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ニューラルネットワークによる神経ネットワークの動作原理の解明

公募研究

研究領域人工知能と脳科学の対照と融合
研究課題/領域番号 19H04980
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関東京大学

研究代表者

飯野 雄一  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (40192471)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円)
2020年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2019年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワード線虫C.elegans / 神経ネットワーク / カルシウムイメージング / ニューラルネットワークモデル / 神経活動 / 確率的モデル / 神経ネッワーク
研究開始時の研究の概要

本研究では、神経結合ネットワークが解明されている線虫C.エレガンスを用い、立体観測用の顕微鏡で頭部の全神経細胞の活動を時間を追って測定する。測定した結果を計算機上のニューラルネットワークモデルで学習させることにより、神経活動を予測するモデルを作製する。ニューラルネットワークの構造と予測性能の関係をさまざまな側面から検討する。さらに、実際の神経結合ネットワークを模したニューラルネットワークを作製することにより、実際の生物が持つ神経回路の構造がいかに最適化されているかを理解する。

研究実績の概要

本研究は動物の脳の実際の神経回路がどのようにネットワークとして動作しているのかを人工ニューラルネットワークと対比しそれを使いながら再現することを目的とした。
そのために、302個の神経細胞からなる全ネットワークが解明されている線虫C.エレガンスを用い、タンパク質コード型カルシウムレポーター(GECI)と4Dイメージングシステムを用いて撮影した頭部の全神経の神経活動を定量化したデータを用いた。個体により異なるが、平均150個程度の神経の活動時系列が得られている。
このデータをいくつかの方法で解析した。まず、独立成分分析により10個の独立成分の線形結合として神経活動を表現し、各神経の成分混合比から情報の流れを推定した。これにより、個体毎に異なる情報源から神経ネットワーク上を情報が流れている様子が伺えた。また、多変量の時系列を力学系とみなし、2つの神経が同じ力学系に属するか(相互作用しているか)をリカレント解析により検討した。これにより、神経間の相互作用が可視化されるとともに、時間経過により相互作用関係が変化する様子が観察できた。
次に、全結合のニューラルネットワークモデルにより全神経の過去の神経活動値から各神経の未来の活動値を推定する学習を行わせた。その結果、神経により異なるがよい推定を与える神経活動モデルを得ることができた。ニューラルネットワークモデルが神経活動をよく記述することが伺えた。
最後に、同じ課題設定について、カーネル法を用いた非線形次元削減を行い、さらには確率モデルを仮定することにより、神経系の確率的挙動を含めたモデルを作成した。この確率的生成モデルが自発的かつ同期した神経活動を再現することがわかった。実際の神経活動を模したシミュレーションを行うことができたことで、基本的な神経系の動作原理が推定された。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Roles of the ClC chloride channel CLH-1 in food-associated salt chemotaxis behavior of C. elegans2021

    • 著者名/発表者名
      Park Chanhyun、Sakurai Yuki、Sato Hirofumi、Kanda Shinji、Iino Yuichi、Kunitomo Hirofumi
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 10 ページ: 1-27

    • DOI

      10.7554/elife.55701

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Neuron ID dataset facilitates neuronal annotation for whole-brain activity imaging of C. elegans2020

    • 著者名/発表者名
      Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto, Chanhyun Park, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida & Yuichi Iino
    • 雑誌名

      BMC Biology

      巻: 18 号: 1 ページ: 30-30

    • DOI

      10.1186/s12915-020-0745-2

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Caenorhabditis elegans che-5 is allelic to gcy-222020

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Kunitomo, Yuichi Iino
    • 雑誌名

      MicroPubl Biol.

      巻: 2020 ページ: 313-313

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Caenorhabditis elegans: a model to understand host?microbe interactions2019

    • 著者名/発表者名
      Kumar Arun、Baruah Aiswarya、Tomioka Masahiro、Iino Yuichi、Kalita Mohan C.、Khan Mojibur
    • 雑誌名

      Cellular and Molecular Life Sciences

      巻: 77 号: 7 ページ: 1229-1249

    • DOI

      10.1007/s00018-019-03319-7

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] DAF-16/FOXO Promotes Taste Avoidance Learning Independently of Axonal Insulin-Like Signaling2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Nagashima, Yuichi Iino, Masahiro Tomioka
    • 雑誌名

      PLoS Genet.

      巻: 15 号: 7 ページ: e1008297-e1008297

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1008297

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Multiple Sensory Neurons Mediate Starvation-Dependent Aversive Navigation in Caenorhabditis elegans2019

    • 著者名/発表者名
      Jang MS, Toyoshima Y, Tomioka M, Kunitomo H, Iino Y.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A .

      巻: 116 号: 37 ページ: 18673-18683

    • DOI

      10.1073/pnas.1821716116

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 線虫の塩走性におけるnlp-3の役割の解明2020

    • 著者名/発表者名
      児玉未来
    • 学会等名
      名 第43回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 線虫C. elegansの神経ネットワークのダイナミクス2019

    • 著者名/発表者名
      飯野 雄一
    • 学会等名
      第90回日本動物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Molecular and neural network mechanisms for the alteration in taste evaluation of C. elegans2019

    • 著者名/発表者名
      Yuichi Iino
    • 学会等名
      48th Naito Conference
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Bio-image informatics for whole-brain activity imaging of C. elegans2019

    • 著者名/発表者名
      Yu Toyoshima
    • 学会等名
      22nd International Worm Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 線虫全脳の機能的イメージングと動態解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島 有
    • 学会等名
      第44回レーザー顕微鏡研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Two distinct sets of chemosensory neurons involved in food-related navigation.2019

    • 著者名/発表者名
      Moonsun Jang
    • 学会等名
      22th International C. elegans Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 飯野研究室

    • URL

      http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JTop.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2021-12-27  

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