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ゲノム編集による異種2次代謝産物生産麹菌の迅速・多重遺伝子操作技術の開発

公募研究

研究領域生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学
研究課題/領域番号 17H05431
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関東京大学

研究代表者

丸山 潤一  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任准教授 (00431833)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円)
2018年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2017年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
キーワード麹菌 / ゲノム編集 / 2次代謝 / 2次代謝
研究実績の概要

麹菌は日本の醸造産業のみならず、異種タンパク質生産の宿主として世界的に利用されている産業的に有用な糸状菌である。さらに最近、異種2次代謝産物生産を目的として国内外で使用されるようになっている。本研究では、研究代表者らが麹菌において確立したゲノム編集技術であるCRISPR/Cas9システムを発展させ、異種2次代謝産物生産の効率化や生産性向上に利用することを目的とした。
平成29年度は、CRISPR/Cas9システムを利用し、複数の遺伝子を単一の株で改変する技術、ならびに2次代謝生合成遺伝子を導入するための技術を開発した。具体的には、ゲノム編集用プラスミドをリサイクリングすることにより、高効率の遺伝子破壊や遺伝子導入を無限に繰り返すことが可能になった。
平成30年度は、異種二次代謝産物生産のモデルとして、7つの生合成遺伝子によって合成される担子菌由来の抗細菌活性をもつジテルペンpleuromutilinの生産を行った。遺伝子導入の標的部位として、分生子の色素合成に関与するwA、硝酸資化に必要なniaD、ウリジン/ウラシル生合成に必要なpyrGの各遺伝子を選択した。麹菌野生株RIB40を宿主として段階的に形質転換を行い、各標的部位の欠失に由来する表現型を指標として株を選択することで、7つのpleuromutilin生合成遺伝子すべてが導入された株を効率的に取得した。得られた株の代謝物において、GC/MS解析によりpleuromutilinの生産が確認され、抗菌活性も検出された。さらに、取得された生産株を用いて、生産性向上のための代謝経路の遺伝子改変を行った。pleuromutilin合成につながるアセチルCoAの供給やエルゴステロール生合成経路について遺伝子改変を行った結果、pleuromutilin生産量の増加が見られた。以上の結果から、ゲノム編集を利用した効率的な遺伝子導入や遺伝子破壊により、麹菌における異種二次代謝産物生産ならびに生産性向上に成功した。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (26件) (うち国際学会 2件、 招待講演 9件) 備考 (2件) 産業財産権 (1件)

  • [国際共同研究] ゲオルク・アウグスト大学ゲッティンゲン(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] アイルランド国立大学メイヌース校(アイルランド)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Inter-strain expression of sequence-diverse HET domain genes severely inhibits growth of Aspergillus oryzae2019

    • 著者名/発表者名
      Noriko Mori、Takuya Katayama、Ryota Saito、Kazuhiro Iwashita、Jun-ichi Maruyama
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Forced Recycling of an AMA1-Based Genome-Editing Plasmid Allows for Efficient Multiple Gene Deletion/Integration in the Industrial Filamentous Fungus Aspergillus oryzae2018

    • 著者名/発表者名
      Katayama Takuya、Nakamura Hidetoshi、Zhang Yue、Pascal Arnaud、Fujii Wataru、Maruyama Jun-ichi
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 85 号: 3

    • DOI

      10.1128/aem.01896-18

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 麹菌の交配育種の開発に向けて―細胞融合能の再発見・不和合性の発見・有性生殖の試み―2018

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 雑誌名

      温故知新

      巻: 55 ページ: 9-16

    • NAID

      40021660891

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] BiFC-based visualisation system reveals cell fusion morphology and heterokaryon incompatibility in the filamentous fungus Aspergillus oryzae2018

    • 著者名/発表者名
      Okabe Tomoya、Katayama Takuya、Mo Taoning、Mori Noriko、Jin Feng Jie、Fujii Ikuo、Iwashita Kazuhiro、Kitamoto Katsuhiko、Maruyama Jun-ichi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 号: 1 ページ: 2922-2922

    • DOI

      10.1038/s41598-018-21323-y

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 麹菌の有性世代の探索・不和合性の発見と交配育種への利用2018

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 雑誌名

      酵母菌・麹菌・乳酸菌の産業応用展開

      巻: - ページ: 120-129

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] 物質生産における麹菌の分子育種とゲノム編集の可能性2018

