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「緩い」基質認識が可能にするプレニル基転移反応のリデザイン

公募研究

研究領域生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学
研究課題/領域番号 19H04651
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関名古屋大学

研究代表者

邊見 久  名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (60302189)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
2020年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2019年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
キーワードプレニル基転移酵素 / イソプレノイド / 古細菌
研究開始時の研究の概要

プレニル基転移反応は、イソプレノイドという自然界で最大の天然化合物群の生合成に関わる酵素反応であり、この反応の生成物を変化させることでイソプレノイドの構造多様性を拡張することが可能となる。最近我々は通常の酵素が受け入れない化合物を基質とするプレニル基転移酵素を見出している。その基質認識機構を解明し、その知見をもとに他の酵素の厳格な基質認識を変化させることで、非天然イソプレノイドの合成を試みる。

研究実績の概要

各種プレニル基転移酵素を対象として、それらの「緩い」基質特異性の物質生産への応用、およびその特異性の分子機構の解明を目指した研究を実施した。シス型プレニル基転移酵素に関しては、メタン生成古細菌より見出した、基質特異性の緩い同酵素であるMM_0014が、通常の基質であるイソペンテニル二リン酸の4位炭素へのプレニル基転移(C-プレニル化)反応だけでなく、グリセロールなど小分子アルコールの水酸基へのプレニル基転移(O-プレニル化)反応を触媒できることを、X線結晶構造解析や質量分析などにより明らかにした。また、古細菌膜脂質の生合成に関わるプレニル基転移酵素の緩い基質特異性を利用し、天然には存在しないC30という長い炭素鎖を有する古細菌膜脂質アナログの酵素合成、および大腸菌による生産に成功した。その他、近年我々が見出した古細菌型メバロン酸経路の中間体を、野生型および変異型の各種プレニル基転移酵素の基質とする実験も実施した。期待した結果を得ることはできなかったものの、その研究の過程で、同経路に関わる新奇酵素について、いくつかの新しい発見を行うことができた。例えばホスホメバロン酸脱水酵素が、真正細菌由来の近縁酵素に関する報告とは異なり、[4Fe-4S]型の鉄硫黄クラスターを活性中心に保持していることをEPR解析により証明した。また、ホスホトランスアンヒドロメバロン酸脱炭酸酵素がプレニル化フラビンを補酵素とすることを再構成実験により証明した。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 2件、 招待講演 3件)

  • [雑誌論文] A versatile cis-prenyltransferase from Methanosarcina mazei catalyzes both C- and O-prenylations2021

    • 著者名/発表者名
      Okada Miyako、Unno Hideaki、Emi Koh-ichi、Matsumoto Mayuko、Hemmi Hisashi
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: in press ページ: 100679-100679

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.100679

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 古細菌型メバロン酸経路の発見2021

    • 著者名/発表者名
      邊見 久
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 93 ページ: 221-224

    • NAID

      40022582932

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Construction of an artificial biosynthetic pathway for hyperextended archaeal membrane lipids in the bacterium Escherichia coli2020

    • 著者名/発表者名
      Yoshida Ryo、Hemmi Hisashi
    • 雑誌名

      Synthetic Biology

      巻: 5 号: 1

    • DOI

      10.1093/synbio/ysaa018

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reconstruction of the "archaeal" mevalonate pathway from the methanogenic archaeon Methanosarcina mazei in Escherichia coli cells2020

    • 著者名/発表者名
      Yoshida Ryo、Yoshimura Tohru、Hemmi Hisashi
    • 雑誌名

      Applied Environmental Microbiology

      巻: 86 号: 6

    • DOI

      10.1128/aem.02889-19

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A heteromeric cis-prenyltransferase is responsible for the biosynthesis of glycosyl carrier lipids in Methanosarcina mazei2019

    • 著者名/発表者名
      Emi Koh-ichi、Sompiyachoke Kitty、Okada Miyako、Hemmi Hisashi
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 520 号: 2 ページ: 291-296

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.09.143

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 超好熱性アーキア由来ホスホメバロン酸デヒドラターゼの活性中心に存在する鉄硫黄クラスターの解析2021

