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ヒストンバリアントH2A.Z非ゲノム情報の複製における分子機構と制御クロストーク

公募研究

研究領域多様かつ堅牢な細胞形質を支える非ゲノム情報複製機構
研究課題/領域番号 20H05378
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東北大学

研究代表者

原田 昌彦  東北大学, 農学研究科, 教授 (70218642)

研究期間 (年度) 2020-11-19 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
2021年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2020年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
キーワードヒストンバリアント / 細胞核 / クロマチン / 遺伝子発現制御 / ヒストン / エピジェネティクス / 遺伝子発現
研究開始時の研究の概要

ヒストンバリアントのヌクレオソームへの導入が、エピジェネティック制御に重要な役割を果たす。ヒストンバリアントH2A.Zは、ゲノム上の特定領域に導入されて転写制御を行い、発生・分化・細胞がん化にも重要な役割を果たす。H2A.Zは多くの遺伝子のプロモーターに導入され、その導入情報はDNA 複製後も維持されるが、導入位置を決定する機構、および複製後もH2A.Z非ゲノム情報が維持される機構は不明である。そこで本研究では、H2A.Z非ゲノム情報がどのような機構で複製されるか、および H2A.Z非ゲノム情報が他の非ゲノム情報の複製にどのように寄与するか、などについて研究を行う。

研究実績の概要

ヒストンバリアントのクロマチンへの導入は、遺伝子機能の制御に重要なメカニズムの一つである。H2AヒストンのバリアントであるH2A.Zは、ゲノムの特定領域に導入されることで遺伝子の発現制御を行うことが知られている。さらにH2A.Zは、発生・分化・細胞がん化などの高次生命機能の発現にも重要な役割を果たす。しかし、ヒストンバリアントH2A.Zがクロマチン上の特定領域に導入される分子メカニズムや、複製後もこのH2A.Zの非ゲノム情報が維持される機構は不明なままであり、H2A.Zがどのように高次生命機能の制御に関わるかについての分子機構は十分に解明されていない。本研究では、これらの問題の解決を目指し、
H2A.Z遺伝子破壊酵母株やテトラサイクリン誘導的にヒストンバリアントH2A.Z発現をシャットダウンできる脊椎動物培養細胞(DT40細胞)などを用いて解析を開始した。さらに本研究を進める中で開発された、デグロンによって一過的にH2A.Zを分解可能な線虫株を用いた解析も行った。前年度に引き続き、クロマチン免疫沈降法と次世代シークエンサーを用いたChIP-seq法でH2A.Z導入を解析し、外的環境変化に対応した遺伝子発現変化と合わせて解析したところ、H2A.Zが遺伝子発現における環境応答に重要な役割を果たすことが示された。また、線虫株で一過的にH2A.Zを発現して発生を観察することにより、線虫においてH2A.Zが発生や、生殖腺の分化に重要な役割を果たすことが示された。このデグロン分解系を導入した線虫のシステムは、今後、H2A.Zの高次生命機能発現への関与を解析する上で有用であることが示された。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 5件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (32件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] The auxin-inducible degron 2 (AID2) system enables controlled protein knockdown during embryogenesis and development in Caenorhabditis elegans2022

    • 著者名/発表者名
      Negishi T, Kitagawa S, Horii N, Tanaka Y, Haruta N, Sugimoto A, Sawa H, Hayashi KI, Harata M, Kanemaki MT.
    • 雑誌名

      Genetics

      巻: 220 号: 2

    • DOI

      10.1093/genetics/iyab218

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Nucleoskeleton proteins for nuclear dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Miyamoto Kei、Harata Masahiko
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 3 ページ: 237-241

    • DOI

      10.1093/jb/mvab006

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] THz irradiation inhibits cell division by affecting actin dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki S, Ueno Y, Hosoki R, Saito T, Idehara T, Yamaguchi Y, Otani C, Ogawa Y, Harata M, Hoshina H.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 16 号: 8 ページ: e0248381-e0248381

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0248381

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] In Vitro-Evolved Peptides Bind Monomeric Actin and Mimic Actin-Binding Protein Thymosin-beta42021

    • 著者名/発表者名
      Gubeli RJ, Bertoldo D, Shimada K, Gerhold CB, Hurst V, Takahashi Y, Harada K, Mothukuri GK, Wilbs J, Harata M, Gasser SM, Heinis C.
    • 雑誌名

      ACS Chem Biol

      巻: 16 号: 5 ページ: 820-828

    • DOI

      10.1021/acschembio.0c00825

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Modulating dynamics and function of nuclear actin with synthetic bicyclic peptides2021

