公募研究
新学術領域研究(研究領域提案型)
本研究の目的はY 染色体ハプログループを解析することで、ヤポネシア男性の起源・成立を明らかにすることである。目的達成のため以下の研究を行う。１）Y 染色体ハプログループを更新し、各ハプログループの分布調査を行う。２）Y 染色体ハプログループと全ゲノム解析によるデータから、ハプログループ毎のクラスター分類を行う。３）Y染色体ハプログループ毎のY染色体の構造解析を行う。
現代日本人のY染色体ハプログループ解析及びY染色体ハプログループとY染色体構造解析によるY染色体の進化について解析することで、ヤポネシア男性が辿ってきた道筋を明らかにすることを目的とし、以下の研究を行った。1)現代日本人のY染色体ハプログループ解析：日本人男性106サンプルについてY染色体ハプログループの更新を行った。旧C1はC1a1a1に、旧C3はC2b1aの下流の5グループ及びC2b1bの下流の2グループに分類された。旧D2*はD1a2a1cの下流の７グループ及びD1a2a2の下流の4グループに分類された。旧D2a1はD1a2a2aの下流の8グループに分類された。旧O2b*は4グループに、旧O2b1は5グループに分類された。また、旧O3a3cは4グループに、旧O3a4は3グループに分類された。2)Y染色体ハプログループとY染色体構造解析によるY染色体の進化：日本人において比較的頻度が高いY染色体ハプログループD1a2、C、O1b2、O2a2b1、O2a1bは例外があるものの同一の構造パターンを示したことから、それぞれ共通の先祖から由来していると考えられる。一方、頻度が低いK、O1a、O1b1a1a1、O2は多数の構造パターンを示したことから、それぞれ異なった先祖由来であり比較的最近日本に流入したと示唆される。3)Y染色体ハプログループと全ゲノム解析によるクラスター分類：811人のヤポネシア男性について、SNPアレイを用いて全ゲノムジェノタイピングを行った。得られたデータを使用してY染色体ハプログループ間で主成分分析を行ったが特に違いはみられなかった。しかし、各ハプログループの推定発生時期に関して解析を行うとゲノムワイドな有意水準を満たす領域が同定された。
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
すべて 2021 2020 2019 その他
すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 備考 (2件)
Journal of Human Genetics
巻: 65 号: 8 ページ: 683-691
10.1038/s10038-020-0757-3
J Hum Genet
巻: -
120006894346
細胞
巻: 51 ページ: 38-40
40022118967
アグリバイオ
巻: 3 ページ: 81-84
https://www.tokushima-u.ac.jp/ph/faculty/labo/inf/