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 雑誌名

      月刊バイオインダストリー

      巻: 35 ページ: 10-17

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Highly efficient gene targeting in <i>Aspergillus oryzae</i> industrial strains under <i>ligD</i> mutation introduced by genome editing: Strain-specific differences in the effects of deleting EcdR, the negative regulator of sclerotia formation2017

    • 著者名/発表者名
      Hidetoshi Nakamura, Takuya Katayama, Tomoya Okabe, Kazuhiro Iwashita, Wataru Fujii, Katsuhiko Kitamoto, Jun-ichi Maruyama
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 63 号: 3 ページ: 172-178

    • DOI

      10.2323/jgam.2016.10.002

    • NAID

      130005745346

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 発酵・醸造で活躍する微生物の世界─日本の伝統的発酵・醸造に用いられる麹菌の姿と可能性2017

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 雑誌名

      生物の科学 遺伝

      巻: 71 ページ: 200-205

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 糸状菌のゲノム編集~麹菌実用株における高効率で自在な遺伝子改変の実現2019

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 学会等名
      発酵と代謝研究会 平成30年度第2回勉強会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 担子菌がもつセスキテルペン環化酵素の網羅的解析-1-2019

    • 著者名/発表者名
      西下 純平、長嶺 翔太、小崎 拓登、劉 成偉、尾﨑 太郎、丸山 潤一、南 篤志、及川 英秋
    • 学会等名
      日本化学会第99春季年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 担子菌がもつセスキテルペン環化酵素の網羅的解析-2-2019

    • 著者名/発表者名
      長嶺 翔太、西下 純平、劉 成偉、尾﨑 太郎、丸山 潤一、南 篤志、及川 英秋
    • 学会等名
      日本化学会第99春季年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 糸状菌が生産するアントラキノンダイマーの生合成研究-2-2019

    • 著者名/発表者名
      深谷 充功、南 篤志、尾﨑 太郎、劉 成偉、丸山 潤一、及川 英秋
    • 学会等名
      日本化学会第99春季年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集を利用した麹菌Aspergillus oryzaeにおける異種二次代謝産物生産および生産性の向上2019

    • 著者名/発表者名
      齋藤 直也、片山 琢也、南 篤志、及川 英秋、丸山 潤一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 麹菌におけるステロール合成関連遺伝子の破壊によるポリケタイド化合物の増産効果2019

    • 著者名/発表者名
      菅 英一郎、勝山 陽平、丸山 潤一、玉野 孝一、小山 泰二、大西 康夫
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 麹菌Aspergillus oryzaeのもつHETドメイン遺伝子の不和合性における機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      森 法子、片山 琢也、齊藤 亮太、岩下 和裕、丸山 潤一
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術CRISPR/Cas9を用いた糸状菌天然物の異種生産 (2)2019

    • 著者名/発表者名
      曽ケ端 花帆、尾崎 太郎、劉 成偉、丸山 潤一、南 篤志、及川 英秋
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 糸状菌アントラキノン系ポリケタイドの生合成に関わる酵素遺伝子の機能解析-2-2019

    • 著者名/発表者名
      深谷 充功、南 篤志、尾崎 太郎、劉 成偉、丸山 潤一、及川 英秋
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] キノコ由来テルペン系天然物の汎用的な生産法の開発 -1-2019

    • 著者名/発表者名
      劉 成偉、佐藤 芳郎、尾崎 太郎、呉 静、丸山 潤一、南 篤志、河岸 洋和、及川 英秋
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] キノコ由来テルペン系天然物の汎用的な生産法の開発 -2-2019

    • 著者名/発表者名
      西下 純平、長嶺 翔太、小崎 拓登、劉 成偉、尾崎 太郎、丸山 潤一、南 篤志、及川 英秋
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] キノコ由来テルペン系天然物の汎用的な生産法の開発 -3-2019

    • 著者名/発表者名
      長嶺 翔太、西下 純平、劉 成偉、尾﨑 太郎、丸山 潤一、南 篤志、及川 英秋
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集が可能にした麹菌実用株の効率的で自在な遺伝子改変2018

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 学会等名
      糸状菌遺伝子研究会第39回例会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 物質生産宿主・麹菌で自在にかつ無限に遺伝子を改変する~ゲノム編集技術の進展2018

