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傷害に応答した幹細胞新生におけるヒストン修飾変化の作動原理

公募研究

研究領域植物の生命力を支える多能性幹細胞の基盤原理
研究課題/領域番号 20H04892
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関基礎生物学研究所

研究代表者

石川 雅樹  基礎生物学研究所, 生物進化研究部門, 助教 (00586894)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円)
2021年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2020年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
キーワードヒメツリガネゴケ / 転写因子 / ヒストン修飾 / DNA損傷 / 幹細胞 / リプログラミング / DNA修復 / オーキシン / DNA損傷・修復
研究開始時の研究の概要

陸上植物は、傷害刺激に応答して分化細胞から幹細胞を新生させ、新しい器官や個体を再生させることがある。しかしながら、どのようにして傷害刺激が分化状態を維持しているクロマチン修飾を変化させ幹細胞を新生させるのか、その分子機構は謎である。ヒメツリガネゴケのSTEMIN1転写因子は、傷害刺激に応答して発現するだけでなく、人為的に発現させるだけで葉細胞を幹細胞へと変化させる。本研究では、傷害刺激によるSTEMIN1遺伝子の発現制御、および、STEMIN1によるクロマチン修飾変化を引き起こす分子機構を明らかにすることで、傷害誘導性の幹細胞新生におけるクロマチン修飾変化を作動させる分子基盤の解明を目指す。

研究実績の概要

ヒメツリガネゴケのSTEMIN1転写因子は傷害刺激に応答して発現し、葉細胞を幹細胞化させる。本研究では傷害によるSTEMIN1遺伝子発現制御機構、およびSTEMIN1によるクロマチン修飾変化を作動させる分子機構を明らかにするため、本年度では以下の研究を行なった。
(1)DNA塩基除去修復に関わるXRCC1遺伝子を欠失させると、STEMIN1発現誘導による幹細胞化が有意に遅れる。そこでDNA修復とクロマチン修飾の関係を調べるため、XRCC1遺伝子を欠失させたSTEMIN1発現誘導株を使ったChIP-seqおよびRNA-seq解析を計画した。その予備実験として、STEMIN1標的遺伝子の一つCYCD遺伝子のH3K27me3修飾レベルとその遺伝子発現レベルの変化ついて調べたところ、想定に反して、野生型にSTEMIN1を発現誘導したときの転写抑制に機能するヒストンH3(H3K27me3)修飾レベル、遺伝子発現レベルの変化に違いがなかった。そこで、STEMIN1による幹細胞化の機能解析に焦点をあてるため、(3)の実験に集中した。
(2)改良したR2D2オーキシンセンサーラインを用いて、ヒメツリガネゴケの切断葉のオーキシンレベル変化を調べたところ、幹細胞化する細胞でオーキシンレベルが一過的に減少し、原糸体細胞になると、そのレベルが回復することが分かった。
(3)STEMIN1転写因子は、直接の標的遺伝子上にあるH3K27me3修飾を細胞分裂前に減少させ、これらの遺伝子発現を誘導し、分化細胞から幹細胞へと変化させる。そこで、STEMIN1と結合する因子を近位ビオチン化ラベル法を用いて探索したところ、複数のヒストン修飾変化を制御する因子の同定に成功した。今後、これらの因子とSTEMIN1の関係を明らかにすることで、幹細胞化におけるH3K27me3修飾変化の分子機構解明に繋がることが期待される。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 3件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件、 招待講演 5件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] Univ.of Copenhagen(デンマーク)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Huazhong Agricultural Univ.(中国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Acad. Sci. of Czech Republic(チェコ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Huazhong Agricultural Univ.(中国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Acad. Sci. of Czech Republic(チェコ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Univ. of Copenhagen(デンマーク)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] A PSTAIRE-type cyclin-dependent kinase controls light responses in land plants2022

    • 著者名/発表者名
      Bao Liang、Inoue Natsumi、Ishikawa Masaki、Gotoh Eiji、Teh Ooi-Kock、Higa Takeshi、Morimoto Tomoro、Ginanjar Eggie Febrianto、Harashima Hirofumi、Noda Natsumi、Watahiki Masaaki、Hiwatashi Yuji、Sekine Masami、Hasebe Mitsuyasu、Wada Masamitsu、Fujita Tomomichi
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 8 号: 4 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1126/sciadv.abk2116

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Molecular mechanisms of reprogramming of differentiated cells into stem cells in the moss Physcomitrium patens2022

