自律分散システム・シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2017-01-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 特異摂動理論を用いたMolecular Governorの制御性能解析2016

    • 著者名/発表者名
      藤本圭吾,中茎隆
    • 学会等名
      計測自動制御学会 システム・情報部門 学術講演会 2016
    • 発表場所
      滋賀
    • 年月日
      2016-12-06
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] DNAフィードバックレギュレータの設計2016

    • 著者名/発表者名
      緒方研仁,中茎隆
    • 学会等名
      計測自動制御学会 システム・情報部門 学術講演会 2016
    • 発表場所
      滋賀
    • 年月日
      2016-12-06
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] DNA鎖置換反応のロバスト性に関する一考察2016

    • 著者名/発表者名
      大曲智隆,中茎隆,川又生吹,村田智
    • 学会等名
      第59回自動制御連合講演会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2016-11-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] DNAフィードバックレギュレータの設計2016

    • 著者名/発表者名
      緒方研仁,中茎隆
    • 学会等名
      第59回自動制御連合講演会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2016-11-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] DNA組合せ回路のモジュール性に関する研究2016

    • 著者名/発表者名
      神門大輝,中茎隆
    • 学会等名
      平成28年電気学会産業用用部門大会
    • 発表場所
      群馬
    • 年月日
      2016-08-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] DNA A/D Converter by Team Kyutech in BIOMOD20152016

    • 著者名/発表者名
      Ryudai Segughi, Youhei Umeda, Kento Ogata, Tomotaka Omagari, Takashi Nakakuki, et al.
    • 学会等名
      IEEE-NEMS2016
    • 発表場所
      宮城
    • 年月日
      2016-04-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNA計算による制御系設計法の構築と制御系設計支援ツールの開発2016

    • 著者名/発表者名
      中茎
    • 学会等名
      第7回領域会議
    • 発表場所
      愛知
    • 年月日
      2016-03-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 特異摂動理論によるDNAフィードバックレギュレータの制御性能解析2016

    • 著者名/発表者名
      藤本,中茎
    • 学会等名
      第3回 制御部門 マルチシンポジウム
    • 発表場所
      愛知
    • 年月日
      2016-03-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] DNAアナログ回路のモジュール性に関する研究2015

    • 著者名/発表者名
      神門,中茎
    • 学会等名
      第34回計測自動制御学会九州支部学術講演会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2015-11-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] DNA回路で作られた制御回路の性能評価に関する研究2015

    • 著者名/発表者名
      佐藤,中茎
    • 学会等名
      計測自動制御学会 システム・情報部門 学術講演会 2015
    • 発表場所
      函館
    • 年月日
      2015-11-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] DNAフィードバック制御系の安定性解析に関する研究2015

    • 著者名/発表者名
      藤本,中茎
    • 学会等名
      計測自動制御学会 システム・情報部門 学術講演会 2015
    • 発表場所
      函館
    • 年月日
      2015-11-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] DNA演算回路の遡及性に関する一考察2015

    • 著者名/発表者名
      瀬口,中茎
    • 学会等名
      第58回自動制御連合講演会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-11-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Modularity analysis of a cascade of DNA circuits and its application to DNA feedback regulator for molecular robotics2015

    • 著者名/発表者名
      T. Nakakuki
    • 学会等名
      CBI学会2015年大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-10-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] How to achieve a combination circuit in DNA computing; Toward a realization of feedback control operation in a molecular robot2015

    • 著者名/発表者名
      H. Kando, T. Nakakuki
    • 学会等名
      SICE Annual Conference 2015
    • 発表場所
      Hangzhou, China
    • 年月日
      2015-07-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [図書] DNA分子デザインのすべて~BIOMOD虎の巻~2016

    • 著者名/発表者名
      分子ロボティクス研究会編
    • 総ページ数
      224
    • 出版者
      情報計算化学生物学会(CBI学会)出版
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [図書] 「DNA分子デザインのすべて~BIOMOD虎の巻~」2016

    • 著者名/発表者名
      分子ロボティクス研究会編
    • 総ページ数
      224
    • 出版者
      情報計算化学生物学会(CBI学会)出版
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-28  

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