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光可逆的蛋白質ラベル化技術に基づく蛋白質分解の時空間制御

公募研究

研究領域ケモテクノロジーが拓くユビキチンニューフロンティア
研究課題/領域番号 19H05284
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関東北大学

研究代表者

水上 進  東北大学, 多元物質科学研究所, 教授 (30420433)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
8,060千円 (直接経費: 6,200千円、間接経費: 1,860千円)
2020年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2019年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
キーワード蛋白質分解 / PROTAC / フォトスイッチ化合物 / 蛋白質ラベル化技術 / フォトスイッチ / ユビキチン / 光制御 / ユビキチン化
研究開始時の研究の概要

本研究では、研究代表者らが最近開発したリガンドの結合/ 解離を光制御が可能な蛋白質ラベル化技術をユビキチン研究に応用し、生細胞内に発現する標的蛋白質を高い時空間分解能で分解する技術の開発を行う。光を用いることで、細胞内の標的蛋白質を特定のタイミングで特定の細胞あるいは細胞内の特定のオルガネラや部位のみで分解することができる。この蛋白質ラベル化技術を、蛋白質分解制御技術( PROTACs およびSNIPERs)と融合させることで定量的かつ時空間的な機能解析が可能となり、ユビキチンシステムの理解を目指す多様な研究への展開が可能となる。

研究実績の概要

ユビキチン-プロテアソームシステム(UPS)を利用して細胞内蛋白質を選択的に分解するPROTACs やSNIPERs などのシステムは、標的タンパク質に結合するリガンドとE3リガーゼに結合するリガンドを連結した二官能性分解誘導剤を用いて、標的蛋白質のポリユビキチン化ならびに分解を誘導する。近年、これらのシステムの創薬応用も始まっているが、最適な分解誘導剤濃度は細胞種やトランスポーター発現量など様々な要因で変動する為、分解の精密制御は必ずしも容易ではなく、細胞内局所での標的蛋白質分解や、細胞ごとに異なるタイミングでの分解制御等の高次応用は達成されていない。そこで、本研究ではUPS を利用した蛋白質分解を可逆的に光制御する技術を開発することを目的に研究を行った。本年度は細胞内で標的とするeDHFRの分解を引き起こすPROTACの作製を行った。ユビキチンE3リガーゼの一つCRBNの基質であるレナリドミドとeDHFRの基質トリメトプリム(TMP)を適当な長さのリンカーでつないだ二官能性リガンド(PROTAC)を合成し、eDHFRの安定発現細胞株の培養液に添加し、ウェスタンブロットによりeDHFRの分解を調べた。その結果、リンカー長に依存して分解活性が変化するものの、十分な分解活性を示すPROTACが得られた。別途開発中のeDHFRのフォトスイッチリガンドとレナリドミドを連結した光応答性PROTACについては現在合成中である。その他、非可逆的に光で活性化する蛋白質ラベル化技術を開発し、細胞内で標的蛋白質を光連結する細胞内局所に局在化させる技術を開発し、論文発表並びにプレス発表を行った。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 1件、 招待講演 3件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Protocol for synthesis and use of a turn-on fluorescent probe for quantifying labile Zn2+ in the Golgi apparatus in live cells2021

    • 著者名/発表者名
      Kowada Toshiyuki、Watanabe Tomomi、Liu Rong、Mizukami Shin
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 2 号: 2 ページ: 100395-100395

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2021.100395

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Optical Manipulation of Subcellular Protein Translocation Using a Photoactivatable Covalent Labeling System2021

    • 著者名/発表者名
      Kowada Toshiyuki、Arai Keisuke、Yoshimura Akimasa、Matsui Toshitaka、Kikuchi Kazuya、Mizukami Shin
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 60 号: 20 ページ: 11378-11383

    • DOI

      10.1002/anie.202016684

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative Imaging of Labile Zn2+ in the Golgi Apparatus Using a Localizable Small-Molecule Fluorescent Probe2020