    • 著者名/発表者名
      米山 睦、三野 広幸、保野 陽子、品田 哲郎、吉村 徹、邊見 久
    • 学会等名
      2021年度日本農芸化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] アーキア型メバロン酸経路の鍵酵素ホスホ-trans-アンヒドロメバロン酸デカルボキシラーゼの酵素学的研究2021

    • 著者名/発表者名
      松嶋 夏海、栗木 莉子、保野 陽子、品田 哲郎、吉村 徹、邊見 久
    • 学会等名
      2021年度日本農芸化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Methanosarcina mazei 由来プレニル二リン酸特異的 Nudix hydrolase の機能解明2021

    • 著者名/発表者名
      石橋 裕美、松嶋 夏海、吉村 徹、邊見 久
    • 学会等名
      2021年度日本農芸化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 未培養真正細菌に存在する古細菌型メバロン酸経路2020

    • 著者名/発表者名
      邊見 久、Riko Kuriki、吉田 稜
    • 学会等名
      第30回イソプレノイド研究会例会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 古細菌型メバロン酸経路に関与するプレニル化FMN依存性脱炭酸酵素の研究2019

    • 著者名/発表者名
      松嶋夏海、吉村 徹、邊見 久
    • 学会等名
      日本ビタミン学会第71回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 古細菌型メバロン酸経路に関与するプレニル化FMN依存性脱炭酸酵素の研究2019

    • 著者名/発表者名
      松嶋夏海、品田哲郎、吉村 徹、邊見 久
    • 学会等名
      酵素補酵素研究会2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 超好熱アーキアに見出した「第4の」メバロン酸経路2019

    • 著者名/発表者名
      邊見 久
    • 学会等名
      微生物ウィーク2019 シンポジウム「好熱菌研究最前線」
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Recounstruction of the archaeal mevalonate pathway from the mesophilic methanogenic archaeon Methanosarcina mazei in Escherichia coli cells2019

    • 著者名/発表者名
      Ryo Yoshida, Tohru Yoshimura, Hisashi Hemmi
    • 学会等名
      TERPNET 2019 14th International Meeting on the Biosynthesis, Function and Synthetic Biology of Isoprenoids
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Discovery of a “fourth” mevalonate pathway from the hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix2019

    • 著者名/発表者名
      Hisashi Hemmi
    • 学会等名
      Thermophiles 2019 15th International Congress on Thermophiles
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A heteromeric cis-prenyltransferase from the thermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus: purification and biochemical characterization2019

    • 著者名/発表者名
      Kitty Sompiyachoke, Koh-ichi Emi, Tohru Yoshimura, Hisashi Hemmi
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 非天然型C25,C30-アーキア膜脂質の生合成経路の構築2019

    • 著者名/発表者名
      吉田 稜、吉村 徹、邊見 久
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 超好熱性アーキアAeropyrum pernix由来ホスホメバロン酸デヒドラターゼの解析2019

    • 著者名/発表者名
      米山 睦、吉村 徹、邊見 久
    • 学会等名
      第29回イソプレノイド研究会例会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 超好熱性アーキアAeropyrum pernix由来ホスホ-trans-アンヒドロメバロン酸デカルボキシラーゼの特性評価2019

    • 著者名/発表者名
      邊見 久、松嶋夏海、品田哲郎、吉村 徹
    • 学会等名
      第20回極限環境生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 「緩い」基質認識が可能にするプレニル基転移反応のリデザイン2019

    • 著者名/発表者名
      邊見 久
    • 学会等名
      生合成リデザイン第7回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] アーキア型メバロン酸経路におけるホスホメバロン酸デヒドラターゼの特性評価2019

    • 著者名/発表者名
      米山 睦、齋藤甲斐、保野陽子、品田哲郎、吉村 徹、邊見 久
    • 学会等名
      2020年度日本農芸化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Does the archaeal mevalonate pathway exist in an unculturable bacterium, Candidatus Promineofilum breve?2019

    • 著者名/発表者名
      Riko Kuriki, Ryo Yoshida, Tohru Yoshimura, Hisashi Hemmi
    • 学会等名
      2020年度日本農芸化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2025-11-21  

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