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植物における遺伝子内ヘテロクロマチンの制御と機能

公募研究

研究領域遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル
研究課題/領域番号 19H05272
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関沖縄科学技術大学院大学

研究代表者

佐瀬 英俊  沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット, 准教授 (70510006)

研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2021-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2020年度)
配分額 *注記
8,450千円 (直接経費: 6,500千円、間接経費: 1,950千円)
2020年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2019年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
キーワードヘテロクロマチン / トランスポゾン / シロイヌナズナ / イネ / 植物 / エピジェネティクス / 転写
研究開始時の研究の概要

動植物のゲノムでは進化の過程で遺伝子内に大量の転移因子(トランスポゾン)が蓄積されている。興味深いことにこうした遺伝子内転移因子は遺伝子間にある転移因子と同様に、抑制的クロマチン修飾であるヒストンH3K9メチル化やDNAメチル化を受けてヘテロクロマチン化している。しかしながら、転写が活発な遺伝子領域でヘテロクロマチン構造がどのような分子メカニズムで維持されているのか未だ不明な点が多い。本研究では遺伝子領域に存在するヘテロクロマチン制御のメカニズムと、遺伝子発現制御におけるその機能・進化を植物モデルを用いて明らかにすることを目的とする。

研究実績の概要

研究課題名:植物における遺伝子内ヘテロクロマチンの制御と機能
動植物のゲノムでは進化の過程で遺伝子内の非翻訳領域(イントロンやUTR配列)に転移因子(トランスポゾン)が大量に蓄積されている。興味深いことにこうした遺伝子内転移因子(intragenic transposons)は遺伝子間にある転移因子と同様に、抑制的クロマチン修飾であるヒストンH3K9メチル化やDNAメチル化を受けてヘテロクロマチン化している。しかしながら、転写が活発な遺伝子領域のクロマチン環境下でヘテロクロマチン構造がどのような分子メカニズムで維持されているのか 未だ不明な点が多い。本研究計画では遺伝子領域に存在するヘテロクロマチン制御の分子メカニズムと、遺伝子発現制御におけるその機能・進化を植物モデルを用いて明らかにすることを目的としている。2020年度は、シロイヌナズナにおいて遺伝子内ヘテロクロマチンがどのように転写されているかの解析を行った。また、この過程に関与する因子群についての探索を行った。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Transcriptional regulation of genes bearing intronic heterochromatin in the rice genome.2020

    • 著者名/発表者名
      Espinas NA, Tu LN, Furci L, Shimajiri Y, Harukawa Y, Miura S, Takuno S, Saze H
    • 雑誌名

      PloS Genetics

      巻: 16

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 植物における遺伝子内トランスポゾン配列の抑制的クロマチン修飾の維持機構2020

    • 著者名/発表者名
      佐瀬英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 植物ゲノムにおけるトランスポゾン制御と遺伝子の環境応答2019

    • 著者名/発表者名
      佐瀬英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 植物におけるイントロニックトランスポゾンのエピジェネティック制御2019

    • 著者名/発表者名
      佐瀬英俊
    • 学会等名
      日本遺伝学会第91回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2019-07-04   更新日: 2021-12-27  

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