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細胞場夾雑系における圧力効果を用いた蛋白質の物理化学的特性解析法の確立と応用

公募研究

研究領域分子夾雑の生命化学
研究課題/領域番号 18H04531
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
研究機関北海道大学

研究代表者

石森 浩一郎  北海道大学, 理学研究院, 教授 (20192487)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2019年度)
配分額 *注記
5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2019年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2018年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワード圧力効果 / 静水圧 / 浸透圧 / 構造揺らぎ / ヘム蛋白質 / シトクロムc / 脱水和 / クラウダ― / ミオグロビン / 分子内FRET / 蛍光消光 / 線圧縮率
研究実績の概要

令和元年度も平成30年度に引き続き以下の項目について研究を進めたが、新学術領域研究「生命金属科学」の計画研究「生命金属動態を制御するシグナル伝達の分子機構」が採択されたため、年度途中で本研究課題は廃止となった。
①細胞場における蛋白質構造の「構造揺らぎ」の部位特異的,定量的評価 平成30年度に引き続き、蛋白質表面にTrpを導入したミオグロビンとシトクロムcの作成を試みた。いずれも安定なTrp導入蛋白質を得るために、そのTrp導入部位について検討したが、実際の変異体を作成する以前に課題が廃止となった。
②蛋白質立体構造形成反応 令和元年度はこれまでの研究で明らかになった脱水和に影響を及ぼすアミノ酸残基として、変性状態でヘムが配位するHis26に注目した。このHis26をヘムが配位しないGlnに置換した変異体を作成し、その立体構造過程における脱水和が細胞場環境においては野生型に比べどのように変化するのか追跡を試みたが、予備的な実験が終了する前に課題が廃止となった。
③蛋白質間電子伝達複合体形成反応 令和元年度はNMRの緩和解析により、Cyt cにおける構造揺らぎの大きな部位を特定したところ、CcOとの相互作用部位とは離れたHis33に構造揺らぎを反映した化学交換が観測された。このHis33はAsn103と水素結合を形成していることから、HisをPheに置換することでこの水素結合切断したところ、化学交換が消失し、構造揺らぎが抑制されたことが示された。さらに、このような構造揺らぎの抑制はCcOへの電子伝達速度の低下をもたらし、相互作用部位から離れた部位での構造揺らぎがCyt cの電子伝達活性を制御していることが示された。このような構造揺らぎが細胞場類似環境でどのように変化するのか明らかにすることを試みたが、NMRの測定条件を検討するところで本課題が廃止となった。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] 圧力効果による蛋白質の体積変化の追跡2020

    • 著者名/発表者名
      石森浩一郎
    • 雑誌名

      高圧力の科学と技術

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Uncovering dehydration in cytochrome <i>c</i> refolding from urea- and guanidine hydrochloride-denatured unfolded state by high pressure spectroscopy2019

    • 著者名/発表者名
      Konno, S., Doi, K., Ishimori, K.
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 16 号: 0 ページ: 18-27

    • DOI

      10.2142/biophysico.16.0_18

    • NAID

      130007585358

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [備考] 北海道大学大学院理学研究院構造化学研究室 発表論文からpickup

    • URL

      https://wwwchem.sci.hokudai.ac.jp/~stchem/pickup/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 発表論文からpick up

    • URL

      http://wwwchem.sci.hokudai.ac.jp/~stchem/pickup/

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2021-01-27  

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