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病原性 IV 型分泌マシナリーの全構造解析

公募研究

研究領域運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性
研究課題/領域番号 15H01322
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

久堀 智子  大阪大学, 微生物病研究所, 特任講師(常勤) (20397657)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
2016年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2015年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
キーワード細菌 / 感染症 / ナノマシン / タンパク質分泌系 / 電子顕微鏡
研究実績の概要

病原細菌の持つ IV 型分泌系は細菌感染において中心的役割を果たす超分子マシナリーである。 20 種類ほどのタンパク質が高度に組織化されて細菌の内外膜にわたって構築されるこの複合体は、細菌の病原性や宿主の免疫応答からの回避に必要な様々な細菌因子を宿主細胞の細胞質に直接輸送する。しかしながらその分子構造や駆動メカニズムはまだほとんど解明されていない。本研究課題では、病原細菌レジオネラの持つ Dot/Icm IV 型分泌系の中核(コア)複合体を含んだ全体構造を明らかにすることを長期的目標とし、特にコア複合体に相互作用する内膜および外膜複合体に着目して、主に電子顕微鏡法、生化学的手法による解析を行った。
当初計画していた、クライオトモグラフィーによる全体構造解析は、様々な試みにもかかわらず、細胞密度を下げるために必要なミニセル形成を効率良く行なうことができなかったため実行できなかった。しかしながら、コア複合体に相互作用する IV 型複合体構成タンパク質をレジオネラ Dot/Icm タンパク質群から新たに見つけ出すことに成功した。このタンパク質は IV 型複合体の形成には必須ではないが、コア複合体の中の外膜部分複合体に付与される部分構造を形成することが電子顕微鏡解析により示された。また、コア複合体のクライオ電子顕微鏡法による詳細な構造解析に向けての端緒として、コア複合体を形成する一つのタンパク質にタグを導入することによって高効率に精製を行える条件を確立することができた。
今後、これらの成果を足掛かりとして、 IV 型分泌系の全体構造を詳細に明らかにしていくため、クライオ電子顕微鏡法によるコア複合体の3次元再構成、内膜反転ベシクルによる内膜部分複合体の構造解析を中心とした研究を展開することを計画している。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2017 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 4件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Bacterial secretion system skews the fate of Legionella-containing vacuoles towards LC3-associated phagocytosis.2017

    • 著者名/発表者名
      Hubber A., Kubori T., Coban C., Matsuzawa T., Ogawa M., Kawabata T., Yoshimori T., and Nagai H.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 7 号: 1 ページ: 44795-44795

    • DOI

      10.1038/srep44795

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Isolation of the Dot/Icm Type IV Secretion System Core Complex from Legionella pneumophila for Negative Stain Electron Microscopy Studies2017

    • 著者名/発表者名
      Kubori T. and Nagai H.
    • 雑誌名

      bio-protocol

      巻: 7

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Life with bacterial secretion systems.2016

    • 著者名/発表者名
      Kubori T.
    • 雑誌名

      PLoS Pathog.

      巻: 12(8) 号: 8 ページ: e1005562-e1005562

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1005562

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The type IVB secretion system: an enigmatic chimera.2016

    • 著者名/発表者名
      Kubori T and *Nagai H.
    • 雑誌名

      Curr Opin Microbiol.

      巻: 29 ページ: 22-9

    • DOI

      10.1016/j.mib.2015.10.001

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Molecular and structural analysis of Legionella DotI gives insights into an inner membrane complex essential for type IV secretion.2015

    • 著者名/発表者名
      Kuroda T, Kubori T, Bui TX, Hyakutake A, Uchida Y, *Imada K and *Nagai H.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 5 号: 1 ページ: 10192-10192

    • DOI

      10.1038/srep10912

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 宿主オートファジー関連システムとレジオネラ2017

    • 著者名/発表者名
      久堀智子、Andree Hubber、Xuan Thanh Bui、永井宏樹
    • 学会等名
      第 90 回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      仙台国際センター展示棟(宮城県、仙台市)
    • 年月日
      2017-03-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Manipulation of the host ubiquitin system by Legionella Deubiquitinases.2017

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Kubori
    • 学会等名
      OIST workshop: Bacterial Flagella, Injectisome and Type III Secretion Systems
    • 発表場所
      沖縄科学技術大学院大学 Main Campus (沖縄県、国頭郡恩納村)
    • 年月日
      2017-03-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 病原細菌レジオネラによる宿主ユビキチンシステムの操作2017

    • 著者名/発表者名
      久堀智子
    • 学会等名
      新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」 生体運動研究合同班会議
    • 発表場所
      神戸国際会議場 国際会議室(兵庫県、神戸市)
    • 年月日
      2017-01-06
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Manipulation of the host ubiquitin system by Legionella Deubiquitinases.2016

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Kubori and Hiroki Nagai
    • 学会等名
      T4SS2016: Type IV secretion in Gram-Nagative and Gram-Positive Bacteria
    • 発表場所
      Beilngries, GERMANY
    • 年月日
      2016-12-08
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 病原因子分泌系を介した細菌と宿主細胞の相互作用2016

    • 著者名/発表者名
      久堀智子
    • 学会等名
      東京工業大学 Cell Biology Unit 第4回コロキウム
    • 発表場所
      東京工業大学すずかけ台キャンパス(神奈川県、横浜市)
    • 年月日
      2016-10-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Manipulation of the host ubiquitin system by Legionella Deubiquitinases.2016

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Kubori and Hiroki Nagai
    • 学会等名
      第 15 回 あわじしま感染症・免疫フォーラム
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県、淡路市)
    • 年月日
      2016-09-06
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 病原性 IV 型分泌マシナリーの全構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      久堀智子
    • 学会等名
      新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」 第 4 回領域全体会議
    • 発表場所
      長崎大学良順会館(長崎県、長崎市)
    • 年月日
      2016-06-08
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Manipulation of the host ubiquitin system by Legionella Deubiquitinases2016

    • 著者名/発表者名
      Tomoko KUBORI, Xuan Thanh BUI, Andree HUBBER and Hiroki NAGAI
    • 学会等名
      第89回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター、大阪市
    • 年月日
      2016-03-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 病原性 IV 型分泌マシナリーの全構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      久堀智子
    • 学会等名
      生体運動合同班会議2016
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都市
    • 年月日
      2016-01-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Legionella RavZ plays a role in preventing ubiquitin recruitment to bacteria-containing vacuoles2015

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Kubori, Xuan Thanh Bui, Andree Hubber and Hiroki Nagai
    • 学会等名
      第14回 あわじしま感染症・免疫フォーラム
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場、兵庫県
    • 年月日
      2015-09-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 病原性 IV 型分泌マシナリーの全構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      久堀智子
    • 学会等名
      新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」 第3回領域全体会議
    • 発表場所
      金沢商工会議所会館、金沢県
    • 年月日
      2015-06-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] レジオネラ IV 型分泌マシナリー内膜部分複合体の構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      久堀智子
    • 学会等名
      新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」 第3回領域全体会議
    • 発表場所
      金沢商工会議所会館、金沢県
    • 年月日
      2015-06-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] Nagai Lab

    • URL

      http://nagailab.biken.osaka-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書 2015 実績報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-28  

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