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エピゲノム変化による機能性肝細胞ダイバーシティー形成原理の解明とその制御

公募研究

研究領域細胞社会ダイバーシティーの統合的解明と制御
研究課題/領域番号 18H05102
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
研究機関九州大学

研究代表者

鈴木 淳史  九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (30415195)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
13,000千円 (直接経費: 10,000千円、間接経費: 3,000千円)
2019年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2018年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワード発生・分化 / 細胞・組織 / 遺伝子
研究実績の概要

幹細胞から分化した細胞は内在性プログラムによって様々な遺伝子が細胞の機能的相違に基づいて体系的に発現し、個々の機能を獲得しながら臓器内の適切な位置に配置される。このような内在性プログラムによる臓器の成熟過程では、細胞の機能に応じて特定遺伝子領域のエピゲノム状態が変化し、それらが起点となって細胞の機能的相違が生じるが、その詳細な機序は不明である。そこで本研究では、機能の異なる肝細胞の亜集団が組織内の位置に応じて適切に配置される肝臓をモデルとし、微量サンプルのトランスクリプトーム・エピゲノム解析を駆使することで、未成熟な肝細胞のエピゲノム変化によって機能の異なる肝細胞が生まれるメカニズムを明らかにすべく研究を行った。本年度に実施した研究では、これまでに行った肝細胞のトランスクリプトーム・エピゲノム解析から肝細胞分化に影響を与えうる遺伝子候補を抽出し、それらを機能性肝細胞に分化・成熟する前の肝細胞様細胞(induced hepatocyte-like cell:iHep細胞)に導入した。iHep細胞とは、線維芽細胞に2種類の転写因子を導入して誘導する「ダイレクトリプログラミング」によって作製される肝細胞の性質をもった細胞のことを指す。実験の結果、未成熟だったiHep細胞の肝機能レベルが上昇し、機能性肝細胞への分化が促進することが判明した。また、培地中のアミノ酸や酸素濃度を調節するとiHep細胞のエピゲノム状態が変化し、iHep細胞の肝機能レベルに影響を与えることも判明した。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて 2020 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (29件) (うち国際学会 6件、 招待講演 15件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [国際共同研究] Universite catholique de Louvain/University of Liege(ベルギー)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Washington University School of Medicine(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Universite catholique de Louvain/University of Liege(ベルギー)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Washington University School of Medicine(米国)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Induction of steatohepatitis and liver tumorigenesis by enforced Snail expression in hepatocytes2020

    • 著者名/発表者名
      Miura, S. and Suzuki, A.
    • 雑誌名

      The American Journal of Pathology

      巻: in press 号: 6 ページ: 1271-1283

    • DOI

      10.1016/j.ajpath.2020.02.005

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Zfp281 shapes the transcriptome of trophoblast stem cells and is essential for placental development2019

    • 著者名/発表者名
      Ishiuchi, T., Ohishi, H., Sato, T., Kamimura, S., Yorino, M., Abe, S., Suzuki, A., Wakayama, T., Suyama, M., Sasaki, H.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 27 号: 6 ページ: 1742-1754

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2019.04.028

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] New high-throughput screen identifies compounds that reduce viability specifically in liver cancer cells that express high levels of SALL4 by inhibiting oxidative phosphorylation2019

    • 著者名/発表者名
      Tan, J.L., Li, F., Yeo, J.Z., Yong, K.J., Bassal, M.A., Ng, G.H., Lee, M.Y., Leong, C.Y., Tan, H.K., Wu, C.S., Liu, B.H., Chan, T.H., Tan, Z.H., Chan, Y.S., Wang, S., Lim, Z.H., Toh, T.B., Hooi, L., Low, K.N., Ma, S., Kong, N.R., Stein, A.J., Wu, Y., Thangavelu, M.T., Suzuki, A., et al.
    • 雑誌名

      Gastroenterology

      巻: 157 号: 6 ページ: 1615-1629

    • DOI

      10.1053/j.gastro.2019.08.022

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Generation of Nanog reporter mice that distinguish pluripotent stem cells from unipotent primordial germ cells.2019

    • 著者名/発表者名
      Terada M, Kawamata M, Kimura R, Sekiya S, Nagamatsu G, Hayashi K, Horisawa K, Suzuki A.
    • 雑誌名

      Genesis

      巻: 57 号: 11-12

    • DOI

      10.1002/dvg.23334

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cell aggregation culture induces functional differentiation of induced hepatocyte-like cells through activation of Hippo signaling2018

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, J., Udono, M., Miura, S., Sekiya, S., Suzuki, A.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 25 号: 1 ページ: 183-198

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2018.09.010

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Prolonged inhibition of hepatocellular carcinoma cell proliferation by combinatorial expression of defined transcription factors2018

    • 著者名/発表者名
      Takashima Yasuo、Horisawa Kenichi、Udono Miyako、Ohkawa Yasuyuki、Suzuki Atsushi
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 109 号: 11 ページ: 3543-3553

    • DOI

      10.1111/cas.13798

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Brief summary of the current protocols for generating intestinal organoids2018

