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葉緑体遺伝を御する

公募研究

研究領域植物新種誕生の原理―生殖過程の鍵と鍵穴の分子実態解明を通じて―
研究課題/領域番号 17H05840
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関京都大学

研究代表者

西村 芳樹  京都大学, 理学研究科, 助教 (70444099)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
15,470千円 (直接経費: 11,900千円、間接経費: 3,570千円)
2018年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
2017年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
キーワード葉緑体DNA / ミトコンドリアDNA / 母性遺伝 / 葉緑体 / 進化 / 相同組換え / 緑藻クラミドモナス / 植物 / 遺伝学
研究実績の概要

生殖をめぐる多様な現象群のうち、未だその分子機構や進化的意義が分からないものの一つに「葉緑体やミトコンドリアDNAの母性遺伝」がある。母性遺伝とは、葉緑体やミトコンドリアが持つDNAが母親のみから子孫に伝えられる現象のことであり、ヒトを含む動物から菌類、藻類、植物に至る幅広い生物種において普遍的に観察される。母性遺伝は、雌と雄由来の葉緑体/ミトコンドリアDNAを明確に識別し、片方のみを排除することで実現すると考えられているが、そのメカニズムは現在活発な議論の対象となっている。
本研究では緑藻クラミドモナス、担子菌類クリプトコッカスをモデルとして、葉緑体とミトコンドリアDNAの片親遺伝のメカニズムを探った。緑藻クラミドモナスでは、接合子成熟の鍵制御因子であるGSP1が欠損すると葉緑体母性遺伝が完全に停止する。GSP1欠損変異体をもちいたRNAseq解析から、接合子においてGSP1によって活性化されるRecAに注目し、その欠損株における母性遺伝を解析したところ、約10ー20%の接合子において父性遺伝が観察された。父性遺伝の原因を探るべく、RecA欠損変異体における接合後の各段階における葉緑体DNAの変化を追跡した。接合子における雄葉緑体核様体の消失現象は正常に観察されていたのに対し、接合胞子が減数分裂をおこなって栄養細胞にある段階で起きる雌葉緑体DNAの複製に異常が観察されたことから、RecAは雌葉緑体DNAの複製を促進することにより、葉緑体DNAの母性遺伝を保障している可能性が示された。一方クリプトコッカスにおいて、ミトコンドリア核様体の可視化に成功し、その挙動を観察したところ、雄由来のミトコンドリア核様体が選択的に消失し、核様体を失ったミトコンドリアはオートファジーによって除去されることが明らかになった。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (27件) (うち国際学会 4件、 招待講演 6件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Step-wise elimination of α-mitochondrial nucleoids and mitochondrial structure as a basis for the strict uniparental inheritance in Cryptococcus neoformans2020

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Yoshiki、Shikanai Toshiharu、Kawamoto Susumu、Toh-e Akio
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 2468-2468

    • DOI

      10.1038/s41598-020-59277-9

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of Chlamydomonas autophagy-related mutants in nutrient-deficient conditions.2018

    • 著者名/発表者名
      Kajikawa, M., Yamauchi, M., Shinkawa, H., Tanaka, M., Hatano, K., Nishimura, Y., Kato, M., Fukuzawa, H.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiology

      巻: 60 号: 1 ページ: 126-138

    • DOI

      10.1093/pcp/pcy193

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Chloroplast nucleoids as a transformable network revealed by live imaging with a microfluidic device2018

    • 著者名/発表者名
      Kamimura Yoshitaka、Tanaka Hitomi、Kobayashi Yusuke、Shikanai Toshiharu、Nishimura Yoshiki
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 1:47 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/s42003-018-0055-1

    • NAID

      120006469191

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 葉緑体核様体の形態・分配を保障するHollidayジャンクション切断酵素の発見2018

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi Yusuke、Misumi Osami、Nishimura Yoshiki
    • 雑誌名

