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リポクオリティと膜蛋白質の相互作用のNMR解析法の開発

公募研究

研究領域脂質クオリティが解き明かす生命現象
研究課題/領域番号 18H04679
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

大澤 匡範  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 教授 (60361606)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
2019年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2018年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
キーワード多価不飽和脂肪酸 / アラキドン酸 / 電位依存性H+チャネル / NMR / ITC / 膜タンパク質 / 構造生物学 / 電位依存性プロトンチャネル
研究実績の概要

膜タンパク質の構造・機能は、しばしば脂質二重層内の微量脂質により調節される。近年、その微量脂質による機能調節には、極性の高い官能基を有するヘッドグループだけでなく、疎水性の高いアシル基の鎖長や不飽和度も含めた脂質分子全体の化学的性質・化学構造によって担われることが分かってきた。しかし、アシル基部分と膜タンパク質との相互作用様式や機能調節メカニズムについては依然として不明な点が多く、構造生物学的手法による原子レベルでの解明が待たれている。そこで本研究では、電位依存性H+チャネルVSOP/Hv1 と調節因子であるアラキドン酸類との相互作用系、および、細胞の形態変化に重要な役割を果たすタンパク質Xと不飽和脂肪酸(PUFA)含有PIP2 の相互作用系を解析対象とし、脂質二重膜中での解析を可能とする独自の試料調製法であるナノディスクを活用したNMR による膜タンパク質とリポクオリティとの相互作用解析法を確立することを目的とする。
本年度は、調製したVSOP/Hv1が単量体と二量体の間の平衡にあり、両者を分離・精製する手法を確立した。等温滴定型カロリメトリーによりアラキドン酸との相互作用解析を行ったところ、相互作用に伴う熱量変化が観測されたのは二量体だけであり、解離定数と結合のストイキオメトリーを求めることに成功した。
またタンパク質Xについては、主鎖アミド基のNMRシグナルの帰属を完了した。常磁性スピンラベルを施したのPUFA含有ナノディスク調製法を確立し、タンパク質Xとの相互作用を、化学シフト変化および常磁性緩和促進効果により解析し、タンパク質X上のPUFA結合部位を同定した。この領域に変異導入したタンパク質Xを細胞上に発現したところ、野生型で見られていた細胞形態の変化が見られなかったことから、タンパク質XとPUFAの相互作用が正常な細胞形態形成に重要であることを明らかにした。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 1件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Nanodiscs for Structural Biology in a Membranous Environment2019

    • 著者名/発表者名
      Yokogawa M., Fukuda M., Osawa M.
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 67 号: 4 ページ: 321-326

    • DOI

      10.1248/cpb.c18-00941

    • NAID

      130007621752

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2019-04-01
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural mechanism underlying G protein family-specific regulation of G protein-gated inwardly rectifying potassium channel2019

    • 著者名/発表者名
      Kano Hanaho、Toyama Yuki、Imai Shunsuke、Iwahashi Yuta、Mase Yoko、Yokogawa Mariko、Osawa Masanori、Shimada Ichio
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1038/s41467-019-10038-x

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Functional roles of Mg2+ binding sites in ion-dependent gating of a Mg2+ channel, MgtE, revealed by solution NMR2018

    • 著者名/発表者名
      Maruyama Tatsuro、Imai Shunsuke、Kusakizako Tsukasa、Hattori Motoyuki、Ishitani Ryuichiro、Nureki Osamu、Ito Koichi、Maturana Andr?s D、Shimada Ichio、Osawa Masanori
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 7

    • DOI

      10.7554/elife.31596

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Elucidation of the inhibitory mechanism of a sea anemone toxin, APETx1, targeting a human heart voltage-gated potassium channel, hERG12019

    • 著者名/発表者名
      松村 一輝、福田昌弘 、簗瀬 尚美 、秋元 まどか 、黒川 洵子 、横川真梨子、大澤 匡範
    • 学会等名
      第42回 日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 電位依存性H+チャネルHv1のアラキドン酸による活性化促進機構の解明2019

