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熱エネルギーを電気エネルギーに変換する分子機構の動的解明

公募研究

研究領域発動分子科学:エネルギー変換が拓く自律的機能の設計
研究課題/領域番号 19H05387
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関福井大学

研究代表者

清水 啓史  福井大学, 学術研究院医学系部門, 講師 (50324158)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2020年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2019年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワード1分子計測 / 蛋白質 / X線回折 / X線回折
研究開始時の研究の概要

本研究ではX線1分子動態計測法を用いて、生体で熱エネルギーが電気エネルギーに変換される際の分子機構を解明することを目指す。X線1分子動態計測法では高い時間空間分解能で生体分子の分子揺らぎや構造変化を捉えることができる。温度刺激を電気信号に変換する温度センサー蛋白質を観測対象として、温度によってどのように蛋白質分子の機能が活性化されるか、動的な側面から明らかにすることを目指す。

研究実績の概要

本研究ではX線1分子動態計測法を用いて、生体で熱エネルギーが電気エネルギーに変換される際の分子機構を解明することを目指した。X線1分子動態計測法では高い時間空間分解能で生体分子の分子揺らぎや構造変化を捉えることができる。温度刺激を電気信号に変換する温度センサー蛋白質を観測対象として、温度によってどのように蛋白質分子の機能が活性化されるか、動的な側面から明らかにすることを目指して研究を行った。
金ナノ結晶を観測プローブとして蛋白質分子の1分子構造変化を捉える、X線1分子動態計測法を用いて、蛋白質の動きと温度の関連を調べた。標的分子として、温度によって活性化されるTRPチャネル(TRPM8, TRPA1, TRPV1, TRPV2)のうち、温度感受域の異なるいずれか2種を標的分子として温度変化に対する1分子動態応答を計測することを目指した。また、研究代表者が従来より1分子動態計測に取り組んできた、溶液pHによって活性が制御されるKcsAカリウムイオンチャネルの1分子構造変化に対する温度の影響を測定した。
令和2年度は令和元年度に構築したTRPV1の1分子動態計測システムを用いて、条件検討を行い、適切な観測条件でのデータ蓄積・解析を行った。また、別の温度域で活性化される分子の発現系を構築し、スクリーニングを行った。本研究の1分子動態計測データの一部をイオンチャネル研究会、中部生理学会で発表し、現在論文化を目指している。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Diffracted X-ray tracking method for recording single-molecule protein motions2019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hirofumi
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      巻: in press 号: 2 ページ: 129361-129361

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2019.05.004

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] イオンチャネル構造遷移過程のX線1分子動画計測2020

    • 著者名/発表者名
      清水啓史
    • 学会等名
      生理研研究会「イオンチャネルと生体膜のダイナミクス:構造生物学の先にあるもの」
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] X線1分子動態計測法の開発2020

    • 著者名/発表者名
      清水啓史
    • 学会等名
      第67回中部生理学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] SINGLE-MOLECULE TWISTING MOTIONS DURING GATING OF THE HUMAN TRPV1 CHANNEL RECORDED WITH SUB-MILLISECOND TIME RESOLUTION.2020

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Shimizu, Takuya Kobayashi, Masayuki Iwamoto, Kentaro Kajiwara, Nagomi Kurebayashi, Haruo Ogawa, Takashi Murayama.
    • 学会等名
      64th Annual Meeting of Biophysical Society
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural Analysis of KcsA by Cryo-EM Single Particle Analysis2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroko Takasaki, Hirofumi Shimizu, Takuo Yasunaga
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Structural analysis of KcsA potassium channel by Cryo-EM.2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroko Takazaki, Hirofumi Shimizu, Takuo Yasunaga.
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会生体解析分科会 Frontiers in Cellular, Viral and Molecular Microscopy with Cryo-specimen Preparation Techniques
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 「クライオ電子顕微鏡単粒子解析法を用いたKcsAの構造解析.」2019

    • 著者名/発表者名
      髙﨑寛子, 清水啓史, 安永卓生.
    • 学会等名
      第61回日本顕微鏡学会九州支部集合・学術講演会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 「X 線1 分子動態計測法に適する新たなターゲット分子の探索」2019

    • 著者名/発表者名
      清水啓史
    • 学会等名
      第4回イオンチャネル研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Microfabricated Solution Chamber for High Resolution Diffracted X-ray Tracking Method to Observe Ion Channel Gating Motion2019

    • 著者名/発表者名
      Ikkei Yamauchi, Tomoki Tabuchi, Yoshikazu Hirai, Masayuki Iwamoto, Toshiyuki Tsuchiya, Hirofumi Shimizu, and Osamu Tabata
    • 学会等名
      Transducers 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 「イオンチャネルの開閉機構観察のための高解像度X 線一分子動態計測用溶液チャンバの開発」2019

    • 著者名/発表者名
      山内一慶,田渕友樹,平井義和,岩本真幸,土屋智由,清水啓史,田畑修
    • 学会等名
      CHEMINAS39
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 福井大学統合生理学

    • URL

      https://www.med.u-fukui.ac.jp/laboratory/integrative/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-04-18   更新日: 2021-12-27  

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