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準素イデアル分解を用いた疎性へのアプローチ

公募研究

研究領域スパースモデリングの深化と高次元データ駆動科学の創成
研究課題/領域番号 16H01556
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関関西学院大学

研究代表者

三浦 佳二  関西学院大学, 理工学部, 准教授 (60520096)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2017年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2016年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードスパース・モデリング / 準素イデアル分解 / グレブナー基底 / 神経科学 / 多細胞同時記録 / 応用数学 / 生体生命情報学
研究実績の概要

本研究課題においては、解を満たす入出力関係の方程式を求めることに役立つという代数幾何学の強みを活かして、最も疎な回帰式を求める形での応用を目指した。特に、準素イデアル分解によって、与えられた入出力パターンのデータをすべて満たす(無限個ある) 多項式の中から、変数の数が最少であるものを求める手法を開発し、実データへと応用することを目指した。前年度までの研究においては特に、準素イデアル分解のアルゴリズムを実装する事に重点を置き、大規模データに適用できるようにするためにスピードアップのための改良を行った。これにより、典型的な生命系実験室で得られる規模の現実的なデータ(100x100程度)に対して適用できるプログラムが開発できた。また、もう一つの研究の柱としているニューラル・リングを用いたデータ解析法のプログラム開発も完了した。そこで、実データへの本格的な応用が次の課題となった。
本年度における研究においては、ショウジョウバエの脳の嗅覚系の神経細胞の電気活動パターンから行動を予測する、という試みを行った。そして例えば、「行動(y)の説明のためには、いかなる非線形関係式を用いたとしても、神経細胞群の活動(x)から最低でも6変数以上はどうしても必要である」と言った型の結論を導くのに適したデータ解析手法であることを明らかとした。また、ニューラル・リングの実データへの応用として、脳の自発活動は実は細胞数よりもずっと少ない低次元で説明ができそうと言われているが、その次元を推定する事に使えることを示した。例えば、ラットの脳の海馬の神経細胞の自発活動を説明するには最低でも3つのパラメタが必要、と言った型の結論が導けるデータ解析手法であることを示した。

現在までの達成度 (段落)

29年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

29年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (34件)

すべて 2018 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 10件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] Harvard University(米国)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Ehrhart series of fractional stable set polytopes of finite graphs2018

    • 著者名/発表者名
      Ginji Hamano, Takayuki Hibi, Hidefumi Ohsugi
    • 雑誌名

      Annals of Combinatorics

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sparse Parallel Algorithms for Recognizing Touch Topology on Curved Interactive Screens2017

    • 著者名/発表者名
      Keiji Miura, Kazuki Nakada
    • 雑誌名

      IEEE Access

      巻: 5 ページ: 14889-14897

    • DOI

      10.1109/access.2017.2733722

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A Grobner basis characterization for chordal comparability graphs2017

    • 著者名/発表者名
      Hidefumi Ohsugi, Takayuki Hibi
    • 雑誌名

      European Journal of Combinatorics

      巻: 59 ページ: 122-128

    • DOI

      10.1016/j.ejc.2016.08.004

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] パルス結合磁性体発振素子アレイとニューロモルフィックコンピューティングへの応用2017

    • 著者名/発表者名
      中田 一紀, 三浦 佳二
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報

      巻: 116 ページ: 37-42

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] 位相幾何学的アプローチに基づく3次元モーションジェスチャーからの特徴抽出2017

    • 著者名/発表者名
      中田 一紀, 三浦 佳二
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報

      巻: 116 ページ: 17-22

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] Dynamical systems design of silicon neurons using phase reduction method2016

    • 著者名/発表者名
      Nakada K., Miura K., and Asai T.
    • 雑誌名

      Nonlinear Theory and Its Applications, IEICE

      巻: 7 号: 2 ページ: 95-109

    • DOI

      10.1587/nolta.7.95

    • NAID

      130005142595

    • ISSN
      2185-4106
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Pulse-Coupled Spin Torque Nano Oscillators with Dynamic Synapses for Neuromorphic Computing2016

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Nakada, Keiji Miura
    • 雑誌名

      Nanotechnology (IEEE-NANO), 2016 IEEE 16th International Conference on

      巻: - ページ: 397-400

    • DOI

      10.1109/nano.2016.7751403

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 位相幾何学的アプローチに基づくネットワークセンシングとその応用2016

    • 著者名/発表者名
      中田 一紀, 三浦 佳二
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報

      巻: 116 ページ: 47-52

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] リズム運動における位相リセット制御機構の数理解析2018

    • 著者名/発表者名
      中田一紀, 三浦佳二
    • 学会等名
      電子情報通信学会 システム数理と応用研究会(MSS)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Binarization of Spontaneous Neural Activities for Neural Ring Analysis2018

    • 著者名/発表者名
      Keiji Miura
    • 学会等名
      2018 SIAM Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 有性生物の家系図ネットワークの粗視化2017

    • 著者名/発表者名
      伏尾佳悟, 三浦佳二, 水口毅
    • 学会等名
      日本物理学会 第72回年次大会
    • 発表場所
      大阪大学 豊中キャンパス(大阪府・豊中市)
    • 年月日
      2017-03-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 位相幾何学的アプローチに基づく3次元モーションジェスチャーからの特徴抽出2017

    • 著者名/発表者名
      中田一紀, 三浦佳二
    • 学会等名
      電子情報通信学会 MSS研究会
    • 発表場所
      島根大学(島根県・松江市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] パルス結合磁性体発振素子アレイとニューロモルフィックコンピューティングへの応用2017

