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植物発生・パターン形成に関する数理的研究

公募研究

研究領域植物発生ロジックの多元的開拓
研究課題/領域番号 16H01248
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関基礎生物学研究所

研究代表者

藤田 浩徳  基礎生物学研究所, 共生システム研究部門, 助教 (10552979)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
2017年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2016年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワード自己組織的パターン形成 / 数理モデル解析 / 植物発生 / 根系構造制御 / パターン形成 / オーキシン / 花芽原基whorlパターン / オーキシン極性輸送 / 葉序パターン / 花原基whorlパターン形成 / ABCモデル / 数理生物 / 数理モデル
研究実績の概要

植物は土壌中に分布する栄養分を効率良く吸収するために、栄養環境に応答してその根系の構造および形態を大きく変化させる。窒素栄養は、植物にとって必須の栄養素の一つであり、根の成長に大きな影響を与える。例えば、側根の成長は低濃度の硝酸で促進されるのに対し、高濃度では抑制される。しかしながら、このような制御機構がどのようにして適応的に形成・進化してきたのかに関しては、現在ほとんど理解が進んでいない。そこで根の形成・維持にかかるcostと窒素栄養の吸収によるbenefitに基づいた適応度に関する数理モデルの構築および解析を行なった。
最初に、吸収された窒素栄養が全てbenefitに反映される場合、窒素栄養は常に根の成長に対して促進的であることが示唆された。この結果は、低濃度の促進効果をうまく説明できるのに対し、高濃度での抑制効果は説明できない。一方で、benefitに上限を導入することによりその両方の効果をうまく説明できる。このことは、高濃度の過剰な窒素栄養は必ずしも植物にとって有用ではないことが、植物の応答において重要であることを示唆している。
次に、モデルを空間的にheterogeneousな条件に対して拡張を行なうことにより、不均一な窒素栄養に対する植物の応答機構の理解を試みた。モデル解析により、高濃度窒素条件において、systemic(全身的)制御が必要となり、これは根の成長に対し常に抑制的に働くことが示唆された。このモデル予測は、シロイヌナズナ用いたsplit-root実験により支持された。またモデルにより、窒素栄養が空間的に局在するほど、根の成長は促進されることが予測され、この予測も実験的検証により支持された。これらの数理モデル解析の結果は、高濃度窒素によって誘導されるsystemicな制御機構は、過剰な窒素栄養に対する適応として進化してきたことを示唆している。

現在までの達成度 (段落)

平成29年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成29年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Spatial regularity control of phyllotaxis pattern generated by the mutual interaction between auxin and PIN12018

    • 著者名/発表者名
      Hironori Fujita, Masayoshi Kawaguchi
    • 雑誌名

      PLoS Computational Biology

      巻: 14(4) 号: 4 ページ: e1006065-e1006065

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1006065

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 窒素栄養による根系制御の数理モデル解析とその実験的検証2019

    • 著者名/発表者名
      藤田浩徳,栂根美佳,川口正代司
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 窒素栄養による根の成長制御の数理モデル解析と実験的検証2018

    • 著者名/発表者名
      栂根美佳,川口正代司,藤田浩徳
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 植物パターン形成の数理モデル解析:実験と数理の共同研究とその周辺2018

    • 著者名/発表者名
      藤田浩徳
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Auxin-PIN1相互制御による葉序パターンの空間的規則性の制御2018

    • 著者名/発表者名
      藤田浩徳,川口正代司
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] オーキシンパターン形成の数理的解析2017

    • 著者名/発表者名
      藤田浩徳,川口正代司
    • 学会等名
      日本植物学会第81回大会
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Auxin-PIN1相互制御による葉序パターンの空間的規則性の制御2017

    • 著者名/発表者名
      藤田浩徳,川口正代司
    • 学会等名
      第27回日本数理生物学会
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] 葉序の規則的パターン形成において新規拡散性因子の存在を予測

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/press/2018/04/04.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
  • [備考] 植物数理モデリング

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/miyakohp/asari/htdocs/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2016-04-26   更新日: 2019-12-27  

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