• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

がん微小環境における「細胞文脈と行間」の俯瞰的解読と攻略

公募研究

研究領域がんシステムの新次元俯瞰と攻略
研究課題/領域番号 18H04897
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
研究機関東京大学

研究代表者

大澤 毅  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任准教授 (50567592)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円)
2019年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2018年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
キーワードがん微小環境 / がん代謝 / 細胞文脈 / オミクス統合解析
研究実績の概要

がんの悪性化には「細胞文脈」が重要な役割を果たす。本研究では、細胞文脈(タンパク質コード領域)のみならず行間(非コード領域)のエピゲノム、トランスクリプトーム情報と表現系(フェノーム)であるメタボローム、リン酸化プロテオームのオミクス統合数理ネットワークモデルを構築し、腫瘍微小環境によるがん悪性化の本質的な理解を情報解析と分子腫瘍学的手法の融合から実現し、臨床検体に応用することで、がんの俯瞰と攻略を目指し「がん悪性化」と「進化と多様性」を規定する「細胞行間」の解読のための研究を行った。
(1)腫瘍微小環境における非コード長鎖RNAのがん悪性化機構の検討:近年、ヒトゲノムからタンパク質をコードしない長鎖非コードRNA(LncRNA)が多く転写され、がんの悪性化に寄与することが報告されている。申請者は、領域内の共同研究によりRNASeqから網羅的にlncRNAの転写を定量する方法を開発し、低栄養で血管新生や腫瘍増殖に寄与するncRNA(JHDM-AS1)を発見し報告したが、本研究では、この成果を発展させlncRNAの網羅的発現データを用いた統合的な解析から、がん悪性化における影響の検討を行った。
(2)腫瘍微小環境における非コード領域のがん悪性化機構の検討:LncRNAの解析に加え、タンパク質非コードゲノム領域には、遺伝子発現をエピジェネテックに制御するエンハンサーやスーパーエンハンサー領域が存在する。申請者は、遺伝子発現、H3K27Acのヒストンマークとクロマチン相互作用データを統合し、腫瘍微小環境における非コード領域のがん悪性化機構の解明を行い、低pHや低栄養でがん悪性化に寄与する可能性がある代謝酵素が遠隔クロマチンの相互作用によってエピジェネチックな発現制御が関与している可能性を見出した。これらの制御エレメント、及び、制御因子候補を新たに発見した。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 5件、 招待講演 7件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] Gene Expression Profiles Induced by a Novel Selective Peroxisome Proliferator-Activated Receptor α Modulator (SPPARMα) Pemafibrate2019

    • 著者名/発表者名
      Sasaki Y, Raza-Iqbal S, Tanaka T, Murakami K, Anai M, Osawa T, Matsumura Y, Sakai J, Kodama T
    • 雑誌名

      Int J Mol Sci

      巻: 20(22) 号: 22 ページ: 5682-5682

    • DOI

      10.3390/ijms20225682

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Phosphoethanolamine Accumulation Protects Cancer Cells under Glutamine Starvation through Downregulation of PCYT22019

    • 著者名/発表者名
      Osawa T, Shimamura T, Saito K, Hasegawa Y, Ishii N, Nishida M, Ando R, Kondo A, Anwar M, Kato K, Endo K, Yamano S, Kanki Y, Matsumura Y, Minami T, Tanaka T, Anai M, Wada Y, Wanibuchi H, Hayashi M, Hamada A, Yoshida M, Yachida S, Nakao M, Sakai J, Aburatani H, Shibuya M, Hanada K, Miyano S, Soga T, Kodama T
    • 雑誌名

      Cell Rep.

      巻: 29(1) 号: 1 ページ: 89-103

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2019.08.087

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Regnase-1-mediated post-transcriptional regulation is essential for hematopoietic stem and progenitor cell homeostasis2019

    • 著者名/発表者名
      Kidoya H, Muramatsu F, Shimamura T, Jia W, Satoh T, Hayashi Y, Naito H, Kunisaki Y, Arai F, Seki M, Suzuki Y, Osawa T, Akira S., Takakura N
    • 雑誌名

      Nature Commun

      巻: 10 ページ: 1072-1072

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Regnase-1-mediated post-transcriptional regulation is essential for hematopoietic stem and progenitor cell homeostasis2019

    • 著者名/発表者名
      Kidoya H, Muramatsu F, Shimamura T, Jia W, Satoh T, Hayashi Y, Naito H, Kunisaki Y, Arai F, Seki M, Suzuki Y, Osawa T, Akira S., Takakura N.
    • 雑誌名

      Nature Commun,

      巻: 10 号: 1 ページ: 1072-1072

    • DOI

      10.1038/s41467-019-09028-w

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Integrative Nutriomics Approach for understanding Cancer and Metabolism2020

    • 著者名/発表者名
      大澤 毅
    • 学会等名
      International Conference on Cancer Systems Biology Beyond
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Information and life science fusion brings innovation-To break through the limits of omics analysis2019

    • 著者名/発表者名
      大澤 毅
    • 学会等名
      The 42nd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Tumor progression though amino acids metabolic shift2019

    • 著者名/発表者名
      大澤 毅
    • 学会等名
      The 78th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Integrative understanding and control of biological phenomena through specio-temporal omics2019

    • 著者名/発表者名
      大澤 毅
    • 学会等名
      The 92nd Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] がん細胞におけるグルタミン欠乏適応機構の解明2019

    • 著者名/発表者名
      大澤 毅
    • 学会等名
      第7回がんと代謝研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Adaptation of Cancer cells against amino acid deprivation to promote tumor progression2019

    • 著者名/発表者名
      大澤 毅
    • 学会等名
      2019 Spring International Convention of The Pharmaceutical Society of Korea
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Glutamine Deprivation Promotes Tumor Progression through Down-regulation of PCYT22019

    • 著者名/発表者名
      Osawa T et al.
    • 学会等名
      第11回JCA-AACR Joint Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comprehensive Nutriomics Approach Reveals Mechanism of Tumor Aggressiveness2018

    • 著者名/発表者名
      Osawa T
    • 学会等名
      16th Korea-Japan Joint Symposium on Vascular Biology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] アミノ酸飢餓における代謝変動ががんの悪性化に寄与する2018

    • 著者名/発表者名
      大澤毅ら
    • 学会等名
      第77回 日本癌学会学術大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Glutamine Deprivation Promotes Tumor Progression through Down-regulation of PCYT22018

    • 著者名/発表者名
      Osawa T et al.
    • 学会等名
      コールドスプリングハーバーミーティング
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ニュートリオミクスでがん悪性化機構を解き明かす2018

    • 著者名/発表者名
      大澤毅
    • 学会等名
      第41回 日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] Precision 哺乳類胚の休眠ダイナミクス2019

    • 著者名/発表者名
      大澤毅 他
    • 総ページ数
      84
    • 出版者
      北隆館
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [図書] 医学のあゆみ 多階層オミクス統合解析-オミクス解析2019

    • 著者名/発表者名
      望月直樹 大澤毅 他
    • 総ページ数
      120
    • 出版者
      医歯薬出版株式会社
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [図書] 血管のバイオロジー オミクスが加速させる血管研究, 細胞2018

    • 著者名/発表者名
      大澤毅
    • 出版者
      ニューサイエンス社
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [図書] 酸性環境における腫瘍の悪性化機構, 生化学2018

    • 著者名/発表者名
      近藤彩乃, 大澤毅
    • 出版者
      国際文献社
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2021-01-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi