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一回膜貫通型受容体のシグナル伝達の構造基盤

公募研究

研究領域数理解析に基づく生体シグナル伝達システムの統合的理解
研究課題/領域番号 19H04950
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関東京大学

研究代表者

大戸 梅治  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 准教授 (90451856)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
10,660千円 (直接経費: 8,200千円、間接経費: 2,460千円)
2020年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2019年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
キーワードシグナル伝達 / TLR受容体 / 自然免疫 / クライオ電子顕微鏡 / 膜受容体 / 一回膜貫通型受容体
研究開始時の研究の概要

生体中において一回膜貫通型受容体は種々の局面で重要な役割を果たし、様々な病気の治療薬のターゲットとされている。本課題では,主に全長の一回膜貫通型受容体を用いて、細胞外ドメインと細胞内ドメインの協働性を構造生物学的に明らかにし、リガンド認識とシグナル伝達機構の全貌を明らかにすることを目的とする。本研究は、生体内のシグナル伝達に関する情報を統合して理解しようとする本領域の目的に大きく貢献するものである。

研究実績の概要

生体中において一回膜貫通型受容体は種々の局面で重要な役割を果たしている。例えば免疫において微生物など病原体の構成成分は一回膜貫通型受容体であるToll-like receptors (TLRs)などの病原体センサーによって認識され様々な免疫応答を引き起こす。これら一回膜貫通型受容体は、様々な病気の治療薬のターゲットとされている。しかし、一回膜貫通型受容体の機能発現機構は主に細胞外のシグナル受容ドメインと細胞内のシグナル伝達ドメイン個別に研究されてきた。そのため、細胞外ドメインと細胞内ドメインの間で細胞膜を介してどのような協働性が存在してシグナルが伝達されるのかに関する実験的証拠があまりにも乏しいため、現状では前者と後者の間の関連性はほとんど憶測の域を出ない。本課題では,主に全長の受容体を用いてこの細胞外ドメインと細胞内ドメインの協働性を構造生物学的に明らかにし、真の意味でのリガンド認識とシグナル伝達機構を明らかにすることを目的とする。
今年度は、まずTLR全長の活性化状態のクライオ電子顕微鏡解析を進めた。TLR全長を脂質環境を模したナノディスクに再構成した試料を用いて解析を進めた。その結果、TLR3全長の活性化型2量体を再構成したナノディスク試料について、4オングストロームを超える解像度の密度マップを得ることに成功した。TLR3の細胞外ドメインとリガンドである二本鎖RNAの密度は明瞭に確認することができた。しかし、TLR3の膜貫通領域および細胞内のTIRドメインに関しては密度を確認することができなかった。これは、TLR3の細胞外ドメインが膜に対して柔軟性を有していることを示唆する。クロスリンクにより安定化する、脂質二重膜の膜組成を最適化する、アダプター分子との複合体を形成させる、などしてTLR3の細胞外ドメインと膜貫通領域の間の柔軟性を制限する検討を行い、脂質二重膜上での活性化型のTLR全長の構造解析を目指す。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 3件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Cryo-EM structures of Toll-like receptors in complex with UNC93B12021

    • 著者名/発表者名
      Ishida Hanako、Asami Jinta、Zhang Zhikuan、Nishizawa Tomohiro、Shigematsu Hideki、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Structural & Molecular Biology

      巻: 28 号: 2 ページ: 173-180

    • DOI

      10.1038/s41594-020-00542-w

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The effect of anesthetics on toll like receptor 92020

    • 著者名/発表者名
      Koutsogiannaki Sophia、Bu Weiming、Hou Lifei、Shibamura‐Fujiogi Miho、Ishida Hanako、Ohto Umeharu、Eckenhoff Roderic G.、Yuki Koichi
    • 雑誌名

      The FASEB Journal

      巻: 34 号: 11 ページ: 14645-14654

    • DOI

      10.1096/fj.202000791rr

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural analysis reveals TLR7 dynamics underlying antagonism2020

    • 著者名/発表者名
      Tojo Shingo、Zhang Zhikuan、Matsui Hiroyuki、Tahara Masahiro、Ikeguchi Mitsunori、Kochi Mami、Kamada Mami、Shigematsu Hideki、Tsutsumi Akihisa、Adachi Naruhiko、Shibata Takuma、Yamamoto Masaki、Kikkawa Masahide、Senda Toshiya、Isobe Yoshiaki、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1038/s41467-020-19025-z

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Crystal structure of the FYCO1 RUN domain suggests possible interfaces with small GTPases2020

    • 著者名/発表者名
      Sakurai Shunya、Shimizu Toshiyuki、Ohto Umeharu
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications

      巻: 76 号: 8 ページ: 326-333

    • DOI

      10.1107/s2053230x20009012

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of TEX101, a glycoprotein essential for male fertility, reveals the presence of tandemly arranged Ly6/uPAR domains2020

    • 著者名/発表者名
      Masutani Mamiko、Sakurai Shunya、Shimizu Toshiyuki、Ohto Umeharu
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 594 号: 18 ページ: 3020-3031

    • DOI

      10.1002/1873-3468.13875

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Homeostatic and pathogenic roles of GM3 ganglioside molecular species in TLR4 signaling in obesity2020

    • 著者名/発表者名
      Kanoh Hirotaka、Nitta Takahiro、Go Shinji、Inamori Kei‐ichiro、Veillon Lucas、Nihei Wataru、Fujii Mayu、Kabayama Kazuya、Shimoyama Atsushi、Fukase Koichi、Zonca Asia、Cattaneo Anna、Letizia Marilena、Ciampa Maria、Mauri Laura、Prinetti Alessandro、Sonnino Sandro、Suzuki Akemi、Inokuchi Jin‐ichi et. al.
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: - 号: 12 ページ: 1-20

    • DOI

      10.15252/embj.2019101732

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Rationally Designed Small-Molecule Inhibitors Targeting an Unconventional Pocket on the TLR8 Protein-Protein Interface2020

    • 著者名/発表者名
      Jiang Shuangshuang、Tanji Hiromi、Yin Kejun、Zhang Shuting、Sakaniwa Kentaro、Huang Jian、Yang Yi、Li Jing、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki、Yin Hang
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 63 号: 8 ページ: 4117-4132

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.9b02128

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] UNC93B1による核酸認識TLRの輸送機構の構造基盤2021

    • 著者名/発表者名
      石田英子、浅見仁太、大戸梅治、清水敏之
    • 学会等名
      日本薬学会第141年会(広島)オンライン
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 一回膜貫通型Toll様受容体のリガンド認識とシグナル伝達機構の構造基盤2019

    • 著者名/発表者名
      大戸梅治
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会 第71回日本細胞生物学会 合同年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ZOO systemを用いた自動回折データ収集の実際2019

    • 著者名/発表者名
      大戸梅治
    • 学会等名
      第11回SPring-8ユーザー共同体(SPRUC)放射光構造生物学研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~kouzou/index.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2021-12-27  

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