      PLANT MORPHOLOGY

      巻: 30 号: 1 ページ: 73-81

    • DOI

      10.5685/plmorphol.30.73

    • NAID

      130007622405

    • ISSN
      0918-9726, 1884-4154
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 葉緑体DNAの分配を司るホリデイジャンクション解離酵素の発見2018

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 76(5) ページ: 404-404

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] 葉緑体核様体の進化と構造のダイナミクス2018

    • 著者名/発表者名
      小林優介、三角修己、西村芳樹
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 56(10) ページ: 651-658

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] ゲノム編集の時代における「緑の酵母」クラミドモナスの復権2018

    • 著者名/発表者名
      浜地貴志・西村芳樹
    • 雑誌名

      生物工学

      巻: 96(8) ページ: 475-475

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体核様体分裂のダイナミズム2020

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹、小林優介、三角修己
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] HMGタンパク質がクラミドモナスの葉緑体DNA凝集をコントロールする2020

    • 著者名/発表者名
      田草川真理, 浜地貴志, 深尾陽一郎,日高久美, 小林優介,遠藤政幸, 杉山弘, 鹿内利治, 西村芳樹
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 緑色植物進化における葉緑体DNAリガーゼのバクテリア型から真核生物型への機能移譲2019

    • 著者名/発表者名
      浜地貴志
    • 学会等名
      第15回京大植物縦横無尽の会ワークショップ
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 葉緑体核様体構造タンパク質と母性遺伝の関連性の発見2019

    • 著者名/発表者名
      田草川真理, 浜地貴志, 日高久美, 遠藤政幸, 杉山弘, 鹿内利治, 西村芳樹.
    • 学会等名
      第14回植物縦横無尽の会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体核様体の新奇光応答反応~光分散・暗集合反応~2019

    • 著者名/発表者名
      石原静圭、坂下幸汰、石田悠介、木森義隆、西村芳樹、小林優介、西村いくこ、岩渕功誠
    • 学会等名
      第8回近畿植物学会講演会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] オートファジーに依存した緑藻Chlamydomonas reinhardtiiの生存と油脂蓄積2019

    • 著者名/発表者名
      梶川昌孝、山内万里花、新川はるか、田中学、幡野恭子、西村芳樹、加藤美砂子、福澤秀哉
    • 学会等名
      2019年度藻類談話会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体の「染色体」が魅せるダイナミズム2019

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹
    • 学会等名
      第9回 機能制御学セミナー/第4回 新領域開拓セミナー
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] HMG1 has common domain structure to major mitochondrial nucleoid protein and controls the level of cpDNA compaction in Chlamydomonas reinhardtii2019

    • 著者名/発表者名
      Mari Takusagawa, Takashi Hamaji, Kumi Hidaka, Masayuki Endo, Hiroshi Sugiyama, Toshiharu Shikanai and Yoshiki Nishimura
    • 学会等名
      Japan-US binational meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Bacterial-to-eukaryotic takeover of chloroplast DNA ligase function in land plants.2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Hamaji, Yusuke Kobayashi, Shohei Yamaoka, Toshiharu Shikanai, Yoshiki Nishimura
    • 学会等名
      Marchantia Workshop 2019
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 葉緑体局在型DNAリガーゼの同定とその欠損株における葉緑体核様体異常2019

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹、小林優介、 浜地貴志、松尾拓哉、鹿内利治
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 緑色植物における葉緑体DNAリガーゼのバクテリア型から真核生物型への機能移譲2019

    • 著者名/発表者名
      浜地貴志, 小林優介, 山岡尚平, 鹿内利治, 西村芳樹
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体核様体のかたちを司るDNAリガーゼの同定2019

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹、小林優介、 浜地貴志、松尾拓哉、鹿内利治
    • 学会等名
      第13回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 緑色植物進化における葉緑体DNAリガーゼのバクテリア型から真核生物型への機能移譲2019

