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小分子RNAが制御するクロマチンポテンシャルと遺伝子発現

公募研究

研究領域遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル
研究課題/領域番号 19H05268
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

岩崎 由香  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 准教授 (80612647)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円)
2020年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2019年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
キーワード非コードRNA / ゲノム高次構造 / 核局在 / 転写制御 / クロマチン制御 / ヘテロクロマチン形成 / エピゲノム制御 / 時系列変化 / ヘテロクロマチン
研究開始時の研究の概要

正常な細胞活動や疾患の原因として、タンパク質に翻訳されない小さなRNA(小分子RNA)が大きな役割を果たす。そうした小さなRNAの1グループであるpiRNAは、個体発生や生命の次世代継承にとって重大な脅威となるトランスポゾンの転写抑制を行う。我々はこれまでの研究を通して、このpiRNAによるトランスポゾンの転写抑制が、クロマチン凝集を介するものであることを解明してきた。本研究では、piRNAが形成するクロマチン状態の包括的な解析と関連因子のスクリーニングをオミクス解析技術により行い、さらに、個々の因子の詳細な機能解析を生化学実験により行うことで、piRNAによるクロマチンポテンシャルと遺伝子発現の制御機構を明らかにする。

研究実績の概要

本研究では、小分子RNAが制御するクロマチンポテンシャルの全貌と分子機構の詳細を解明を目指している。前年度までの研究成果から、Piwi-piRNAは局所的な標的トランスポゾンの抑制に止まらず、標的トランスポゾン周辺ゲノム領域のヒストン修飾状態、さらにはゲノムの高次構造や核内局在の変化を誘導することで、ゲノムワイドなクロマチンポテンシャルと遺伝子発現を制御することを見出した。本年度は、Piwiタンパク質ノックダウン時に起こるヒストン修飾、核内局在、ゲノム三次元構造など様々な階層での制御が互いにどのような関係性にあるかを解析し、時系列でのヘテロクロマチン形成過程を明らかにした。先行研究にて構築した、Piwi-piRNAによるヘテロクロマチン形成を人工的に再現し、時系列で観察する実験系を用いて(Iwasaki and Murano et al., EMBOJ 2019)、Piwi-piRNAによるトランスポゾンの転写制御は、まずPolIIの制御と活性型ヒストン修飾の除去にはじまり、次にH3K9me3修飾やH1のクロマチン結合が起こるという複数のステップを観察することができた。これを発展させ、piRNA標的ゲノム領域の核内位置関係をOligo-FISH解析により時系列で同定した。加えて、Piwiノックダウン時に観察されるゲノム高次構造の変化は、抑制性ヒストン修飾の変化と相関することを明らかにした。これらの結果から、Piwi-piRNAによる制御は、まず核内配置の変化および活性型ヒストン修飾の除去からはじまり、それがH3K9me3修飾の付加やゲノム三次元構造の変化につながるという段階的なヘテロクロマチン形成を明らかにすることができた。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 6件、 招待講演 4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Hamster PIWI proteins bind to piRNAs with stage-specific size variations during oocyte maturation2021

    • 著者名/発表者名
      Ishino Kyoko、Hasuwa Hidetoshi、Yoshimura Jun、Iwasaki Yuka W、Nishihara Hidenori、Seki Naomi M、Hirano Takamasa、Tsuchiya Marie、Ishizaki Hinako、Masuda Harumi、Kuramoto Tae、Saito Kuniaki、Sakakibara Yasubumi、Toyoda Atsushi、Itoh Takehiko、Siomi Mikiko C、Morishita Shinichi、Siomi Haruhiko
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 49 号: 5 ページ: 2700-2720

    • DOI

      10.1093/nar/gkab059

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Production of functional oocytes requires maternally expressed PIWI genes and piRNAs in golden hamsters2021

    • 著者名/発表者名
      Hasuwa Hidetoshi、Iwasaki Yuka W.、Wan Kin Au Yeung、Ishino Kyoko、Masuda Harumi、Sasaki Hiroyuki、Siomi Haruhiko
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2021.01.27.428354

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Nuclear RNA export factor variant initiates piRNA-guided co-transcriptional silencing2019

    • 著者名/発表者名
      Murano, K., Iwasaki Y.W., Ishizu H., Mashiko, A., Shibuya, A., Kondo, S., Adachi, S., Suzuki, S., Saito, K., Natsume, T., Siomi, M.C., Siomi, H.
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 印刷中 号: 17 ページ: 1-20

    • DOI

      10.15252/embj.2019102870

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Piwi-piRNA mediated silencing induces step-wise nuclear architectural changes2021

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki
    • 学会等名
      JSDB/APDBN Symposium, Virtual conference
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nuclear architectural changes during the establishment of Piwi-piRNA mediated silencing2020

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Regulation of non-coding genome: Transposable element silencing by PIWI-piRNAs2020

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki
    • 学会等名
      ASMI BioInfo Summer 2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Piwi-piRNA silencing-coupled changes of nuclear architecture in Drosophila2019

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki
    • 学会等名
      Chromosome Dynamics Meeting 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Impact of Piwi-piRNA mediated transcriptional silencing on nuclear architecture in Drosophila2019

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Piwi-piRNA silencing-coupled changes of nuclear architecture in Drosophila2019

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki
    • 学会等名
      第21回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ショウジョウバエPiwi-piRNAが制御する核内高次構造」第11回日本RNAi研究会年会2019

    • 著者名/発表者名
      岩崎由香
    • 学会等名
      RNAi研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Piwi-piRNA silencing-coupled changes of nuclear architecture in Drosophila2019

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki
    • 学会等名
      International Symposium for Female Researchers in Chromatin Biology
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Piwi-piRNA silencing-coupled changes of nuclear architecture in Drosophila2019

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki, Haruhiko Siomi
    • 学会等名
      14th Asia Epigenome Meeting (AEM) / 3rd Taipei Epigenetics and Chromatin Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Piwi-piRNA silencing-coupled changes of nuclear architecture in Drosophila2019

    • 著者名/発表者名
      Yuka W. Iwasaki, Haruhiko Siomi
    • 学会等名
      Keystone Symposia: Small Regulatory RNAs
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 今月のサイエンス

    • URL

      http://www.med.keio.ac.jp/spotlight/2019/11/58-66506/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2021-12-27  

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