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赤色進化系統におけるプロトン駆動力により制御される光捕集適応機構の解明

公募研究

研究領域新光合成:光エネルギー変換システムの再最適化
研究課題/領域番号 19H04726
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関岡山大学

研究代表者

長尾 遼  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 特任講師 (30633961)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2019年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード光合成 / 光捕集 / 集光性色素タンパク質 / 励起エネルギー移動 / 植物・藻類 / 光化学系タンパク質
研究開始時の研究の概要

光合成生物の集光性色素タンパク質は、光エネルギーの捕集と過剰エネルギーの散逸という二つの役割を担う。中でも、チラコイド膜内外で生じるプロトン濃度勾配に依存した光エネルギー消光は、緑藻や植物といった緑色進化系統では広く研究されているが、珪藻や渦鞭毛藻といった赤色進化系統においては研究例がほとんどない。珪藻の集光性色素タンパク質FCPは、タンパク質組成や色素組成が植物の集光性色素タンパク質LHCと大きく異なるため、光捕集・散逸機構が異なると考えられている。本研究は珪藻におけるプロトン濃度勾配に依存した光エネルギー伝達メカニズムを明らかにする。

研究実績の概要

集光性色素タンパク質(LHC)は、光エネルギーを捕集し、光化学系タンパク質(PSI、PSII)へと伝達する重要な役割を担う。LHCは光合成生物種間で多様であり、タンパク質構造の違いに加え、色素分子の種類や数の違いも見出されている。LHCの多様性は、光合成生物の見た目の色の違いをもたらし、励起エネルギー伝達機構の違いを担う。本研究では褐色を呈する珪藻を材料とし、珪藻の特殊なLHCであるフコキサンチンクロロフィルタンパク質(FCP)の機能構造解明を目指す。
クライオ電子顕微鏡単粒子解析により、珪藻のPSI-FCPI超複合体の立体構造を解明した。その結果、PSIには遺伝子の異なる16個のFCPが結合していることを見出した。陸上植物のPSIには4個のLHCが結合しているため、珪藻と陸上植物とでPSIのアンテナサイズが大きく異なることを明らかにした。この結果を論文として纏めた。
培養条件の変化がFCPの発現に及ぼす影響を調べた結果、温度および二酸化炭素濃度を変化させることにより、FCPの発現調節が変化することを見出した。特に、30度、3%CO2の培養条件において、新規のFCPが発現した。この結果を論文として纏めた。
強光照射した珪藻からFCPを調製し、励起エネルギーダイナミクスを調べた。強光により、状態の異なるFCPが発現し、励起エネルギー消光を誘導することが判明した。光合成生物は光の強さを感じると光阻害を起こす。光阻害が進行することによりチラコイド膜のルーメン側が酸性化される。強光およびpH変化によってFCPの状態が変わり、励起エネルギーダイナミクスの変化が生じたのであろう。この結果を論文として纏めた。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (16件) (うち国際共著 1件、 査読あり 16件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Basic pH-induced modification of excitation-energy dynamics in fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins isolated from a pinguiophyte, Glossomastix chrysoplasta2021

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Kato Ka-Ho、Tsuboshita Naoki、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1862 号: 1 ページ: 148306-148306

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2020.148306

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular organizations and function of iron-stress-induced-A protein family in Anabaena sp. PCC 71202021

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Suzuki Takehiro、Kato Koji、Kato Ka-Ho、Tsuboshita Naoki、Jiang Tian-Yi、Dohmae Naoshi、Shen Jian-Ren、Ehira Shigeki、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1862 号: 1 ページ: 148327-148327

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2020.148327

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhancement of excitation-energy quenching in fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins isolated from a diatom Phaeodactylum tricornutum upon excess-light illumination2021

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Suzuki Takehiro、Kumazawa Minoru、Kato Ka-Ho、Tsuboshita Naoki、Dohmae Naoshi、Ifuku Kentaro、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1862 号: 2 ページ: 148350-148350

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2020.148350

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure of a cyanobacterial photosystem I surrounded by octadecameric IsiA antenna proteins2020

    • 著者名/発表者名
      Akita Fusamichi、Nagao Ryo、Kato Koji、Nakajima Yoshiki、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Suzuki Takehiro、Dohmae Naoshi、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji、Miyazaki Naoyuki
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 3 号: 1 ページ: 232-232

    • DOI

      10.1038/s42003-020-0949-6

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for assembly and function of a diatom photosystem I-light-harvesting supercomplex2020

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Kato Koji、Ifuku Kentaro、Suzuki Takehiro、Kumazawa Minoru、Uchiyama Ikuo、Kashino Yasuhiro、Dohmae Naoshi、Akimoto Seiji、Shen Jian-Ren、Miyazaki Naoyuki、Akita Fusamichi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 2481-2481

    • DOI

      10.1038/s41467-020-16324-3

    • NAID

      120006846484

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Acidic pH-Induced Modification of Energy Transfer in Diatom Fucoxanthin Chlorophyll a/c-Binding Proteins2020

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 124 号: 24 ページ: 4919-4923

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.0c04231

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Adaptation of light-harvesting and energy-transfer processes of a diatom Chaetoceros gracilis to different light qualities2020

    • 著者名/発表者名
      Seiji Akimoto、Yoshifumi Ueno、Makio Yokono、Jian-Ren Shen、Ryo Nagao
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: - 号: 1-3 ページ: 87-93

    • DOI

      10.1007/s11120-020-00713-2

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Changes in excitation relaxation of diatoms in response to fluctuating light, probed by fluorescence spectroscopies2020