    • 著者名/発表者名
      Machida N, Takahashi D, Ueno Y, Nakama Y, Gubeli RJ, Bertoldo D, Harata M.
    • 雑誌名

      J Biochem

      巻: 169 号: 3 ページ: 295-302

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa130

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Analysis of the molecular evolution of histone variant H2A.Z using a linker-mediated complex strategy and yeast genetic complementation2021

    • 著者名/発表者名
      Kitagawa Saho、Kusakabe Masayuki、Takahashi Daisuke、Narimiya Takumi、Nakabayashi Yu、Seki Masayuki、Horigome Chihiro、Harata Masahiko
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 86 号: 1 ページ: 104-108

    • DOI

      10.1093/bbb/zbab190

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An improved functional analysis of linker-mediated complex (iFALC) strategy2020

    • 著者名/発表者名
      Nakabayashi Yu、Harata Masahiko、Seki Masayuki
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 526 号: 4 ページ: 1164-1169

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.04.039

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Actin-Family Protein Arp4 Is a Novel Suppressor for the Formation and Functions of Nuclear F-Actin2020

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Shota、Gerhold Christian、Yamamoto Koji、Ueno Yuya、Grosse Robert、Miyamoto Kei、Harata Masahiko
    • 雑誌名

      Cells

      巻: 9 号: 3 ページ: 758-758

    • DOI

      10.3390/cells9030758

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Propagation of THz irradiation energy through aqueous layers: Demolition of actin filaments in living cells2020

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Shota、Harata Masahiko、Ueno Yuya、Tsubouchi Masaaki、Konagaya Keiji、Ogawa Yuichi、Isoyama Goro、Otani Chiko、Hoshina Hiromichi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 9008-9008

    • DOI

      10.1038/s41598-020-65955-5

    • NAID

      120006848270

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Impairment of nuclear F-actin formation and its relevance to cellular phenotypes in Hutchinson-Gilford progeria syndrome2020

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Yuto、Hiratsuka Shogo、Machida Nanako、Takahashi Daisuke、Matsushita Junpei、Hozak Pavel、Misteli Tom、Miyamoto Kei、Harata Masahiko
    • 雑誌名

      Nucleus

      巻: 11 号: 1 ページ: 250-263

    • DOI

      10.1080/19491034.2020.1815395

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] SMARCA4 deficiency-associated heterochromatin induces intrinsic DNA replication stress and susceptibility to ATR inhibition in lung adenocarcinoma2020

    • 著者名/発表者名
      Kurashima K, Kashiwagi H, Shimomura I, Suzuki A, Takeshita F, Mazevet M, Harata M Yamashita T, Yamamoto Y, Kohno T, Shiotani B
    • 雑誌名

      NAR Cancer

      巻: 2 号: 2 ページ: 1-19

    • DOI

      10.1093/narcan/zcaa005

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 細胞内蛋白質に対するテラヘルツ光照射影響2022

    • 著者名/発表者名
      上野佑也、山崎祥他、大谷知行、原田昌彦、保科宏道
    • 学会等名
      理研シンポジウム第 9 回「光量子工学研究」―エクストリームフォトニクスが拓く未来の光科学―
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 核内アクチン繊維形成とゲノム機能制御におけるアクチンファミリーArp4の役割、The actin-family protein Arp4 suppresses formation of nuclear actin filament2021

    • 著者名/発表者名
      上野 佑也、山崎 祥他、GERHOLD Christian、山本 浩志、宮本 圭、原田 昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着への核膜孔の関与 Relocation of DNA breaks to nuclear pores is involved in damage-induced sister chromatid cohesion2021

    • 著者名/発表者名
      折原行希,高橋大輔,小西辰紀,尾間由佳子,島田健士, Susan M. Gasser, 原田昌彦, 堀籠智洋
    • 学会等名
      第38回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着への核膜孔の関与 Relocation of DNA breaks to nuclear pores is involved in damage-induced sister chromatid cohesion2021

    • 著者名/発表者名
      折原行希,高橋大輔,小西辰紀,尾間由佳子,島田健士, Susan M. Gasser, 原田昌彦, 堀籠智洋
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2021 年度(令和3 年度)[仙台]大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 細胞内のアクチン繊維形成はTHz光照射によって促進される2021

    • 著者名/発表者名
      細木 亮輔,山崎祥他,上野裕也,保科宏道,小川雄一,原田昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 放射光が食と農の未来を拓く2021

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      東北大学多元物質科学研究所イノベーション・エクスチェンジ2020
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 東北大学農学研究科の取り組みと農学分野における利用可能性2021

