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DNA変換酵素のスライディングと共役した酵素活性機構の動的構造基盤の解明

公募研究

研究領域動的構造生命科学を拓く新発想測定技術-タンパク質が動作する姿を活写する-
研究課題/領域番号 15H01634
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関京都大学

研究代表者

永田 崇  京都大学, エネルギー理工学研究所, 准教授 (10415250)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
2016年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2015年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
キーワードNMR / APOBEC / 実時間計測 / 脱アミノ化 / AFM
研究実績の概要

今年度はまず、がんの原因変異を引き起こすシチジン脱アミノ化酵素APOBEC3B(A3B)について、NMR実時間解析を行った。A3Bは一本鎖DNA(ssDNA)に含まれるTC配列を脱アミノ化してTU配列に変換する。今回、A3Bは短いssDNAに含まれるTC配列に対して高い活性を示すこと、また長いssDNAにおいては、末端領域よりも中心領域に含まれるTC配列に対して高い活性を示すこと等を明らかにした。これらの性質は、同じAPOBECファミリーの抗HIV1因子APOBEC3G(A3G)の性質とは大きく異なる。A3Gは長いssDNAに含まれるシチジンに対して高い活性を示すとともに、シチジンの位置依存性に関しては3’→5’極性を有することを、我々は明らかにして来た。A3Bについて得られた新しい知見について論文を作成し、海外学術誌に投稿した。今後は高速AFM観察により、A3BとA3Gの異なる機能発現機構を明らかにする。
一方昨年度は、A3GがssDNA上をスライディングする姿を高速AFMで観察することを試みて、問題点と改善の指針を得ていた。今年度はそれを踏まえて、ssDNAの向きを決められる系を構築するとともに、ssDNAが比較的弱く固定化出来る条件を検討した。前者により、A3GがssDNA上を動く際の向きを知ることができ、後者により、ssDNAの固定化が及ぼすA3Gの動きへの影響を抑えることが出来る。領域内共同研究により更なる条件検討を進めている。
新たにはじめた核酸のin-cell NMRについては、ヒト培養細胞に導入した核酸のNMRスペクトルを世界に先駆けて得ることに成功していた。今年度は、細胞内環境、疑似細胞内環境及び試験管内環境における核酸のスペクトルを比較した。異なる環境への感受性は核酸配列または構造により異なることがわかった。現在論文作成と追加実験を進めている。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (71件)

すべて 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (62件) (うち国際学会 26件、 招待講演 3件)

  • [国際共同研究] National Institute of Health/Kansas State University/UCSF(米国)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] ETH(Switzerland)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] Universite Laval(Canada)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular Landscape of the Ribosome Pre-initiation Complex during mRNA Scanning: Structural Role for eIF3c and Its Control by eIF52017

    • 著者名/発表者名
      Obayashi E, Luna RE, Nagata T, Martin-Marcos P, Hiraishi H, Singh CR, Erzberger JP, Zhang F, Arthanari H, Morris J, Pellarin R, Moore C, Harmon I, Papadopoulos E, Yoshida H, Nasr ML, Unzai S, Thompson B, Aube E, Hustak S, Stengel F, Dagraca E, Ananbandam A, Gao P, Urano T, Hinnebusch AG, Wagner G, Asano K.
    • 雑誌名

      Cell Report

      巻: 18 号: 11 ページ: 2651-2663

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.02.052

    • NAID

      120006358788

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structure, dynamics and interaction of p54nrb/NonO RRM1 with 5' Splice Site RNA sequence.2016

    • 著者名/発表者名
      Duvignaud JB, Bedard M, Nagata T, Muto Y, Yokoyama S, Gagne; SM, Vincent M
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 0 号: 18 ページ: 0-0

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b01240

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書 2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The binding specificity of translocated in liposarcoma/fused in sarcoma with lncRNA transcribed from the promoter region of cyclin D12016

    • 著者名/発表者名
      Yoneda, R., Suzuki, S., Mashima, T., Kondo, K., Nagata, T., Katahira, M. and Kurokawa, R.
    • 雑誌名

      Cell Biosci.