    • 著者名/発表者名
      Kowada Toshiyuki、Watanabe Tomomi、Amagai Yuta、Liu Rong、Yamada Momo、Takahashi Hiroto、Matsui Toshitaka、Inaba Kenji、Mizukami Shin
    • 雑誌名

      Cell Chemical Biology

      巻: 27 号: 12 ページ: 1521-1531

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2020.09.003

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞機能を探索するための 光応答性プローブの開発2021

    • 著者名/発表者名
      水上進
    • 学会等名
      日本薬学会第141年会一般シンポジウム「タンパク質高速分子動画に向けた光薬理学の新展開」
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 蛋白質ラベル化に基づく 細胞内分子の計測と制御2021

    • 著者名/発表者名
      水上進
    • 学会等名
      新学術領域「生命金属科学」領域会議第1回地方巡業(仙台)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Subcellular Labeling Performances of Tetrazine-trans-Cyclooctene Cycloadditions and Their Products2020

    • 著者名/発表者名
      Ira Novianti, Toshiyuki Kowada, Shin Mizukami
    • 学会等名
      第20回東北大学多元物質科学研究所研究発表会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Escherichia coli dihydrofolate reductase-selective photoswitchable inhibitors enabling reversible optical control of protein labeling2020

    • 著者名/発表者名
      Himadri Sekhar Sarkar, Takato Mashita, Toshiyuki Kowada, Ming Ming Yem, Satoshi Watanabe, Kenji Inaba, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      第20回東北大学多元物質科学研究所研究発表会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 光可逆的な蛋白質ラベル化を可能とするリガンドの開発2020

    • 著者名/発表者名
      間下 貴斗, 小和田 俊行, SARKAR S. Himadri, 高橋 泰人, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第31回万有仙台シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 標的タンパク質への親和性を光制御可能なフォトクロミックリガンドの開発2020

    • 著者名/発表者名
      間下 貴斗, 小和田 俊行, Himadri S. SARKAR, 高橋 泰人, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第14回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 光応答性タンパク質ラベル化リガンドの開発2020

    • 著者名/発表者名
      間下 貴斗, 小和田 俊行, SARKAR Himadri S., 高橋 泰人, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      日本化学会 第100春季年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質ラベル化技術を用いた生体分子の可視化と機能制御2019

    • 著者名/発表者名
      水上 進
    • 学会等名
      32回XFEL構造生物学ミーティング
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光可逆的な蛋白質ラベル化技術を指向した機能性小分子の開発2019

    • 著者名/発表者名
      間下 貴斗, 小和田 俊行, 高橋 泰人, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      生体機能関連化学部会若手の会 第31回サマースクール
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Development of photoswitchable compounds that selectively bind to Escherichia coli dihydrofolate reductase2019

    • 著者名/発表者名
      Takato Mashita, Toshiyuki Kowada, Hiroto Takahashi, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      Tohoku University's Chemistry Summer School 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 光可逆的蛋白質ラベル化を可能とする生体直交性リガンドの開発2019

    • 著者名/発表者名
      間下 貴斗, 小和田 俊行, 高橋 泰人, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第13回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 光活性化型タンパク質ラベル化技術を用いた生体分子の局在制御2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木 理志, 小和田 俊行, 荒井 啓介, 吉村 彰真, 松井 敏高, 菊地 和也, 水上 進
    • 学会等名
      第13回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 機能性分子ラベル化に基づく細胞機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      水上 進
    • 学会等名
      ダイナミック・アライアンス 生命機能 物質・デバイスシステム G3分科会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Development of photochromic ligands that enable photoreversible protein labeling2019

    • 著者名/発表者名
      Takato Mashita, Toshiyuki Kowada, Hiroto Takahashi, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      Chemical Biology and Physiology Conference 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 東北大学多元物質科学研究所細胞機能分子化学研究分野

    • URL

      http://www2.tagen.tohoku.ac.jp/lab/mizukami/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
  • [備考] プレスリリース:光と分子を使って生きた細胞内の蛋白質を自在に連結

    • URL

      http://www2.tagen.tohoku.ac.jp/lab/news_press/20210408/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2021-12-27  

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