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転写装置によるクロマチン動態制御の解明

公募研究

研究領域遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル
研究課題/領域番号 19H05273
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

前島 一博  国立遺伝学研究所, 遺伝メカニズム研究系, 教授 (00392118)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2020年度)
配分額 *注記
8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円)
2020年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2019年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
キーワードクロマチン / 転写 / イメージング / クロマチン動態
研究開始時の研究の概要

一般に、ゲノムDNAの遺伝情報が読み出される転写が起きる際、DNAを含む高次構造であるヌクレオソームは緩くなり、よりダイナミックに動くと考えられてきた。しかし、研究代表者らは転写を阻害するとDNAの動きが逆に活発化することを見出した。本研究では、RNAポリメラーゼIIや他の転写因子が塊(ハブ)を作ってDNAの動きを抑える可能性を検証する。さらに、ハブを作ることでゲノムDNAが連結されてネットワーク化し、DNAの動きを抑え、効率的に転写を行うモデルを検証する。

研究実績の概要

一般に、ゲノムDNAの遺伝情報が読み出される転写が起きる際、DNAを含む高次構造であるクロマチンは緩くなり、よりダイナミックに動くと考えられてきた。しかし、研究代表者らは転写を阻害するとクロマチンの動きが逆に活発化することを見出した。本研究では、RNAポリメラーゼII(RNAPII)や他の転写因子が塊(ハブ)を作ってクロマチンの動きを抑える可能性を検証した。
転写装置の要であるRNAPIIの除去が、クロマチン動態へ及ぼす影響を計測するため、まずRNAPIIを除去するタイプの転写阻害剤であるα-amanitinでヒトRPE1細胞を処理した。1分子ヌクレオソーム測定で計測すると、ヌクレオソームの動きは上昇した。さらに、遺伝研 鐘巻らの協力でAID法によるRNAPIIの迅速除去をおこなった。その結果でも、ヌクレオソームの動きが顕著に上昇した。一方、転写装置ハブの構成因子候補であるMediatorをAID法を用いて除去しても、ヌクレオソームの動きに変化はなかった。この結果、Mediatorはクロマチンの束縛には関与しないことが示された。さらに、核小体内でrRNAの転写をおこなうRNA ポリメラーゼIの阻害実験をおこない、RNA ポリメラーゼ IとrDNAクロマチンの動きを測定した結果、rRNA転写の際も、RNA Polymerase Iが塊を作り、rDNAクロマチンを束縛していることが明らかとなった

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 4件、 招待講演 5件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] Colorado State University(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Rice University(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Colorado State Univeristy(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Rice University(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] Fluid-like chromatin: Toward understanding the real chromatin organization present in the cell2020

    • 著者名/発表者名
      Maeshima Kazuhiro、Tamura Sachiko、Hansen Jeffrey C.、Itoh Yuji
    • 雑誌名

      Current Opinion in Cell Biology

      巻: 64 ページ: 77-89

    • DOI

      10.1016/j.ceb.2020.02.016

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Heterogeneous fluid-like movements of chromatin and their implications to transcription2020

    • 著者名/発表者名
      Ashwin SS, Maeshima K, Sasai M
    • 雑誌名

      Biophysical Reviews

      巻: 12 号: 2 ページ: 461-468

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00675-8

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Local Chromatin Motion and Transcription2020

    • 著者名/発表者名
      Babokhov Michael、Hibino Kayo、Itoh Yuji、Maeshima Kazuhiro
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 432 号: 3 ページ: 694-700

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2019.10.018

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transcriptional suppression of ribosomal DNA with phase separation.2020

    • 著者名/発表者名
      Ide, T., Ochi, H., Imai, R., Maeshima, K.
    • 雑誌名

      Science Advances.

      巻: 6 号: 42

    • DOI

      10.1126/sciadv.abb5953

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ラミンとクロマチンの連携による核構造の維持メカニズム(Nuclear integrity maintenance by lamin and chromatin)2020

    • 著者名/発表者名
      島本勇太、前島一博
    • 雑誌名

      医学のあゆみ

      巻: 272(2) ページ: 157-161

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] Organization of fast and slow chromatin revealed by single-nucleosome dynamics.2019

    • 著者名/発表者名
      Ashwin, S.S., Nozaki, T., Maeshima, K., Sasai, M.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 116 号: 40 ページ: 19939-19944

    • DOI

      10.1073/pnas.1907342116

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamic chromatin organization without the 30-nm fiber2019

    • 著者名/発表者名
      Maeshima Kazuhiro、Ide Satoru、Babokhov Michael
    • 雑誌名

      Current Opinion in Cell Biology

      巻: 58 ページ: 95-104

    • DOI

      10.1016/j.ceb.2019.02.003

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 遺伝子が転写されるときのヌクレオソームの”動き”を捉えた!2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤か奈、日比野佳代、前島一博
    • 雑誌名

      academist Journal

      巻: -

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] 蛍光マグネシウムイオンプローブの開発とそれを利用した新たな染色体凝縮メカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      前島一博、松田知己、永井健治
    • 雑誌名

      マグネシウム(Journal of Japanese society for Magnesium Research)

      巻: 37 ページ: 13-18

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 転写装置によるクロマチン動態制御の解明2021

    • 著者名/発表者名
      前島一博
    • 学会等名
      新学術領域研究クロマチン潜在能Farewell Mini-symposium
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Local chromatin motion in living human cells revealed by single nucleosome imaging2020

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      The 79th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association Symposium on “4D Nucleome in cancer” Hiroshima
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Toward understanding the real chromatin organization present in the cell2020

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      58th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 転写装置によるクロマチン動態制御2020

    • 著者名/発表者名
      前島一博
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会シンポジュウム「クロマチンポテンシャルの階層縦断的研究」
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Chromosome Organization in Living Human Cells Revealed by Single Nucleosome Imaging.2020

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      2020 Telluride Workshop on Physical Genomics and Transcriptional Engineering
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Chromosome organization in living cells revealed by single nucleosome imaging.2019

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      42th Molecular Biology Society of Japan Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chromatin dynamics and transcription2019

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      57th Biophysical Society of Japan Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chromosome organization in living human cells revealed by single nucleosome imaging.2019

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      Joint 12th EBSA-10th ICBP-IUPAP Biophysics Congress
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Chromosome organization in living human cells revealed by single nucleosome imaging.2019

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      Francois Jacob Conference “Evolution, Structure and Function of Chromosomes High Order Structure”
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] 現代化学増刊46「相分離生物学の全貌」2020

    • 著者名/発表者名
      井手聖、前島一博
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      東京化学同人
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2021-12-27  

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