      巻: 6(4) 号: 1 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1186/s13578-016-0068-8

    • NAID

      120005763383

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse components in solution2016

    • 著者名/発表者名
      Okamura, H., Nishimura, H., Nagata, T., Kigawa, T., Watanabe, T. and Katahira M.
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 6(21742) 号: 1 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1038/srep21742

    • NAID

      120005705947

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of the deamination coupled with sliding along DNA of anti-HIV factor APOBEC3G on the basis of the pH-dependence of deamination revealed by real-time NMR monitoring2016

    • 著者名/発表者名
      Kamba K, Nagata T, Katahira M
    • 雑誌名

      Front. Microbiol.

      巻: 0 ページ: 0-0

    • DOI

      10.3389/fmicb.2016.00587

    • NAID

      120005947002

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] K+-responsive off-to-on switching of hammerhead ribozyme through dual G-quadruplex formation requiring no heating and cooling treatment2015

    • 著者名/発表者名
      Yamaoki Y, Nagata T, Mashima T, Katahira M
    • 雑誌名

      Biochemical and biophysical research communications

      巻: 468(1-2) 号: 1-2 ページ: 27-31

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2015.10.173

    • NAID

      120005712951

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] リグノセルロースの糖-リグニン複合体とその酵素反応の解析2017

    • 著者名/発表者名
      西村 裕志,左近 静香, Jenny Arnling Baath, Amanda Ristinmaa, Johanna Nilsson, Gunnar Westman, Lisbeth Olsson, 永田 一真, 永田 崇, 片平 正人, 渡辺 隆司
    • 学会等名
      第67回日本木材学会大会
    • 発表場所
      九州大学(福岡市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 安定同位体標識法を用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとリグニン間相互作用のNMRによる解析2017

    • 著者名/発表者名
      徳永有希、大城理志、永田崇、近藤敬子、西村裕志、片平正人、渡辺隆司
    • 学会等名
      第67回日本木材学会大会
    • 発表場所
      九州大学(福岡市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of Glutathione-Dependent Enzymes from White Rot Fungi2017

    • 著者名/発表者名
      Wan Hasnidah Wan Osman, Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
    • 学会等名
      日本農芸化学会2017年度京都大会
    • 発表場所
      ウェスティン都ホテル京都(京都市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Heterologous expression of the ligninolytic enzymes from wood rotting fungi and analysis of peroxidase activity, lignin model degradation, and homologous modeling2017

    • 著者名/発表者名
      Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
    • 学会等名
      日本農芸化学会2017年度京都大会
    • 発表場所
      ウェスティン都ホテル京都(京都市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of the deamination activity of APOBEC3B by real-time NMR, which is distinct from that of APOBEC3G2017

    • 著者名/発表者名
      Li Wan, Takashi Nagata, Ryo Morishita, Akifumi Takaori-Kondo, Masato Katahira
    • 学会等名
      7th Asia-Pacific NMR Symposium
    • 発表場所
      Indian Institute of Science (Bangalore)
    • 年月日
      2017-02-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Sliding and intersegmental transfer along DNA enhance the enzymatic activity of APOBEC3G as revealed by real-time NMR monitoring methods2017

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Kamba, Takashi Nagata, Masato Katahira
    • 学会等名
      7th Asia-Pacific NMR Symposium
    • 発表場所
      Indian Institute of Science (Bangalore)
    • 年月日
      2017-02-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] リアルタイムNMRモニタリング法による酵素反応の定量解析及びヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化機構の解明2017

    • 著者名/発表者名
      神庭圭佑、永田崇、片平正人
    • 学会等名
      定量生物学の会年会
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(岡崎)
    • 年月日
      2017-01-05
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] NMR study for the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS, a key regulator of the transcriptional repression by cyclin D1 and telomere2017

