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植物の発生を支えるmicroRNAネットワークの解明

公募研究

研究領域植物発生ロジックの多元的開拓
研究課題/領域番号 16H01229
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

濱田 隆宏  東京大学, 大学院総合文化研究科, 助教 (20452534)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
10,660千円 (直接経費: 8,200千円、間接経費: 2,460千円)
2017年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2016年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
キーワードmicroRNA / ゼニゴケ / シロイヌナズナ / tudor / 植物 / AGO / Tudor / RNA顆粒
研究実績の概要

ゼニゴケmicroRNAに関する研究では、CRISPR/Cas9技術により作出したmicroRNA欠失変異体のうち、杯状体形成に異常が生じるmicroRNA欠失変異体に注目し、その詳細な解析を行った。このmicroRNA欠失変異体は葉状体の成長は正常だが、野生型よりも杯状体形成頻度が低く、まれに形成される杯状体内の無性芽数も極めて少なくなる。そのため、このmicroRNAは杯状体や無性芽の形成に必須ではないが、正常な形成過程に必要な因子であると言える。野生型とmicroRNA欠失変異体のトランスクリプトーム解析を行った結果、microRNA欠失変異体では杯状体形成に関連した特異的なRNA量の変動が認められた。
シロイヌナズナTARPタンパク質に関する研究では、TARP同様のドメイン構造を有するが、これまでに解析してきたTARP1, TARP2とは異なるクレードに属するTARP4, TARP5の解析を行った。変異体の表現型解析では、tarp4/tarp5二重変異体とtarp1/tarp2二重変異体は共に矮性ではあるが、その形態は大きく異なることを明らかにした。さらにsmall RNA解析及びトランスクリプトーム解析の結果、tarp1/tarp2二重変異体で得られていたような特徴的なsmall RNA量の変化やトランスクリプトームの変化が見られなかった。そのためTARP4, TARP5はTARP1, TARP2とは異なる機能を持っていることが示唆された。

現在までの達成度 (段落)

29年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

29年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 2件、 招待講演 4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome.2017

    • 著者名/発表者名
      Bowman J, Kouchi T,..(106名)..Yokoyama R, ..(4名)
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 171 号: 2 ページ: 287-304

    • DOI

      10.1016/j.cell.2017.09.030

    • NAID

      120006353839

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The GYF domain protein PSIG1 dampens the induction of cell death during plant-pathogen interactions2017

    • 著者名/発表者名
      Matsui Hidenori、Nomura Yuko、Egusa Mayumi、Hamada Takahiro、Hyon Gang-Su、Kaminaka Hironori、Watanabe Yuichiro、Ueda Takashi、Trujillo Marco、Shirasu Ken、Nakagami Hirofumi
    • 雑誌名

      PLOS Genet.

      巻: 13 号: 10 ページ: 1-29

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1007037

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Liverwort life cycle and the miRNAs2018

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Tsuzuki, Kazutaka Futagami, Takahiro Hamada, Yuichiro Watanabe
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおけるmiR319の機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      二神和敬、都筑正行、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナにおける新規トランスポゾン抑制因子候補TARP4/5の機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      武井敬仁、塚田道雄、栗原志夫、松井南、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Functional Analysis of miR319 in liverwort, Marchantia polymorpha2017

    • 著者名/発表者名
      Kazutaka Futagami, Masayuki Tsuzuki, Takahiro Hamada, Yuichiro Watanabe
    • 学会等名
      第19回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Analyses of novel tudor-armadilo repeat proteins (TARPs) in Arabidopsis.2017

    • 著者名/発表者名
      Michio Tsukada, Takahito Takei, Yuichiro Watanabe, Takahiro Hamada
    • 学会等名
      THE PLANT EPIGENETICS CONSORTIUM IN JAPAN-SECOND MEETING
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] TARPs regulate developmental gene expression via siRNA-transposon modules2017

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Hamada, Michio Tsukada, Takahito Takei, Masayuki Tsuzuki, Yoichiro Fukao, Yukio Kurihara, Minami Matsui, Kentaro Tamura, Ikuko Hara-Nishimura, Yuichiro Watanabe
    • 学会等名
      Taiwan-Japan Plant Biology 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional Analysis of miR319 In Marchantia polymorpha2017

    • 著者名/発表者名
      Kazutaka Futagami, Masayuki Tsuzuki, Takahiro Hamada, Yuichiro Watanabe
    • 学会等名
      65th NIBB Conference “Renaissance of Marchantia polymorpha ‐the genome and beyond‐
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 植物におけるストレス顆粒形成の観察2016

    • 著者名/発表者名
      矢光真子、福澤麻里奈、周郁文、佐藤繭子、亀井保博、柳川由紀、西村いくこ、豊岡公徳、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • 学会等名
      第1回Biothermology Workshop - 生命システムの熱科学 -
    • 発表場所
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2016-12-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Conditions of Stress Granules Assembly in Hot Spring Alga, Cyanidioschyzon merolae.2016

    • 著者名/発表者名
      周郁文、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      第1回Biothermology Workshop - 生命システムの熱科学 -
    • 発表場所
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2016-12-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 陸上植物に保存されたmicroRNAによる発生制御機構2016

    • 著者名/発表者名
      都筑正行、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      日本植物学会 第80回大会
    • 発表場所
      沖縄カンファレンスセンター(沖縄県宜野湾市)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 免疫電子顕微鏡を用いた植物ストレス顆粒の解析2016

    • 著者名/発表者名
      矢光真子、福澤麻里奈、佐藤繭子、亀井保博、柳川由紀、西村いくこ、豊岡公徳、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • 学会等名
      日本植物学会 第80回大会
    • 発表場所
      沖縄カンファレンスセンター(沖縄県宜野湾市)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] RNA granules network in Arabidopsis2016

    • 著者名/発表者名
      濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      第1回RNA顆粒/RNAタンパク質複合体研究会
    • 発表場所
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2016-07-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] ノンコーディングRNA2016

    • 著者名/発表者名
      都筑正行、濱田隆宏、佐藤豊
    • 総ページ数
      372
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2016-04-26   更新日: 2018-12-17  

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