| 研究領域 | 代謝アダプテーションのトランスオミクス解析 |
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| 研究課題/領域番号 |
20H04848
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| 研究種目 |
新学術領域研究(研究領域提案型)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 審査区分 |
生物系
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| 研究機関 | 中央大学 |
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研究代表者 |
田口 善弘 中央大学, 理工学部, 教授 (30206932)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2022-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2021年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
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| キーワード | テンソル分解 / 変数選択 / マルチオミクス / 教師無し学習 / インシリコ創薬 / 腎臓がん / 前立腺がん / 教師なし学習 / マルチオミックスオミックス |
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| 研究開始時の研究の概要 |
研究目的に書いた通り、「『テンソル分解を用いた教師無し学習による変数選択法』を用いて、トランスオミクスの研究を行うこと」である。
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| 研究実績の概要 |
テンソル分解を用いた教師無し学習による変数選択法について複数の原著論文を刊行することができた。また以下の２つのパッケージをRのパッケージリポジト
リであるBioconductorで公開した。TDbasedUFE https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/TDbasedUFE.html
TDbasedUFEad https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/TDbasedUFEadv.html
これらのパッケージを用いて提案手法をより簡単に使えるようになった。Bioconductorは２０年以上の歴史がある世界的に有名なパッケージリポジトリであり、ここに複数のパッケージを公開することは厳正なレビューを通過しなくてはいけないこともあり非常に有意義なことである。また、このリポジトリに収録されることで世界中から多くのアクセスが見込まれ手法が広く使われて世界に広まることが期待できる。
これらのパッケージの内容の元になった論文を複数個、年度内に出版することにも成功しており、この点からも十分な成果が上がっていると考えることが可能である。また、これらに関係する発表も多数行っておりこれもまた成果に繋がっていると考えられるので十分な成果が上がっていると考えて問題ないと考えている。今後このパッケージが広く使われることで成果が世界的な物になっていくことが期待される。これとは別にINCOB2022で研究成果を発表し、パッケージの有効性が宣伝できた。また国内の研究会などでも研究成果を発表する機会に恵まれた。以上が今年度における成果の概要である。
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| 現在までの達成度 (段落) |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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