    • 著者名/発表者名
      村上玲、吉敷純、横川真梨子、松葉広昭、木村友美、川鍋陽、岡村康司、嶋田一夫、大澤匡範
    • 学会等名
      第63回 日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 電位依存性K+チャネルの膜電位依存的構造変化機構の解明2019

    • 著者名/発表者名
      日向寺孝禎、横川真梨子、藤田浩平、野崎智裕、嶋田一夫、大澤匡範
    • 学会等名
      第63回 日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ヌクレオシド輸送体ENT1 の膜輸送機構の構造生物学的解明2019

    • 著者名/発表者名
      岸孝一郎、福田昌弘、大澤匡範
    • 学会等名
      第63回 日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Gating modifier toxin, APETx1による電位依存性カリウムイオンチャネルhERG1の阻害機構の構造生物学的解明2018

    • 著者名/発表者名
      松村 一輝、福田昌弘、簗瀬 尚美、秋元 まどか、 岩崎 菜々美、坂本 多穗、黒川 洵子、横川 真梨子、大澤 匡範
    • 学会等名
      第41回分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Development of an informatics system for diversity of compound library2018

    • 著者名/発表者名
      Yugo Shimizu, Masanori Osawa, Kazuyoshi Ikeda
    • 学会等名
      CBI学会2018年大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Functional roles of Mg2+ binding sites in ion-dependent gating of a Mg2+ channel, MgtE, revealed by solution NMR.2018

    • 著者名/発表者名
      丸山 達朗 , 今井 駿輔 , 草木迫 司 , 服部 素之 , 石谷 隆一郎 , 濡木 理 , 伊藤 耕一 , Maturana Andres D. , 嶋田 一夫 , 大澤 匡範
    • 学会等名
      第57回NMR討論会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Functional roles of Mg2+ binding sites in ion-dependent gating of a Mg2+ channel, MgtE, revealed by solution NMR.2018

    • 著者名/発表者名
      大澤 匡範
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 14-3-3ζと抗癌活性化合物の相互作用の構造生物学的解析2018

    • 著者名/発表者名
      中村吏佐、河津光作、齋藤潤、佐谷秀行、大澤匡範
    • 学会等名
      第62回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Hanatoxin1による電位依存性プロトンチャネルHv1阻害機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      中久木友哉、横川真梨子、泉谷俊稀、大澤匡範
    • 学会等名
      第62回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 電位依存性カリウムイオンチャネルの膜電位依存的構造変化機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      藤田浩平、横川真梨子、上和田遥平、日向寺孝禎、野崎智裕、嶋田一夫、大澤匡範
    • 学会等名
      第62回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Hanatoxin1による電位依存性プロトンチャネルHv1阻害機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      中久木友哉,横川真梨子,泉谷俊稀,大澤匡範
    • 学会等名
      第2回慶應ライフサイエンスシンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 電位依存性カリウムイオンチャネルの膜電位依存的構造変化機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      藤田浩平,横川真梨子,上和田遥平,日向寺孝禎,野崎智裕,嶋田一夫,大澤匡範
    • 学会等名
      第2回慶應ライフサイエンスシンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 溶液NMR 法によるMg2+ チャネルMgtE の開閉機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      大澤 匡範
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of the multimeric structure of poly(A)-binding protein on a poly(A) tail.2018

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Sawazaki, Shunsuke Imai, Mariko Yokogawa, Nao Hosoda, Shin-ichi Hoshino, Muneyo Mio, Kazuhiro Mio, Ichio Shimada, Masanori Osawa.
    • 学会等名
      第18回 日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Structural dynamics of potassium ion channels revealed by side-chain methyl13C-1H multiple quantum relaxation analyses.2018

    • 著者名/発表者名
      Yuki Toyama, Hanaho Kano, Yoko Mase, Mariko Yokogawa, Masanori Osawa and Ichio Shimada.
    • 学会等名
      59th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [図書] 脂質クオリティ2018

    • 著者名/発表者名
      大澤匡範、岡村康司、有田 誠、他
    • 総ページ数
      220
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758103718
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 慶應義塾大学薬学部 生命機能物理学講座

    • URL

      http://square.umin.ac.jp/keio-skb/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2021-01-27  

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