    • 著者名/発表者名
      K. Kondo, T. Mashima, T. Oyoshi, R. Yoneda, R. Kurokawa, T. Nagata, M. Katahira
    • 学会等名
      International Symposium for NMR of Nucleic Acids
    • 発表場所
      Gyeongsang National Univ. (Korea)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of K+-responsive RNA aptamer and ribozyme, and in-cell NMR of nucleic acids in human cells2017

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamaoki, A. Kiyoishi, T. Mashima, F. Kano, M. Murata, T. Nagata, M. Katahira
    • 学会等名
      International Symposium for NMR of Nucleic Acids
    • 発表場所
      Gyeongsang National Univ. (Korea)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] プリオンタンパク質とプリオンタンパク質を標的とするRNA分子のAβ線維化への影響2016

    • 著者名/発表者名
      飯田 真美子, 真嶋 司, 山置 佑大, 永田 崇, 片平正人
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] スライディングとストランド間移動を用いたヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの高効率なDNA配列探索:実時間NMRによる新知見2016

    • 著者名/発表者名
      神庭 圭佑、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 非コードRNAと結合してcyclin D1転写を抑制するTLS/FUSのRNA認識機構の構造学的基盤2016

    • 著者名/発表者名
      真嶋司, 小澤 駿介, 近藤 敬子, Nesreen Hamad, 米田竜馬, 黒川 理樹, 永田崇, 片平 正人
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      シフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of the deamination activity of APOBEC3B by real-time NMR, which is distinct from that of APOBEC3G2016

    • 著者名/発表者名
      Li Wan, Takashi Nagata, Ryo Morishita, Akifumi Takaori-Kondo, Masato Katahira
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 深層学習に支援されたNMRシグナルの自動解析2016

    • 著者名/発表者名
      小林直宏、服部良一、永田崇、児嶋長次郎、藤原敏道
    • 学会等名
      第55回NMR討論会
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島市)
    • 年月日
      2016-11-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Cyclin D1遺伝子転写制御やテロメア長制御に関わるTLS/FUSタンパク質と非コード核酸間の相互作用のNMR法による解析2016

    • 著者名/発表者名
      近藤 敬子, 真嶋 司, 大吉 崇文, 米田 竜馬, 黒川 理樹, 永田 崇, 片平 正人
    • 学会等名
      第55回NMR討論会
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島市)
    • 年月日
      2016-11-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 木質バイオマスにおける超分子構造とステレオ選択的な酵素反応及び核酸のin-cell NMR2016

    • 著者名/発表者名
      山置佑大,永田一真、清石彩華、西村裕志、加納ふみ、村田昌之、大田ゆかり、渡辺隆司、永田崇、片平正人
    • 学会等名
      第55回NMR討論会
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島市)
    • 年月日
      2016-11-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Heterologous expression and structure-activity relationship analysis of the oxidative enzymes from wood rotting fungi that are involved in lignocellulose degradation2016

    • 著者名/発表者名
      Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
    • 学会等名
      第61回リグニン討論会
    • 発表場所
      京都大学(宇治市)
    • 年月日
      2016-10-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] リグノセルロースバイオリファイナリーのためのリグニン・ペプチド間相互作用解析2016

    • 著者名/発表者名
      山口亜佐子、末富高志、大城理志、徳永有希、西村裕志、永田崇、真嶋司、 片平正人、磯﨑勝弘、高谷光、中村正治、渡辺隆司
    • 学会等名
      第61回リグニン討論会
    • 発表場所
      京都大学(宇治市)
    • 年月日
      2016-10-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 海洋性細菌に由来するリグニンβ-O-4還元開裂酵素GST4の解析2016

    • 著者名/発表者名
      嶋根康弘、前田亜鈴悠、塩谷美夏、黒澤佳奈子、市川淳子、 布浦拓郎、山置佑大、永田崇、片平正人、高谷光、 吉田亮太、中村正治、渡辺隆司、大田ゆかり
    • 学会等名
      第61回リグニン討論会
    • 発表場所
      京都大学(宇治市)
    • 年月日
      2016-10-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Investigation of the interactions between eukaryotic initiation factors implicated during ribosomal scanning and start codon recognition2016