    • 著者名/発表者名
      浜地貴志, 小林優介, 山岡尚平, 鹿内利治, 西村芳樹
    • 学会等名
      第13回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体核様体タンパク質HMG1は2つのDNA結合ドメインで核様体のサイズを制御する2019

    • 著者名/発表者名
      田草川真理、浜地貴志、鹿内利治、西村芳樹
    • 学会等名
      第13回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Chloroplast chromosomes on the move - Exploring the dynamics of chloroplast nucleoids -2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Nishimura
    • 学会等名
      理研/ERATO/CSRSセミナー
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 葉緑体核様体ネットワークの動態制御機構2018

    • 著者名/発表者名
      西村 芳樹,浜地 貴志,小林 優介,鹿内 利治
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic network structure of chloroplast nucleoids.2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Nishimura, Yusuke Kobayashi, Yoshitaka Kamimura, Osami Misumi, Toshiharu Shikanai
    • 学会等名
      1st Asia-Oceania International Congress on Photosynthesis.
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 葉緑体核様体のダイナミクスと進化2018

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹
    • 学会等名
      SIC研究部セミナー
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamic transformable network of chloroplast nucleoids.2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Nishimura, Yusuke Kobayashi, Yoshitaka Kamimura, Osami Misumi, Toshiharu Shikanai.
    • 学会等名
      International symposium on photosynthesis and chloroplast biogenesis.
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic Network Structure of Chloroplast Nucleoids.2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Nishimura, Yusuke Kobayashi, Yoshitaka Kamimura, Osami Misumi, Toshiharu Shikanai, Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Isamu Miyakawa, Toshiharu Shikanai.
    • 学会等名
      18th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ボルボックス系列異型配偶ユードリナにおける配偶子誘導要因の解析2018

    • 著者名/発表者名
      豊岡 博子,浜地 貴志,西村 芳樹,宮城島 進也,箕浦 高子,野崎 久義
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 母性遺伝メカニズムの解明に向けたクラミドモナス有性生殖のゲノム編集アプローチ2018

    • 著者名/発表者名
      浜地 貴志,山岡 尚平,鹿内 利治,西村 芳樹
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 雌雄異株種・同株種ボルボックスの性染色体領域・相同領域における比較ゲノム解析2018

    • 著者名/発表者名
      9.山本 荷葉子,浜地 貴志,豊岡 博子,新垣 陽子,野口 英樹,豊田 敦,水口 洋平,野崎 久義
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Biological analysis of plastid nucleoid-associated HMG-box protein in Chlamydomonas reinhardtii.2018

    • 著者名/発表者名
      Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Isamu Miyakawa, Toshiharu Shikanai, Osami Misumi, and Yoshiki Nishimura.
    • 学会等名
      International symposium on photosynthesis and chloroplast biogenesis.
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Organelle nucleoid-associated HMG-box proteins may have been evolved independently through tandem domain duplications.2018

    • 著者名/発表者名
      11.Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Isamu Miyakawa, Toshiharu Shikanai, Osami Misumi, and Yoshiki Nishimura.
    • 学会等名
      第14回植物縦横無尽の会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Organelle nucleoid-associated HMG-box proteins may have been evolved independently through tandem domain duplications.2018

    • 著者名/発表者名
      Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Isamu Miyakawa, Toshiharu Shikanai, Osami Misumi, and Yoshiki Nishimura.
    • 学会等名
      Gordon Research Conference, Mitochondria and Chloroplasts.
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 核様体局在のHMGBタンパク質がDNA結合ドメインを2つもつ利点2018

    • 著者名/発表者名
      田草川真理, 小林優介, 深尾陽一朗, 日高久美, 遠藤政幸, 杉山弘, 宮川勇, 鹿内利治, 三角修己, 西村芳樹.
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会年会.
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 京都大学大学院理学研究科 植物分子遺伝学研究室

    • URL

      http://www.bot.kyoto-u.ac.jp/j/5_iden.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

URL: 

公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-01-27  

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