    • 著者名/発表者名
      Miura, S. and Suzuki, A.
    • 雑誌名

      Development, Growth & Differentiation

      巻: 60 号: 6 ページ: 387-392

    • DOI

      10.1111/dgd.12559

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 人工肝細胞の作製と機能的成熟誘導2020

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞ダイバース」第5回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] iHep細胞へのダイレクトリプログラミングを阻害する転写因子の同定とその解析2020

    • 著者名/発表者名
      従野雅義,堀澤健一,鈴木淳史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞ダイバース」第5回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Trans-omic analysis for metabolic remodeling during liver regeneration2020

    • 著者名/発表者名
      Horisawa, K., Miura, S., Izumi, Y., Bamba, T., Suzuki, A.
    • 学会等名
      The 29th Hot Spring Harbor International Symposium “Cutting Edge of Technical Innovations in Trans-Omics”
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 肝細胞への直接運命転換における解析2020

    • 著者名/発表者名
      従野雅義,堀澤健一,鈴木淳史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞ダイバース」第3回若手ワークショップ
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Trans-omic analysis for metabolic remodeling during liver regeneration2020

    • 著者名/発表者名
      堀澤健一,三浦静,和泉自泰,馬場健史,鈴木淳史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞ダイバース」第3回若手ワークショップ
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Direct reprogramming to hepatic and intestinal lineages2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, A.
    • 学会等名
      International Symposium: Principles of pluripotent stem cells underlying plant vitality
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 肝再生に伴う脂質代謝変動のリピドーム解析2019

    • 著者名/発表者名
      堀澤健一,三浦静,鈴木淳史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞ダイバース」第4回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Generation of induced intestinal stem and progenitor cells by direct lineage reprogramming2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, A.
    • 学会等名
      The Copenhagen Bioscience Conference on Intestinal Organoids - from stem cells to metabolism and microbiome interactions
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ダイレクトリプログラミングによるヒト肝前駆細胞の作製2019

    • 著者名/発表者名
      稲田浩気,鈴木淳史
    • 学会等名
      PHILOSOPHY
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ダイレクトリプログラミングによる機能性肝細胞の作出と肝再生医療2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      第31回JBICバイオ関連基盤技術研究会「肝疾患(NAFLD/NASH)と肝再生医療」
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 由来の異なる組織由来iHep細胞における遺伝子発現の比較解析2019

    • 著者名/発表者名
      鵜殿美弥子,堀澤健一,村山僚,鈴木淳史
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] CRISPR-Cas9の活性調節によるアレル選択的ゲノム編集法の開発2019

    • 著者名/発表者名
      川又理樹,木村亮太,鈴木淳史
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 転写因子が引き起こすエピジェネティックリモデリングと細胞運命転換2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 肝臓におけるSnailの過剰発現は肝細胞癌を誘導する2019

    • 著者名/発表者名
      三浦静、鈴木淳史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞ダイバース」第3回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 肝臓と腸上皮組織におけるダイレクトリプログラミング研究の進展2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      琉球医学会特別講演会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ダイレクトリプログラミングによる細胞創生と医療応用2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      九州大学母子総合研究リサーチコアカンファレンス
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Direct reprogramming to hepatic and intestinal lineages2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, A.
    • 学会等名
      International Symposium on Epigenome 2019
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 肝細胞へのダイレクトリプログラミングを阻害する転写因子の同定2019

    • 著者名/発表者名
      従野雅義、堀澤健一、鈴木淳史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞ダイバース」第2回若手ワークショップ
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] ダイレクトリプログラミングによる肝細胞誘導の標準化2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      第18回日本再生医療学会総会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Direct reprogramming to hepatic and intestinal lineages2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      第33回九州免疫血液研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 肝臓の組織形成メカニズム2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞ダイバース」第2回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ダイレクトリプログラミングによる腸上皮オルガノイドの作製2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      第18回GIリサーチフォーラム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 肝細胞におけるsnailの過剰発現は肝細胞癌を誘導する2018

    • 著者名/発表者名
      三浦静、鈴木淳史
    • 学会等名
      第25回肝細胞研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 肝細胞へのダイレクトリプログラミングを阻害する転写因子の同定2018

    • 著者名/発表者名
      従野雅義、堀澤健一、鈴木淳史
    • 学会等名
      第25回肝細胞研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 線維芽細胞の不均一性がiHep細胞誘導に与える影響2018

    • 著者名/発表者名
      後藤那奈子、鵜殿美弥子、鈴木淳史
    • 学会等名
      第25回肝細胞研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 転写因子が引き起こすエピジェネティックリモデリングと細胞運命転換2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第63回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Identification of transcription factors repressing direct conversion of mouse embryonic fibroblasts into induced hepatocyte-like cells2018

    • 著者名/発表者名
      Yorino, M., Horisawa, K., Suzuki, A.
    • 学会等名
      The 28th Hot Spring Harbor Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Direct reprogramming to hepatic and intestinal lineages2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, A.
    • 学会等名
      2018 The 14th Annual Meeting of TSSCR: From Pluripotency to 3D Organoid and Personalized Medicine
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Direct reprogramming to hepatic and intestinal lineages2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木淳史
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/labo/orgreg/top.html

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
  • [産業財産権] ゲノム編集された細胞の製造方法2018

    • 発明者名
      鈴木淳史、川又理樹
    • 権利者名
      鈴木淳史、川又理樹
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2018-232946
    • 出願年月日
      2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-12-25  

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