    • 著者名/発表者名
      Tanabe Miyuki、Ueno Yoshifumi、Yokono Makio、Shen Jian-Ren、Nagao Ryo、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: 146 号: 1-3 ページ: 143-150

    • DOI

      10.1007/s11120-020-00720-3

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of CO2 and temperature on photosynthetic performance in the diatom Chaetoceros gracilis2020

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Ueno Yoshifumi、Akimoto Seiji、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: 146 号: 1-3 ページ: 189-195

    • DOI

      10.1007/s11120-020-00729-8

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Adaptation of light-harvesting and energy-transfer processes of a diatom Phaeodactylum tricornutum to different light qualities2020

    • 著者名/発表者名
      Kumiko Oka、Yoshifumi Ueno、Makio Yokono、Jian-Ren Shen、Ryo Nagao、Seiji Akimoto
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: - 号: 1-3 ページ: 227-234

    • DOI

      10.1007/s11120-020-00714-1

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] pH-induced regulation of excitation energy transfer in cyanobacterial photosystem I tetramer2020

    • 著者名/発表者名
      Nagao, R., Yokono, M., Ueno, Y., Jiang, T.-Y., Shen, J.-R., Akimoto, S.
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 124 号: 10 ページ: 1949-1954

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.0c01136

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Excitation-energy transfer and quenching in diatom PSI-FCPI upon P700 cation formation2020

    • 著者名/発表者名
      Nagao, R., Yokono, M., Ueno, Y., Shen, J.-R., Akimoto, S.
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 124 号: 8 ページ: 1481-1486

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.0c00715

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure basis for the adaptation and function of chlorophyll f in photosystem I.2020

    • 著者名/発表者名
      Kato K., Shinoda T., Nagao R., Akimoto S., Suzuki T., Dohmae N., Chen M., Allakhverdiev SI., Shen J.-R., Akita F., Miyazaki N., Tomo T.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1038/s41467-019-13898-5

    • NAID

      120006826004

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structure of a cyanobacterial photosystem I tetramer revealed by cryo-electron microscopy2019

    • 著者名/発表者名
      Kato Koji、Nagao Ryo、Jiang Tian-Yi、Ueno Yoshifumi、Yokono Makio、Chan Siu Kit、Watanabe Mai、Ikeuchi Masahiko、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji、Miyazaki Naoyuki、Akita Fusamichi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 4929-4929

    • DOI

      10.1038/s41467-019-12942-8

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Spectral Properties and Excitation Relaxation of Novel Fucoxanthin Chlorophyll a/c-Binding Protein Complexes2019

    • 著者名/発表者名
      Ueno Yoshifumi、Nagao Ryo、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      巻: 10 号: 17 ページ: 5148-5152

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.9b02093

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] pH-Sensing Machinery of Excitation Energy Transfer in Diatom PSI-FCPI Complexes2019

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      巻: 10 号: 13 ページ: 3531-3535

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.9b01314

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 機能構造研究に基づく光合成色素蛋白質の分子進化2021

    • 著者名/発表者名
      長尾遼
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光合成を支える葉緑体色素タンパク質複合体の機能・構造・進化2021

    • 著者名/発表者名
      長尾遼
    • 学会等名
      第23回植物オルガネラワークショップ
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Cryo-EM Structure of the Diatom PSII-FCPII: Insights into the Evolutionary Development of Light-Harvesting Complexes2019

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nagao, Fusamichi Akita, Koji Kato, Takehiro Suzuki, Kentaro Ifuku, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Naoshi Dohmae, Seiji Akimoto, Naoyuki Miyazaki, Jian-Ren Shen
    • 学会等名
      3rd International Solar Fuels Conference (ISF-3) International Conference on Artificial Photosynthesis-2019 (ICARP2019)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural basis of energy harvesting and dissipation in diatom PSII-FCPII2019

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nagao, Fusamichi Akita, Koji Kato, Takehiro Suzuki, Kentaro Ifuku, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Naoshi Dohmae, Seiji Akimoto, Naoyuki Miyazaki, Jian-Ren Shen
    • 学会等名
      9th Asia-Oceania Conference on Photobiology (AOCP2019)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 光化学系膜タンパク質複合体のクライオ電顕構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      長尾遼
    • 学会等名
      第27回「光合成セミナー2019:反応中心と色素系の多様性」
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural basis of energy harvesting and dissipation in diatom PSII-FCPII complexes revealed by cryo-electron microscopy2019

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nagao, Fusamichi Akita, Koji Kato, Takehiro Suzuki, Kentaro Ifuku, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Naoshi Dohmae, Seiji Akimoto, Naoyuki Miyazaki, Jian-Ren Shen
    • 学会等名
      10th-International Meeting Photosynthesis and Hydrogen Energy Research for Sustainability 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 珪藻の光化学系II-集光性タンパク質複合体FCPIIのクライオ電顕構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      長尾 遼、秋田 総理、加藤公児、鈴木健裕、伊福健太郎、内山郁夫、菓子野康浩、堂前直、秋本誠志、宮崎直幸、 沈建仁
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第75回学術講演会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Anabaena sp. PCC 7120由来の光化学系I四量体のクライオ電顕構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      長尾 遼、加藤 公児、蒋天翼、植野嘉文、横野牧生、陳兆傑、渡辺麻衣、池内昌彦、沈建仁、秋本誠志、宮崎直幸、秋田総理
    • 学会等名
      第10回日本光合成学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] Ryo NAGAO WEB site

    • URL

      https://ryoagan.wixsite.com/nagaoryo

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2021-12-27  

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