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 学会等名
      日本生物工学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 麹菌Aspergillus oryzaeの不和合性におけるHETドメインタンパク質をコードする遺伝子の機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      森 法子、片山 琢也、齊藤 亮太、岩下 和裕、丸山 潤一
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 麹菌によるクルクミン生産系の構築-SNF1ホモログ遺伝子の破壊によるmalonyl-CoA増産効果-2018

    • 著者名/発表者名
      菅 英一郎、勝山 陽平、丸山 潤一、小山 泰二、大西 康夫
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] CRISPR/Cas9 Systemを用いたcyclochlorotineの生合成研究2018

    • 著者名/発表者名
      叶 英、劉 成偉、尾﨑 太郎、南 篤志、丸山 潤一、及川 英秋
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 糸状菌アントラキノン系ポリケタイドの生合成に関わる酵素遺伝子の機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      深谷 充功、南 篤志、尾﨑 太郎、劉 成緯、丸山 潤一、及川 英秋
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術CRISPR/Cas9を用いた糸状菌天然物の異種生産2018

    • 著者名/発表者名
      佐藤 優哉、瀧野 純矢、椎名 哲也、鵜飼 孝大、南 篤志、尾﨑 太郎、劉 成緯、藤井 勲、丸山 潤一、及川 英秋
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集による麹菌実用株の効率的遺伝子改変2018

    • 著者名/発表者名
      片山 琢也、丸山 潤一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年大会シンポジウム「先進解析技術が拓く糸状菌研究~若手研究者が照らすフロンティア~」
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 麹菌を用いた物質生産における万能な分子育種を目指したゲノム編集技術の確立2018

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年大会シンポジウム「微生物によるものづくりの新展開:小分子から高分子まで自由自在に」
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] CRISPR/Cas9システムを用いた糸状菌由来天然物の異種生産2018

    • 著者名/発表者名
      佐藤 優哉、瀧野 純矢、椎名 哲也、鵜飼 孝大、南 篤志、尾﨑 太郎、劉 成偉、藤井 勲、丸山 潤一、及川 英秋
    • 学会等名
      日本化学会第98春季年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Development of a highly efficient genetic engineering technique using the CRISPR/Cas9 genome editing system in the industrial filamentous fungus Aspergillus oryzae2017

    • 著者名/発表者名
      Takuya Katayama, Yuki Tanaka, Tomoya Okabe, Hidetoshi Nakamura, Wataru Fujii, Katsuhiko Kitamoto, Jun-ichi Maruyama
    • 学会等名
      IUMS 2017 SINGAPORE, 15th International Congress of Mycology and Eukaryotic Microbiology
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ゲノム編集による異種2次代謝産物生産麹菌の迅速・多重遺伝子操作技術の開発2017

    • 著者名/発表者名
      丸山 潤一
    • 学会等名
      新学術領域研究「生合成リデザイン」第二回 公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of a highly efficient multiplex mutagenesis technique by the CRISPR/Cas9 genome editing system in the industrial filamentous fungus Aspergillus oryzae2017

    • 著者名/発表者名
      Takuya Katayama, Yuki Tanaka, Tomoya Okabe, Hidetoshi Nakamura, Wataru Fujii, Katsuhiko Kitamoto, Jun-ichi Maruyama
    • 学会等名
      12th International Fungal Biology Conference
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 麹菌実用株の分子育種を可能にする―CRISPR/Cas9システムによるゲノム編集2017

    • 著者名/発表者名
      片山 琢也、丸山 潤一
    • 学会等名
      日本生物工学会2017年大会シンポジウム「発酵醸造微生物育種の新発想アプローチ」
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 東京大学大学院農学生命科学研究科 醸造微生物学(キッコーマン)寄付講座ホームページ

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/Brew-Microbio/

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 東京大学大学院農学生命科学研究科 応用生命工学専攻 醸造微生物学(キッコーマン)寄付講座ホームページ

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/Brew-Microbio/index.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [産業財産権] 糸状菌におけるゲノム編集を用いる多段階による多重変異株の製造方法2017

    • 発明者名
      丸山 潤一、片山 琢也
    • 権利者名
      丸山 潤一、片山 琢也
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

URL: 

公開日: 2017-04-28   更新日: 2019-12-27  

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