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DNA二重鎖切断修復によるゲノム安定性維持機構の4D情報

公募研究

研究領域染色体オーケストレーションシステム
研究課題/領域番号 18H04709
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
研究機関東京大学

研究代表者

佐々木 真理子  東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (50722013)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
2019年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2018年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
キーワードDNA二重鎖切断 / ゲノム安定性 / rDNA / 複製阻害 / DNA修復 / DNA複製阻害 / ゲノム不安定化 / 染色体オーケストレーション
研究実績の概要

複製阻害時のDSB修復に関わる新規因子の同定(研究計画1)
2018年度の研究から、Fob1依存的にrDNA不安定化を起こす変異株を同定した。これらの変異株で欠損している遺伝子は、Fob1による複製阻害の下流、つまりDSB修復過程で作用する可能性が考えられる。そこでこれらの変異株において先行研究において確立したDSBアッセイを行うことによって、DSB頻度やDSB修復過程での異常を解析した。またDSB修復時には、ゲノム上のrDNAアレイからいくつかのrDNA配列が切り出された染色体外環状rDNAが算出される。そこで染色体外環状rDNAの量および形状を解析することによって、DSB修復過程で異常が見られるかを解析した。その結果、DSB修復過程で異常が見られる変異株を同定することができた。
新規DSB修復因子がS期以外の細胞周期におけるDSB修復に関わる役割の解明(研究計画2)
I-SceIエンドヌクレアーゼの認識配列をrDNA領域に挿入し、I-SceIを発現させることによってrDNA領域に複製非依存的なDSBを誘導する。そこでI-SceI認識配列をrDNAに挿入するために用いるプラスミドを構築し、rDNA領域内にI-SceI切断部位を持つ酵母株を構築した。今後の研究において、研究計画1で同定した因子がI-SceIによるDSB修復に関与するかを解析し、細胞周期普遍的に作用するのか複製阻害時のDSB特異的に作用するのかを明らかにしたい。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Defects in the NuA4 acetyltransferase complex increase stability of the ribosomal RNA gene and extend replicative lifespan2019

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Wakatsuki, Mariko Sasaki, Takehiko Kobayashi
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 94 号: 5 ページ: 197-206

    • DOI

      10.1266/ggs.19-00022

    • NAID

      130007760285

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 年月日
      2019-10-01
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The CCR4-NOT complex maintains stability and transcription of rRNA genes by repressing antisense transcripts.2019

    • 著者名/発表者名
      Shun Hosoyamada, Mariko Sasaki, Takehiko Kobayashi
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Biology

      巻: 40 号: 1

    • DOI

      10.1128/mcb.00320-19

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] クロマチン構造上で起こるDNA複製阻害時のDNA二本鎖切断修復2019

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      第37回染色体ワークショップ、第18回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製阻害時のDNA二本鎖切断修復を制御するメカニズム2019

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会ワークショップ「染色体配列や細胞のダイバーシティに適応した精巧かつ柔軟なゲノム安定性維持機構」
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 複製阻害時のDNA二本鎖切断修復の制御機構2019

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      第25回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] クロマチン構造がDNA複製阻害時のDNA二本鎖切断修復に与える影響2019

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会ワークショップ「クロマチン構造上で起こる反応の生化学」
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA複製阻害時のDNA二重鎖切断修復機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会ワークショップ「進むDNA複製フォークの研究:ゲノム恒常性維持の課題と解決」
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] A replisome component Ctf4 suppresses end resection of DNA double-strand breaks at arrested replication forks2018

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      11th 3R + 3C Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNA複製阻害時のDNA二重鎖切断修復機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子, 小林 武彦
    • 学会等名
      日本遺伝学会第90回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] A replisome component Ctf4 suppresses end resection of DNA double-strand breaks at arrested replication forks2018

    • 著者名/発表者名
      Mariko Sasaki, Takehiko Kobayashi
    • 学会等名
      Gordon Research Conference Genomic Instability
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2021-01-27  

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