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa Masaki、Hasebe Mitsuyasu
    • 雑誌名

      Current Opinion in Plant Biology

      巻: 65 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2021.102123

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Overexpression of ATG8/LC3 enhances wound-induced somatic reprogramming in Physcomitrium patens2021

    • 著者名/発表者名
      Kanne Jakob V.、Ishikawa Masaki、Bressendorff Simon、Ansbol Jeppe、Hasebe Mitsuyasu、Rodriguez Eleazar、Petersen Morten
    • 雑誌名

      Autophagy

      巻: Online ahead of print 号: 6 ページ: 1-4

    • DOI

      10.1080/15548627.2021.1975913

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Plant stem cell research is uncovering the secrets of longevity and persistent growth2021

    • 著者名/発表者名
      Umeda Masaaki、Ikeuchi Momoko、Ishikawa Masaki、Ito Toshiro、Nishihama Ryuichi、Kyozuka Junko、Torii Keiko U.、Satake Akiko、Goshima Gohta、Sakakibara Hitoshi
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: Online ahead of print 号: 2 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1111/tpj.15184

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] DNA damage triggers reprogramming of differentiated cells into stem cells in Physcomitrella2020

    • 著者名/発表者名
      Gu Nan、Tamada Yosuke、Imai Akihiro、Palfalvi Gergo、Kabeya Yukiko、Shigenobu Shuji、Ishikawa Masaki、Angelis Karel J.、Chen Chunli、Hasebe Mitsuyasu
    • 雑誌名

      Nature Plants

      巻: 6 号: 9 ページ: 1098-1105

    • DOI

      10.1038/s41477-020-0745-9

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 植物の分化細胞を幹細胞へと変化させるSTEMIN転写因子とクロマチン修飾変化2020

    • 著者名/発表者名
      石川雅樹
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 78 ページ: 240-241

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Cellular reprogramming into stem cells as an adaptation to land environments in Physcomitrium patens2022

    • 著者名/発表者名
      Masaki Ishikawa and Mitsuyasu Hasebe
    • 学会等名
      PLANT & ANIMAL GENOME XXIX
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Mechanisms underlying stem cell formation in the moss Physcomitrium patens2021

    • 著者名/発表者名
      Masaki Ishikawa
    • 学会等名
      Secrets of stem cells underlying longevity and persistent growth
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 陸上植物の幹細胞新生を制御する分子機構2021

    • 著者名/発表者名
      石川雅樹
    • 学会等名
      第14回 日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 器官再生の鍵を握るエピゲノムの再構築2020

    • 著者名/発表者名
      石川雅樹、青山剛士、長谷部光泰
    • 学会等名
      日本植物学会 第84回大会 オンライン
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Molecular mechanisms underlying stem cell formation in plants.2020

    • 著者名/発表者名
      Masaki Ishikawa
    • 学会等名
      The JSDB online trial meeting
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Toward characterising the functional role of PpXRCC1 in Physcomitrella cellular reprogramming2020

    • 著者名/発表者名
      Villers, R.M.D., Ishikawa, M., Hasebe, M
    • 学会等名
      日本植物学会 第84回大会 オンライン
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ABCB14 regulates local cell growth in Physcomitrella patens2020

    • 著者名/発表者名
      Zhang, L., Aoyama, T., Murata, T., Kosetsu, K., Kabeya, Y., Ishikawa, M., Hasebe, M
    • 学会等名
      日本植物学会 第84回大会 オンライン
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケの茎葉体における細胞分裂軸制御機構の解析2020

    • 著者名/発表者名
      幸節健、堀内雄太、玉田洋介、石川雅樹、壁谷幸子、小藤累美子、長谷部光泰
    • 学会等名
      日本植物学会 第84回大会 オンライン
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] GRAS 転写因子によるヒ メツリガネゴケ葉原基の細胞分裂軸制御2020

    • 著者名/発表者名
      堀内雄太, 藤原彩香, 藤本直也, 中村亮, 吉田彩子, 幸節健, 壁谷幸子, 石川雅樹, 玉田洋介, 藤本仰一、長谷部光泰、小藤累美子
    • 学会等名
      日本植物学会 第84回大会 オンライン
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 基礎生物学研究所 生物進化研究部門

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/sections/evolutionary_biology_and_biodiversity/hasebe/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [備考] 基礎生物学研究所 生物進化研究部門 長谷部研究室

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/evodevo/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2022-12-28  

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