    • 著者名/発表者名
      Takashi Nagata
    • 学会等名
      The 42nd Naito Conference on “In the Vanguard of Structural Biology: Revolutionizing Life Sciences”
    • 発表場所
      シャトレーゼカトーキングダム(札幌市)
    • 年月日
      2016-10-04
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Non-coding RNA/DNA recognition by TLS/FUS that causes repression of cyclin D1 transcription and telomere elongation2016

    • 著者名/発表者名
      Kondo, K., Mashima, T., Oyoshi, T., Yoneda, R., Kurokawa, R., Nagata, T. and Katahira, M.
    • 学会等名
      The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      熊本大学(熊本市)
    • 年月日
      2016-09-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Invention of K+-responsive Tat-binding RNA aptamer and hammerhead ribozyme, and in-cell NMR of nucleic acids2016

    • 著者名/発表者名
      Yudai Yamaoki, Ayaka Kiyoishi, Tsukasa Mashima, Fumi Kano, Masayuki Murata, Takashi Nagata, Masato Katahira
    • 学会等名
      The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      熊本大学(熊本市)
    • 年月日
      2016-09-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] カリウムイオン応答性Tat結合RNAアプタマーおよびハンマーヘッドリボザイムの創製およびin-cell NMR法による細胞内核酸の観測2016

    • 著者名/発表者名
      山置 佑大, 清石 彩華, 真嶋 司, 加納 ふみ, 村田 昌之, 永田 崇, 片平 正人
    • 学会等名
      第10回バイオ関連化学シンポジウム、第31回生体機能関連化学シンポジウム、第19回バイオテクノロジー部会シンポジウム
    • 発表場所
      石川県立音楽堂(金沢市)
    • 年月日
      2016-09-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Development of artificial RNA and artificial peptide to control gene expression by using NMR2016

    • 著者名/発表者名
      Yumi Takeda, Takashi Nagata, Ryo Amano, Yusuke Nomura, Kazuo Harada, Colin A. Smith, Masato Katahira, Taiichi Sakamoto
    • 学会等名
      The 7th International Symposium of Advanced Energy Science
    • 発表場所
      京都大学(宇治市)
    • 年月日
      2016-09-05
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Low-cost degradation of azo dyes using the GRP-tagged azoreductase combined with NADPH regeneration enzymes immobilized on the curdlan sheet2016

    • 著者名/発表者名
      Masataka Horiuchi, Yasuhiko Suzuki, Masanori Ochiai, Takashi Nagata, Masato Katahira
    • 学会等名
      The 7th International Symposium of Advanced Energy Science
    • 発表場所
      京都大学(宇治市)
    • 年月日
      2016-09-05
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural study of RNA aptamer and peptide that potently perturb the function of intrinsically disordered proteins related to disease2016

    • 著者名/発表者名
      Takashi Nagata
    • 学会等名
      The 5th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • 発表場所
      理化学研究所横浜キャンパス(横浜市)
    • 年月日
      2016-08-29
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse compounds, and real-time monitoring of enzymatic reaction2016

    • 著者名/発表者名
      Okamura, H., Kamba, K., Nishimura, H., Kigawa, T., Watanabe, T., Nagata, T., Katahira, M.
    • 学会等名
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2016-08-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] K+-responsive Activation of Ribozyme System via Structural Transition from Duplex to Dual-quadruplex Requiring no Heating and Cooling Treatment2016

    • 著者名/発表者名
      Yudai Yamaoki, Takashi Nagata, Tsukasa Mashima, Masato Katahira
    • 学会等名
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2016-08-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] NMR analysis of the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS which causes transcriptional repression of cyclin D1 and telomere shortening2016