    • 著者名/発表者名
      中田一紀, 三浦佳二
    • 学会等名
      電子情報通信学会 NC/NLP研究会
    • 発表場所
      北九州学術研究都市 産学連携センター(福岡県・北九州市)
    • 年月日
      2017-01-26
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 準素イデアル分解を用いた疎性へのアプローチ2017

    • 著者名/発表者名
      三浦佳二
    • 学会等名
      「疎性モデリング」第五回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] A Topology-based Approach for Feature Extraction from 3D Motion Gesture2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Nakada, Keiji Miura
    • 学会等名
      IEEE IWCIA 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] An array of pulse-coupled spin torque nano oscillators for neuromorphic computing2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Nakada, Keiji Miura
    • 学会等名
      日本神経回路学会第27回全国大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Sparse estimation of neural circuits for internal rewards2017

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Nakamura, Ju Tian, Naoshige Uchida, Mitsuko Watabe-Uchida, Keiji Miura
    • 学会等名
      International Meeting on “High-Dimensional Data-Driven Science” (HD3-2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Topological data analysis of across-sniff habituation in olfactory cortex2017

    • 著者名/発表者名
      Yuki Usui, Ayaka Onishi, Keiji Miura
    • 学会等名
      International Meeting on “High-Dimensional Data-Driven Science” (HD3-2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Predicting Drosophila behavior from a small number of neuron types2017

    • 著者名/発表者名
      Takuya Hiroshima, Laurent Badel, Hokto Kazama, Keiji Miura
    • 学会等名
      International Meeting on “High-Dimensional Data-Driven Science” (HD3-2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 準素イデアル分解を用いた疎性へのアプローチ2017

    • 著者名/発表者名
      三浦佳二
    • 学会等名
      水戸数学・情報数理研究会2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Binarization of Spontaneous Neural Activities for Neural Ring Analysis2017

    • 著者名/発表者名
      Momoka Tsuru, Keiji Miura
    • 学会等名
      Applied Algebraic Topology 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 異なる機構を持つ同期発火の視覚刺激判別への影響2017

    • 著者名/発表者名
      高橋利幸, 圓山由子, 伊藤浩之, 三浦佳二
    • 学会等名
      第40回日本神経科学大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 嗅球における発達時の回路再編の前後で起こる同期性の変化2017

    • 著者名/発表者名
      寺田悠亮, 藤本聡志, 今井猛, 三浦佳二
    • 学会等名
      第40回日本神経科学大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Selecting Minimum Explaining Variables by Pruned Primary Ideal Decomposition with Recursive Calls2017

    • 著者名/発表者名
      Keiji Miura
    • 学会等名
      2017 SIAM Conference on Industrial and Applied Geometry (GD17)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 準素イデアル分解を用いた疎性へのアプローチ2017

    • 著者名/発表者名
      三浦佳二
    • 学会等名
      新学術スパースモデリング領域 2017年度第1回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 位相幾何学的アプローチに基づく3次元モーションジェスチャーからの特徴抽出とそのシステム実装2017

    • 著者名/発表者名
      中田一紀, 三浦佳二
    • 学会等名
      LSIとシステムのワークショップ2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 再帰呼出による非線形関係の最少説明変数選択2016

    • 著者名/発表者名
      三浦佳二
    • 学会等名
      科学研究費補助金新学術領域研究「スパースモデリングの深化と高次元データ駆動科学の創成」 2016 年度公開シンポジウム
    • 発表場所
      慶應義塾大学三田キャンパス(東京都・港区)
    • 年月日
      2016-12-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Pulse-Coupled Spin Torque Nano Oscillators with Dynamic Synapses for Neuromorphic Computing2016

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Nakada, Keiji Miura
    • 学会等名
      IEEE NANO 2016
    • 発表場所
      仙台国際センター(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2016-08-23
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 位相幾何学的アプローチに基づくネットワークセンシングとその応用2016

    • 著者名/発表者名
      中田 一紀, 三浦 佳二
    • 学会等名
      電子情報通信学会 CCS研究会
    • 発表場所
      余市町中央公民館(北海道・余市町)
    • 年月日
      2016-08-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Real-Time Computing of Touch Topology via Poincare-Hopf Index2016

    • 著者名/発表者名
      Keiji Miura, Kazuki Nakada
    • 学会等名
      SIAM Annual Meeting 2016
    • 発表場所
      Boston (USA)
    • 年月日
      2016-07-11
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] パルス結合磁性体発振素子アレイの位相縮約法による解析2016

    • 著者名/発表者名
      中田一紀, 三浦佳二
    • 学会等名
      2016年 電子情報通信学会 NOLTAソサイエティ大会
    • 発表場所
      東京理科大学葛飾キャンパス(東京都・葛飾区)
    • 年月日
      2016-06-12
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] パルス結合磁性体発振素子アレイのダイナミクスとニューロモルフィックコンピューティングへの応用2016

    • 著者名/発表者名
      中田一紀, 三浦佳二
    • 学会等名
      LSIとシステムのワークショップ2016
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所(東京都・目黒区)
    • 年月日
      2016-05-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 位相幾何学的アプローチに基づくタッチセンシングアルゴリズムのニューラルアーキテクチャ2016

    • 著者名/発表者名
      三浦佳二, 中田一紀
    • 学会等名
      LSIとシステムのワークショップ2016
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所(東京都・目黒区)
    • 年月日
      2016-05-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2016-04-26   更新日: 2022-02-28  

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