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光合成超複合体のエネルギー伝達機構の解明

公募研究

研究領域光合成分子機構の学理解明と時空間制御による革新的光ー物質変換系の創製
研究課題/領域番号 20H05109
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

川上 恵典  国立研究開発法人理化学研究所, 放射光科学研究センター, 研究員 (40619904)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード光合成 / 光捕集 / フィコビリソーム / クライオ電子顕微鏡 / 単粒子構造解析 / 構造生物化学 / 光エネルギー / 電子顕微鏡
研究開始時の研究の概要

本研究は、温泉に生息する好熱性シアノバクテリアのフィコビリソーム(PBS)及びPBS-光化学系超複合体(PBS-PSIIとPBS-PSI)の高分解能クライオ電子顕微鏡解析を行うことでそれらの立体構造を解析し、藻類の高効率な光エネルギー伝達様式を解明することが目的である。このため、PBS及びPBSを構成するフィコシアニン(PC)複合体、PBS-光化学系超複合体(PBS-PSIIとPBS-PSI)の試料調製とそれらのクライオ電子顕微鏡解析を進めていく。本研究で得られた知見を人工光合成研究に取り組むことによって、高効率光エネルギー伝達システムの構築を進めていくことができると期待される。

研究実績の概要

シアノバクテリア・紅藻・灰色藻といった多くの藻類は、光合成の初期反応において太陽光エネルギーを集光性アンテナタンパク質(LHC)によって吸収し、その後水分子を分解して酸素と電子、そしてプロトンを放出する。フィコビリソーム(PBS)は多くの藻類がもつ巨大な光捕集アンテナタンパク質であり、吸収した光エネルギーを光化学系蛋白質(光化学系IとII)に伝達する。本研究では、好熱性シアノバクテリア由来PBSの立体構造とその内部のエネルギー伝達様式を明らかにし、さらにPBSとPSIIの相互作用を解析するため、まずはPBSの中心部位(PBS core)とアンテナ部位に相当するフィコシアニンロッド(PC rod)の構造解析を行った。
クライオ電子顕微鏡を用いた単粒子構造解析によって、好熱性シアノバクテリア由来のPBS coreとPC rodの構造をそれぞれ3.7 Åと4.2 Å分解能で解析した。PBS coreはアロフィコシアニン蛋白質群(ApcA, ApcB, ApcC, ApcD, ApcE, ApcF)で構成され、ApcEとApcDはリンカー蛋白質と呼ばれる光化学系蛋白質にエネルギー伝達を行う重要なサブユニットである。本研究では、これらのサブユニットの配置とその詳細な相互作用を明らかにすることができた。
そしてPCロッドの単粒子構造解析から、PC内部に結合するリンカータンパク質(CpcD, CpcC, CpcG)の配置を明らかにし、これらリンカータンパク質によってPCロッド内の相互作用が大きく変化していることが明らかとなった。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 2件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Structural basis for the absence of low-energy chlorophylls in a photosystem I trimer from Gloeobacter violaceus2022

    • 著者名/発表者名
      Kato Koji、Hamaguchi Tasuku、Nagao Ryo、Kawakami Keisuke、Ueno Yoshifumi、Suzuki Takehiro、Uchida Hiroko、Murakami Akio、Nakajima Yoshiki、Yokono Makio、Akimoto Seiji、Dohmae Naoshi、Yonekura Koji、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 11 ページ: 1-34

    • DOI

      10.7554/elife.73990

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ultrafast energy transfer dynamics of phycobilisome from Thermosynechococcus vulcanus, as revealed by ps fluorescence and fs pump-probe spectroscopies2021

    • 著者名/発表者名
      Hirota Yuma、Serikawa Hiroki、Kawakami Keisuke、Ueno Masato、Kamiya Nobuo、Kosumi Daisuke
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: 148 号: 3 ページ: 181-190

    • DOI

      10.1007/s11120-021-00844-0

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural implications for a phycobilisome complex from the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus2021