    • 著者名/発表者名
      Tsukasa Mashima, Keiko Kondo, Takanori Oyoshi, Ryoma Yoneda, Riki Kurokawa, Takashi Nagata, Masato Katahira
    • 学会等名
      The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2016-06-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Binding properties of high-affinity RNA aptamers against AML1 Runt domain2016

    • 著者名/発表者名
      Ryo Amano, Kenta Takada, Yoichiro Tanaka, Takashi Nagata, Masato Katahira, Yoshikazu Nakamura, Tomoko Kozu, Taiichi Sakamoto
    • 学会等名
      The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2016-06-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] K+-responsive activation of dual-quadruplex forming ribozyme system requiring no heating and cooling treatment2016

    • 著者名/発表者名
      Yudai Yamaoki, Tsukasa Mashima, Takashi Nagata, Masato Katahira
    • 学会等名
      The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2016-06-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis of molecular interaction of peptides with lignin for lignocellulosic biorefinery2016

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, T., Yamaguchi, A., Oshiro, S., Suetomi, T., Nishimura, H., Nagata, T., Mashima, T., Katahira, M., Isozaki, K., Takaya, H. and Nakamura, M.
    • 学会等名
      4th Symposium on Biotechnology applied to Lignocelluloses
    • 発表場所
      CSIC downtown Campus (Madrid)
    • 年月日
      2016-06-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Cyclin D1転写抑制を担う TLS/FUS タンパク質と非コード RNA の相互作用の NMR 法による解析2016

    • 著者名/発表者名
      真嶋司, 小澤 駿介, 近藤 敬子, 永田崇, 黒川 理樹, 片平 正人
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] プリオン蛋白質とそれを標的とする RNA 分子の A β線維化への影響2016

    • 著者名/発表者名
      飯田 真美子, 真嶋 司, 山置 佑大, 永田 崇, 片平正人
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Binding properties of RNA aptamer against AML1 Runt domain2016

    • 著者名/発表者名
      R. Amano, K. Takada, T. Nagata, Y. Nomura, J. Fukunaga, Y. Tanaka, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu and T. Sakamoto
    • 学会等名
      Aptamer 2016
    • 発表場所
      St Hilda's College (Oxford)
    • 年月日
      2016-04-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Tandem GGA repeat G-quadruplex as an anti-prion protein aptamer and a K+-responsive structural/functional switching device2016

    • 著者名/発表者名
      T. Nagata, T. Mashima, Y. Yamaoki, F. Nishikawa, Y.O. Kamatari, S. Nishikawa, K. Kuwata and M. Katahira
    • 学会等名
      Aptamer 2016
    • 発表場所
      St Hilda's College (Oxford)
    • 年月日
      2016-04-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 転写因子AML1のDNA結合部位を標的とする高親和性RNAアプタマーの開発と解析2016

    • 著者名/発表者名
      天野亮,高田健多,田中陽一郎, 永田崇, 片平正人, 中村義一, 神津知子,坂本泰一
    • 学会等名
      第5回日本生物物理学会関東支部会
    • 発表場所
      桐生地域地場産業振興センター (桐生市)
    • 年月日
      2016-03-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 疾患に関わる天然変性蛋白質の昨日を阻害するRNAアプタマーと高親和性ペプチドのNMRによる構造機能相関解析2016

    • 著者名/発表者名
      永田 崇
    • 学会等名
      第4回ネオバイオ分子研究会
    • 発表場所
      大阪府立大学 (大阪市)
    • 年月日
      2016-01-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Binding properties of RNA aptamer that binds to the transcription factor AML1 Runt domain2016

    • 著者名/発表者名
      R. Amano, K. Takada, Y. Tanaka, T. Nagata, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu and T. Sakamoto
    • 学会等名
      The 8th Takeda Science Foundation Symposium on PharmaSciences
    • 発表場所
      武田薬品研修所 (大阪)
    • 年月日
      2016-01-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] NMR study of RNA aptamer that binds to the transcription factor AML1 Runt domain2016

