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タイ北部少数民族に見る生業形態と文化・行動様式の集団遺伝学

公募研究

研究領域パレオアジア文化史学ーアジア新人文化形成プロセスの総合的研究
研究課題/領域番号 17H05132
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 人文・社会系
研究機関北里大学

研究代表者

太田 博樹  北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2018年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2017年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードsex-biased migration / 少数民族 / 古人骨 / ゲノム網羅的SNP解析 / 古人骨DNA / 古代ゲノム / 集団遺伝学 / 文化・行動様式 / mtDNA / Y染色体 / 狩猟採集民 / 農耕民 / タイ少数民族 / sex-biased admixture
研究実績の概要

【研究の目的】出アフリカ以降、現生人類は5~7 万年という短かい期間で、世界各地の様々な環境に適応しながら拡散したので、その環境適応は生業形態や文化・行動様式の変化がゲノムの変化より先行した。今回の研究計画では東南アジアの少数民族および古人骨のゲノム解析を実施することにより、生業形態および文化・行動様式が常染色体を含めたゲノムに与える影響を明らかにする。
【研究計画の実施状況】①東南アジア出土古人骨(25検体)と愛知県渥美半島・伊川津貝塚遺跡出土古人骨(IK002)のゲノム配列にもとづく比較解析を行った。その結果、ホアビニアン文化をもっていた東南アジア出土古人骨とIK002の間で高い近縁性が示された。②現在タイ王国に住んでいる焼畑農耕を行っている山岳民族5民族6集団[アカ族、リス族(メイホンソン県)、リス族(チェンライ県)(以上、夫方居住);カヤー族(赤カレン)、カレン族(白カレン)、ラフ族(以上、妻方居住)]に加え、狩猟採取を行っている2民族(ムラブリ、マニ)の計7民族8集団192人について、白血球由来のDNAを用い、Infinium Global Screening Array(Illumina社)によって、約60万SNPのタイピングを行い、集団遺伝学的解析を行った。その結果、焼き畑農耕民は狩猟採集民よりは有効集団サイズ(Ne)が大きいものの、大規模農耕を行う集団や都市部の人々よりNeが小さい傾向が示された。③アゼルバイジャンから出土したホモ・サピエンスの骨試料からのDNA抽出し、次世代シークエンサー(NGS)ライブラリーを作製、イルミナ社MiSeqでシークエンスを行った。その結果、mtDNAハプログループはIと推定された。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 6件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] コペンハーゲン大学(デンマーク)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] The prehistoric peopling of Southeast Asia2018

    • 著者名/発表者名
      Hugh McColl, Fernando Racimo, Lasse Vinner, Fabrice Demeter, Takashi Gakuhari, …, Hajime Ishida, … Eske Willerslev
    • 雑誌名

      Science

      巻: 361(6397) 号: 6397 ページ: 88-92

    • DOI

      10.1126/science.aat3628

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A new targeted capture method using bacterial artificial chromosome (BAC) libraries as baits for sequencing relatively large genes2018

    • 著者名/発表者名
      Kae Koganebuchi, Takashi Gakuhari, Hirohiko Takeshima, Kimitoshi Sato, Kiyotaka Fujii, Toshihiro Kumabe, Satoshi Kasagi, Takehiro Sato, Atsushi Tajima, Hiroki Shibata, Motoyuki Ogawa, Hiroki Oota
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 13 号: 7 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0200170

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Medaka Population Genome Structure and Demographic History Described via Genotyping-by-Sequencing2018

    • 著者名/発表者名
      Katsumura Takafumi、Oda Shoji、Mitani Hiroshi、Oota Hiroki
    • 雑誌名

      G3: GENES, GENOMES, GENETICS

      巻: 9 号: 1 ページ: 217-228

    • DOI

      10.1534/g3.118.200779

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ゲノムデータから人類史を読み解く方法ー何がわかって何はわからないかー2017

    • 著者名/発表者名
      太田博樹
    • 雑誌名

      西洋史研究

      巻: 新輯第46号 ページ: 105-120

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] The Jomon genome and migration of anatomical modern humans to East Asia2019

    • 著者名/発表者名
      H. Oota
    • 学会等名
      Transeurasian millets and beans, language and genes
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 遺伝人類学からみた東アジア・日本列島への人類の拡散2018

    • 著者名/発表者名
      太田博樹
    • 学会等名
      日本旧石器学会第16回大会シンポジウム「日本列島への人類拡散と後期旧石器時代の成立を考える」
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A new targeted-capture method using bacteria artificial chromosome (BAC) as baits exclusively developed for sequencing relatively large loci of ancient DNA2018

    • 著者名/発表者名
      K. Koganebuchi, T. Gakuhari, H. Takeshima, S. Kasagi, T. Sato, A. Tajima, H. Shibata, M. Ogawa, H. Oota
    • 学会等名
      The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The Transition to Farming in Eneolithic (Copper Age) Ukraine was Largely Driven by Population Replacement2018

    • 著者名/発表者名
      R.W. Schmidt, D. Fernandes, J. Karsten, T. Harper, G. Madden, S. Ledogar, M. Sokhatsky, H. Oota, R. Pinhasi
    • 学会等名
      The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Yonda, H. Ishida, Y. Yamada, H. Shibata, S. Nakagome, E. Willerslev, H. Oota Whole genome analysis of the Jomon remain reveals deep lineage of East Eurasian populations2018

    • 著者名/発表者名
      T. Gakuhari, M. Sikora, S. Rasmussen, M. Allentoft, T. Sato, T. Kornrliussen, M. Yonda, H. Ishida, Y. Yamada, H. Shibata, S. Nakagome, E. Willerslev, H. Oota
    • 学会等名
      The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Complex human histories of Northeast Asia revealed by correlaions between genes, language, and music2018

    • 著者名/発表者名
      H. Matsumae, P.E. Savage, B. Bickel, T.E. Currie, T. Sato, A. Tajima, M. Stoneking, K.K. Shimizu, M. Gillan, S. Brown, H. Oota
    • 学会等名
      The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Human population history in the southwestern coastal region of Sea of Okhotsk, inferred from ancient genome analysis2018

    • 著者名/発表者名
      T. Sato, N. Adachi, R. Kimura, M. Yoneda, H. Oota, A. Tajima, A. Toyoda, H. Matsumae, K. Koganebuchi, K.K. Shimizu, T. Hanihara, A. Weber, H. Kato, H. Ishida
    • 学会等名
      The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Is it sex-biased migration/admixture or social selection in population genetic structure in East Asians?2017

    • 著者名/発表者名
      H. Oota
    • 学会等名
      "Culture History of PaleoAsia" International workshop (organized by B02) Theortical Models of Cultural Evolution during Modern Human Dispersals
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] タイ少数民族と古人骨を対象とした生業形態とゲノム多様性に関する研究2017

    • 著者名/発表者名
      太田博樹、石田貴文
    • 学会等名
      第3回パレオアジア文化史研究大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] A trend in recent ancient genome research2017

    • 著者名/発表者名
      H. Oota
    • 学会等名
      パレオアジア B02 第4回班会議@明治大学中野キャンパス
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 東アジア人類集団の遺伝的多様性に与えた影響について2017

    • 著者名/発表者名
      太田博樹、石田貴文
    • 学会等名
      第4回研究大会パレオアジア文化史学
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] アジア旧石器時代人類の形質、遺伝子にみられる地理的変異2017

    • 著者名/発表者名
      澤藤りかい、木村亮介、太田博樹、石田肇
    • 学会等名
      第4回研究大会パレオアジア文化史学
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2019-12-27  

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