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バクテリア巨大渦状運動の極性形成メカニズム

公募研究

研究領域ゆらぎと構造の協奏:非平衡系における普遍法則の確立
研究課題/領域番号 16H00808
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関学習院大学

研究代表者

西坂 崇之  学習院大学, 理学部, 助教授 (40359112)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2017年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
キーワード滑走運動 / 線毛 / 集団運動 / バイオフィルム / フラボバクテリウム・ジョンソニエ / 渦状運動
研究実績の概要

本課題は申請段階において、フラボバクテリウム・ジョンソニエという一種類の桿菌を研究対象にして開始された。その後の2年間の研究期間において、シネコシスティス、ハロバクテリウム、サーマス・サーモフィラスといったさまざまな研究対象に派生し、その幾つかは既に原著論文として発表されている。
ミキソコッカスのようなバクテリアで見られる、複数の個体の固まりが方向性を持って動くsocial motility(S-motility)は、特徴的な接着装置であるIV型線毛(type IV pili)によって実現される。このpiliのダイナミクスには膜内外のさまざまなタンパク質が関わるものの、個々の役割や詳細な機能については、まだ解明が進んでいないというのが現状である。本課題では、独自の光学顕微鏡を駆使することによって、piliの活性がどのように制御され、そして方向性のある運動を引き起こすのかについて、徹底的な可視化を進めた。
最終年度では、特にサーマス・サーモフィラスをモデル生物とし、1個体の運動を定量的に解析した。走光性という特徴に着目し、変異株を利用しながら制御の仕組みについて調べ、未踏の領域である「トゥイチング運動の制御機構」に関する本質的な知見を得ることができた。また繊維状のタンパク質であるPilAのダイナミクスについては、先行研究においても、実験条件の難しさから可視化は実現されていない。蛍光蛋白や微小粒子などを通じて、PilAの伸長と短縮を画像化し、その動態を直接観察した。

現在までの達成度 (段落)

29年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

29年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 7件、 招待講演 10件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Detailed analyses of stall force generation in Mycoplasma mobile gliding.2018

    • 著者名/発表者名
      Mizutani M, Tulum I, Kinosita Y, Nishizaka T and Miyata M
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 114 号: 6 ページ: 1411-9

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2018.01.029

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Unforeseen swimming and gliding mode of an insect gut symbiont, Burkholderia sp. RPE64, with wrapping of the flagella around its cell body2017

    • 著者名/発表者名
      Kinosita Yoshiaki、Kikuchi Yoshitomo、Mikami Nagisa、Nakane Daisuke、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      The ISME Journal

      巻: 12 号: 3 ページ: 838-848

    • DOI

      10.1038/s41396-017-0010-z

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Asymmetric distribution of type IV pili triggered by directional light in unicellular cyanobacteria2017

    • 著者名/発表者名
      Nakane Daisuke、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 114 号: 25 ページ: 6593-6598

    • DOI

      10.1073/pnas.1702395114

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dissection of the angle of single fluorophore attached to the nucleotide in corkscrewing microtubules2017

    • 著者名/発表者名
      Fujimura, S. Ito, Y. Ikeguchi, M. Adachi, K. Yajima, J. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun

      巻: 485 号: 3 ページ: 614-620

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2017.01.165

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Direct observation of rotation and steps of the archaellum in the swimming halophilic archaeon Halobacterium salinarum2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Y. Uchida, N. Nakane, D. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Nat Microbiol

      巻: 1 号: 11 ページ: 16148-16148

    • DOI

      10.1038/nmicrobiol.2016.148

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] F1-ATPase conformational cycle from simultaneous single-molecule FRET and rotation measurements2016

    • 著者名/発表者名
      Sugawa, M. Okazaki, K. I. Kobayashi, M. Matsui, T. Hummer, G. Masaike, T. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 0 号: 21 ページ: 0-0

    • DOI

      10.1073/pnas.1524720113

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Directed binding of gliding bacterium, Mycoplasma mobile, shown by detachment force and bond lifetime2016

    • 著者名/発表者名
      Tanaka A, Nakane D, Mizutani M, Nishizaka T, Miyata M
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 7 号: 3 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1128/mbio.00455-16

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] アーキアラとIV型線毛のモーターの動態を可視化する2017

    • 著者名/発表者名
      西坂崇之
    • 学会等名
      日本物理学会 第72回年次大会
    • 発表場所
      大阪大学 豊中キャンパス
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Unitary steps of supermolecular motility machineries in gliding bacteria and swimming archaea2017

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Nishizaka
    • 学会等名
      Bacterial Flagella, Injectisomes and Type III Secretion Systems
    • 発表場所
      Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University
    • 年月日
      2017-03-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Development of optical-microscope techniques for single-molecule biophysics and their application to microbiology."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      10th International Conference on Advanced Materials and Devices
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Development of Imaging Techniques to Reveal Singl-Protein Dynamics and their Application to Microbiology."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] “Development of Techniques for Single-Molecule Detection of Protein Conformational Dynamics and Their Application to Microbiology.”2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      The 2nd Korea-Japan Joint Symposium on Single-Molecule Biophysics
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Application of single-molecule techniques to supramolecular machinery in bacteria and archaea."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      The 15th International Conference of “Na,K-ATPases and Related Transport ATPases”
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Unitary steps of supermolecular motility machineries in gliding bacteria and swimming archaea."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      Bacterial Flagella, Injectisomes and Type III Secretion Systems
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural and functional dynamics of nanoscale molecular motors2016

    • 著者名/発表者名
      T. Nishizaka Y. Kinosita T. A. Katoh D. Nakane
    • 学会等名
      31st International Congress on High Speed Imaging and Photonics
    • 発表場所
      Hotel Hankyu Expo Park
    • 年月日
      2016-11-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Visualization of dynamics of motors in archaella and type IV pili system2016

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Nishizaka
    • 学会等名
      Current and Future Perspectives in Active Matter
    • 発表場所
      The University of Tokyo
    • 年月日
      2016-10-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光学顕微鏡技術の新展開:膜超分子モーターへの先進的な応用  シンポジウム「膜タンパク分子作動原理解明の新基軸」2016

    • 著者名/発表者名
      西坂崇之
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス
    • 年月日
      2016-09-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] Handbook of Photonics for Biomedical Engineering2017

    • 著者名/発表者名
      Katoh, T. A. Fujimura, S. Nishizaka, T.
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9789400750531
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2016-04-26   更新日: 2018-12-17  

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