    • 著者名/発表者名
      T. Sakamoto, R. Amano, Y. Nomura, T. Nagata, M. Katahira, J. Fukunaga, Y. Tanaka, Y. Nakamura and T. Kozu
    • 学会等名
      The 8th Takeda Science Foundation Symposium on PharmaSciences
    • 発表場所
      武田薬品研修所 (大阪)
    • 年月日
      2016-01-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 転写因子AML1 Runt domainを標的とした高親和性RNAアプタマーの特徴2015

    • 著者名/発表者名
      高田健多,天野亮,田中陽一郎,永田崇,片平正人,中村義一,神津知子,坂本泰一
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド (神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of the biocharacteristics of APOBEC3F by real-time NMR2015

    • 著者名/発表者名
      L. Wan,K. Kamba,T. Nagata,M. Katahira
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド (神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Heterologous expression and struature-activity relationship analysis of the oxidative enzymes involved in lignosellulose degradatioin from wood rotting fungi2015

    • 著者名/発表者名
      M. Lin,T. Nagata,B. Mikami,M. Katahira
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド (神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] NMRによる実時間酵素活性アッセイにより抗ウィルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化機構を明らかにする2015

    • 著者名/発表者名
      神庭圭佑,永田崇,片平正人
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド (神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] AML1 (RUNX1)タンパク質のRuntドメインとRNAアプタマーの相互作用のNMR解析2015

    • 著者名/発表者名
      天野亮,高田健多,田中陽一郎,永田崇,片平正人,野村祐介,福永淳一,中村義一,神津知子, 坂本泰一
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第1回年会
    • 発表場所
      京都テルサ (京都市)
    • 年月日
      2015-11-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] リアルタイムNMR法の新たな展開ー抗HIVタンパク質APOBECG3Gの認識ヌクレチド、DNA上のスライディング及びエピジェネクスとの関連に関する新知見ー2015

    • 著者名/発表者名
      神庭圭佑,永田崇,片平正人
    • 学会等名
      第54回NMR討論会
    • 発表場所
      千葉工業大学 (千葉市)
    • 年月日
      2015-11-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 転写因子AML1 Runt domainに結合する高親和性RNAアプタマーのNMR解析2015

    • 著者名/発表者名
      高田健太,天野亮,田中陽一郎,永田崇,片平正人,中村義一,神津知子,坂本泰一
    • 学会等名
      第54回NMR討論会
    • 発表場所
      千葉工業大学 (千葉市)
    • 年月日
      2015-11-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 木質バイオマスの特性を決めるリグニンー多糖結合様式の決定2015

    • 著者名/発表者名
      神谷明宏,西村裕志,永田一真,永田崇,渡辺隆司,片平正人
    • 学会等名
      第54回NMR討論会
    • 発表場所
      千葉工業大学 (千葉市)
    • 年月日
      2015-11-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 海洋性Novosphingubium属細菌に由来するリグニンモデル2量体β-O-4結合開裂酵素群の酵素学的解析2015

    • 著者名/発表者名
      大田ゆかり、黒澤佳奈子、永田崇、片平正人、西村裕志、渡辺隆司、長谷川良一、秦田勇二
    • 学会等名
      第60回リグニン討論会
    • 発表場所
      筑波大学 (筑波市)
    • 年月日
      2015-11-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] NMR study of the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS, a key regulator of cyclin D12015

    • 著者名/発表者名
      Kondo, K., Mashima, T., Oyoshi, T., Kurokawa, R., Nagata, T. and Katahira, M.
    • 学会等名
      The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      イーグレ姫路 (姫路市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Nucleic acid determinants of deamination by human anti-HIV factor, APOBEC3G, as revealed by real-time NMR method2015

    • 著者名/発表者名
      Kamba, K., Nagata, T., and Katahira, M.
    • 学会等名
      The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      イーグレ姫路 (姫路市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 効率よくウイルスDNAに変異を導入するAPOBEC3Gの脱アミノ化機構2015