    • 著者名/発表者名
      Kawakami Keisuke、Nagao Ryo、Tahara Yuhei O.、Hamaguchi Tasuku、Suzuki Takehiro、Dohmae Naoshi、Kosumi Daisuke、Shen Jian-Ren、Miyata Makoto、Yonekura Koji、Kamiya Nobuo
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1862 号: 9 ページ: 148458-148458

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2021.148458

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure of the far-red light utilizing photosystem I of Acaryochloris marina2021

    • 著者名/発表者名
      Hamaguchi Tasuku、Kawakami Keisuke、Shinzawa-Itoh Kyoko、Inoue-Kashino Natsuko、Itoh Shigeru、Ifuku Kentaro、Yamashita Eiki、Maeda Kou、Yonekura Koji、Kashino Yasuhiro
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 2333-2333

    • DOI

      10.1038/s41467-021-22502-8

    • NAID

      120007032350

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Design of PG-surfactants bearing polyacrylamide polymer chain to solubilize membrane proteins in a surfactant-free buffer2021

    • 著者名/発表者名
      Taro Shimamoto, Tatsuki Nakakubo, Tomoyasu Noji, Shuhei Koeda, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Toshihisa Mizuno
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 号: 4 ページ: 1524-1524

    • DOI

      10.3390/ijms22041524

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Photoprotective Capabilities of Light-Harvesting Complex II Trimers in the Green Alga Chlamydomonas reinhardtii2020

    • 著者名/発表者名
      Kim Eunchul、Kawakami Keisuke、Sato Ryoichi、Ishii Asako、Minagawa Jun
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      巻: 11 号: 18 ページ: 7755-7761

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.0c02098

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photocurrent generation by a photosystem I-NiO photocathode for a p-type biophotovoltaic tandem cell2020

    • 著者名/発表者名
      Yuya Takekuma, Nobuhiro Ikeda, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Mamoru Nango, and Morio Nagata
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 10 号: 27 ページ: 15734-15739

    • DOI

      10.1039/d0ra01793k

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 巨大アンテナ蛋白質フィコビリソームコアの クライオ電子顕微鏡解析2022

    • 著者名/発表者名
      〇川上恵典、浜口祐、広瀬侑、小澄大輔、宮田真人、神谷信夫、米倉功治
    • 学会等名
      新学術領域研究第4回最終公開シンポジウム(ハイブリッド)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Core structure of a thermophilic cyanobacterial light-harvesting phycobilisome2022

    • 著者名/発表者名
      〇川上恵典、浜口祐、広瀬侑、小澄大輔、宮田真人、神谷信夫、米倉功治
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会(オンライン)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Acaryochloris marina由来光化学系I複合体の立体構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      浜口祐、〇川上恵典、伊藤(新澤)恭子、菓子野(井上)名津子、伊藤繁、 伊福健太郎、山下栄樹、前田皐臣、米倉功治、菓子野康浩
    • 学会等名
      第28回「光合成セミナー2021」(オンライン)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 巨大アンテナ蛋白質フィコビリソームコアの クライオ電子顕微鏡解析2021

    • 著者名/発表者名
      〇川上恵典、浜口祐、広瀬侑、小澄大輔、宮田真人、神谷信夫、米倉功治
    • 学会等名
      新学術領域研究 第4回合同班会議
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 光合成タンパク質の精製 とその立体構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      川上恵典
    • 学会等名
      第1回光合成タンパク質勉強会(オンライン)(招待講演)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 蛋白質複合体の立体構造解析とその評価2021

    • 著者名/発表者名
      川上恵典
    • 学会等名
      岡山大学資源植物科学研究所共同研究ワークショップ 「多様な光合成研究による植物の環境応答機構解明への挑戦」
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] 光エネルギー変換における分子触媒の新展開2020

    • 著者名/発表者名
      日本化学会
    • 総ページ数
      224
    • 出版者
      化学同人
    • ISBN
      9784759813982
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 光捕集複合体フィコビリソームの単粒子構造解析

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2021/20210610_4/index.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2022-12-28  

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