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緑膿菌選択的化学コミュニケーション分子の機能解明と創薬シーズへの展開

公募研究

研究領域化学コミュニケーションのフロンティア
研究課題/領域番号 18H04599
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
研究機関北海道大学

研究代表者

市川 聡  北海道大学, 薬学研究院, 教授 (60333621)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2019年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2018年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード緑膿菌 / 抗菌剤 / 天然物 / 抗菌薬 / 薬剤耐性 / 薬剤耐性緑膿菌 / ヌクレオシド系抗生物質 / 有機化学 / 創薬化学
研究実績の概要

ムレイドマイシンAの誘導体である3’-ヒドロキシムレイドマイシンAが、抗菌活性を発現するうえでの標的酵素であるMraYを強力に阻害し(IC50 3.2 nM)、様々な臨床分離株、セロタイプ、多剤耐性株に対して広く抗緑膿菌活性(MIC 8~128 ug/mL)を示す事を明らかにした。ムレイドマイシンの緑膿菌選択的な抗菌活性は、緑膿菌が有する特有なトランスポーターによって選択的に取り込まれている事を示唆する。そこで、3’-ヒドロキシムレイドマイシンAの長期暴露によって取得した耐性菌の全ゲノムシークエンス解析による遺伝学的手法により、オリゴペプチドトランスポーターとして知られているNppA1A2BCDがムレイドマイシン選択的なトランスポーターである事を同定した。NppA1A2BCDは、緑膿菌特異的に発現しているトランスポーターであり、このことは、ムレイドマイシンが緑膿菌選択的に抗菌活性を示す事と大きく一致する。さらに、国外連携研究者(米国Duke大学、Seok-Yong Lee准教授)との共同研究により、Aquifex aeolicus由来MraYと3’-ヒドロキシムレイドマイシンAを含むヌクレオシド系天然物群(カルバカプラザマイシン、カプラマイシン)との網羅的な複合体とのX線結晶構造解析に成功した。本成果により、MraYの構造に基づいた論理的な薬物設計が可能となり、例えばウレア部をスクアラミドへ変換した単純化誘導体(IC50 3.2 nM)を設計・合成する事ができた。また、ムレイドマイシンと同様に強力なMraY阻害活性を有するツニカマイシンに関する構造活性相関研究も行った。その結果、ウリジン部は活性に必須であるが、長鎖脂肪酸、N-アセチルグルコサミン部は活性発現に重要ではあるものの、変換可能である事がわかった。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 2件)

  • [国際共同研究] Duke University(米国)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Chemical logic of MraY inhibition by antibacterial nucleoside natural products2019

    • 著者名/発表者名
      Ellene H. Mashalidis, Benjamin Kaeser, Yuma Terasawa, Akira Katsuyama, Do-Yeon Kwon, Kiyoun Lee, Jiyong Hong, Satoshi Ichikawa, Seok-Yong Lee
    • 雑誌名

      Nat. Commun.

      巻: 10 ページ: 2917-2917

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural requirement of tunicamycin V for MraY inhibition2019

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Yamamoto, Akira Katsuyama, Satoshi Ichikawa
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      巻: 27 号: 8 ページ: 714-1719

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2019.02.035

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tunicamycin: Chemical synthesis and biosynthesis2019

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Kazuki; Ichikawa Satoshi
    • 雑誌名

      J. Antibiot.

      巻: 72 ページ: 924-933

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] スファエリミシン類コア骨格の合成研究2019

    • 著者名/発表者名
      引地祐太、仲谷岳志、市川 聡
    • 学会等名
      日本薬学会北海道支部第 146 回例会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Tunicamycin V の全合成と構造に基づいたMraY 選択的阻害剤への変換2018

    • 著者名/発表者名
      山本 一貴、市川 聡
    • 学会等名
      第60回天然有機化合物討論会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Tunicamycin Vの全合成2018

    • 著者名/発表者名
      山本 一貴、薬師寺 文華、市川 聡
    • 学会等名
      第28回万有福岡シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nucleoside Natural Products Inhibiting Bacterial Cell Wall Biosynthesis -Chemistry and Biology-2018

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ichikawa
    • 学会等名
      6th SNU Joint Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2021-01-27  

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