    • 著者名/発表者名
      神庭 圭佑、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学 (金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 異常型プリオン蛋白質の産生を抑制する四重鎖核酸の構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      真嶋司,西川富美子,鎌足雄司,永田崇,西川諭,桑田一夫,片平正人
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学 (熊本市)
    • 年月日
      2015-09-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] カリウムイオンを認識して活性がスイッテングするTat結合RNAアプタマーおよびハンマーヘッドリボザイムの創製2015

    • 著者名/発表者名
      山置佑大,真嶋司,永田崇,片平正人
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学 (熊本市)
    • 年月日
      2015-09-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Structural and biochemical studies on eIF1 with eIF3c and eIF5; rearrangement of subunit interaction for accurate recognition of AUC start codon2015

    • 著者名/発表者名
      Obayashi, E., Urano, T., Asano, K., Katahira, M., and Nagata, T.
    • 学会等名
      The 6th International Symposium of Advanced Energy Science~Towards the Realization of Zero-Emission Energy~
    • 発表場所
      京都大学 (宇治市)
    • 年月日
      2015-09-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] NMR analyses of RNA-peptide complexes for the development of biomolecules which regulate gene expression2015

    • 著者名/発表者名
      R. Amano, Y. Nomura, T. Nagata, N. Kobayashi, Y. Mori, J. Fukunaga, Y. Tanaka, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu and T. Sakamoto
    • 学会等名
      The 6th International Symposium of Advanced Energy Science~Towards the Realization of Zero-Emission Energy~
    • 発表場所
      京都大学 (宇治市)
    • 年月日
      2015-09-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] New strategy for high-throughput NMR analysis of biomolecules using the NMR database BMRB and tools for automated NMR analysis, MagRO, FLYA and CYANA2015

    • 著者名/発表者名
      N. Kobayashi, M. Yokochi, T. Iwata, BR. Sahoo, T. Nagata, JL. Markley, EL. Ulrich, E. Schmidt, P. Güntert, C. Kojima and T. Fujiwara
    • 学会等名
      International Society of Magnetic Resonance
    • 発表場所
      China Executive Leadership Academy (Shanghai)
    • 年月日
      2015-08-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Real-time NMR methods reveals deamination mechanism by human antiviral factor APOBEC3G2015

    • 著者名/発表者名
      K. Kamba, T. Nagata, M. Katahira
    • 学会等名
      6th Asia-Pacific NMR Symposium
    • 発表場所
      Hong Kong University of Science and Technology (Hong Kong)
    • 年月日
      2015-08-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 転写抑制やテロメア短縮を引き起こすTLS/FUSと長鎖非コードRNAおよびDNA間結合の構造基盤2015

    • 著者名/発表者名
      近藤 敬子、 真嶋 司、大吉 崇文、黒川 理樹、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      RNA meeting 2015
    • 発表場所
      ホテルライフォート札幌 (札幌市)
    • 年月日
      2015-07-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] AML1タンパク質のDNA結合ドメインに対するRNAアプタマーの特性2015

    • 著者名/発表者名
      高田 健多,天野 亮,田中 陽一郎,永田 崇,片平 正人,中村 義一,神津 知子,坂本泰一
    • 学会等名
      RNA meeting 2015
    • 発表場所
      ホテルライフォート札幌 (札幌市)
    • 年月日
      2015-07-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] AML1 タンパク質の Runt ドメインに結合する RNA アプタマーの取得と解析2015

    • 著者名/発表者名
      高田健多,天野亮,田中陽一郎,永田崇,片平正人,中村義一,神津知子, 坂本泰一
    • 学会等名
      平成27年度日本生化学会関東支部例会
    • 発表場所
      新潟日報メディアシップ (新潟市)
    • 年月日
      2015-06-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質の構造、相互作用、酵素反応のNMRによる解析2015

    • 著者名/発表者名
      永田 崇
    • 学会等名
      第56回日本生化学会 中国-四国支部例会
    • 発表場所
      島根大学大学会館 (松江市)
    • 年月日
      2015-05-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2022-01-28  

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