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会、シンポジウム「農芸化学領域における次世代放射光施設利活用ポテンシャルと将来展望」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着には核膜孔との結合が必要である2021

    • 著者名/発表者名
      折原行希、高橋大輔、小西辰紀、岡田大和、尾間由佳子、島田健士、Susan M. Gasser、 原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] Roles of the histone variant H2A.Z in post-embryonic development of C. elegans2021

    • 著者名/発表者名
      Saho Kitagawa, Natsumi Horii, Nami Haruta, Yukako Oma, Akane Konno, Masato Kanemaki, Sugimoto, and Masahiko Harata
    • 学会等名
      23rd International C. elegans Conference
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional analysis of histone variant H2A.Z in response to nickel exposure of Caenorhabditis elegans2021

    • 著者名/発表者名
      Natsumi Horii, Saho kitagawa, Mayu Aida, Masahiko Harata
    • 学会等名
      線虫研究の未来を創る会 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌培養におけるフッ素系不活性溶媒添加の影響解析2021

    • 著者名/発表者名
      細木亮輔、川田晃士、山重貴久、菊池正二郎、小川雄一、原田昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会東北支部第156回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 老化した出芽酵母における DNA 二本鎖切断の核膜結合に関する解析2021

    • 著者名/発表者名
      堀川和希、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      酵母研究若手の会 第7回研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 老化した出芽酵母におけるDNA二本鎖切断の解析2021

    • 著者名/発表者名
      堀川和希、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      日本農芸化学会東北支部 第156回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 核膜孔結合によるrDNA安定化機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      岡田大和、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      第7回酵母研究若手の会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA損傷誘導性姉妹染色分体間接着には損傷部位と核膜孔との結合が必要である2021

    • 著者名/発表者名
      岡田大和、折原行希、高橋大輔、小西辰紀、尾間由佳子、島田健士、Susan M. Gasser、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      日本農芸化学会東北支部 第156回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] テラヘルツ光照射による細胞内アクチン繊維形成の制御技術の探索2021

    • 著者名/発表者名
      上野佑也、山崎祥他、小川雄一、保科宏道、原田昌彦
    • 学会等名
      テラヘルツ科学の最先端VIII
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] テラヘルツ光照射による細胞内アクチンフィラメント操作の試み、Application of terahertz wave for manipulation of intracellular actin filaments2021

    • 著者名/発表者名
      上野 佑也、山崎 祥他、坪内 雅明、小川 雄一、保科 宏道、大谷 知行、原田 昌彦
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 早?症細胞における核内アクチン動態変化とその機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      高橋祐人、町田奈々子、松下純平、宮本圭、原田昌彦
    • 学会等名
      第73回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 高強度テラヘルツ光照射がDNA損傷修復反応に与える影響の解析2021

    • 著者名/発表者名
      細木亮輔、上野佑也、山崎祥他、保科宏導、小川雄一、原田昌彦
    • 学会等名
      第44回回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 早老症細胞における核内アクチンとラミンAのクロストーク2021

    • 著者名/発表者名
      高橋祐人、名嘉真良広、町田奈々子、Tom Misteli、原田昌彦
    • 学会等名
      第39回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム機能制御および個体発生・分化におけるヒストンバリアントH2A.Zの機能解明2021

    • 著者名/発表者名
      北川紗帆、堀井菜摘、春田奈美、尾間由佳子、金野あかね、鐘巻将人、杉本亜砂子、原田昌彦
    • 学会等名
      第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA損傷依存的な姉妹染色体分体間接着には核膜孔との結合が必要である2021

    • 著者名/発表者名
      Yamato Okada, Yuki Orihara, Daisuke Takahashi, Tatsunori Konishi, Yukako Oma, Kenji Shimada, Susan M. Gasser, Masahiko Harata, Chihiro Horigome
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 老化した出芽酵母におけるDNA二本鎖切断の核膜結合に関する解析2021

    • 著者名/発表者名
      堀川和希、原田昌彦、堀籠智洋
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [学会発表] 早老症細胞における核内アクチン動態変化とその機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      高橋祐人、町田奈々子、松下純平、宮本圭、原田昌彦
    • 学会等名
      第73回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンバリアントH2A.Z導入機構と機能の進化的保存性解析2020

    • 著者名/発表者名
      北川紗帆、高橋大輔、日下部将之、尾間由佳子、奥裕之、成宮巧、中林悠、関政幸、原田昌彦
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第 53 回研究報告会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] THz wave irradiation activates polymerization of protein inside cells、THz光照射による細胞内タンパク質の重合反応促進2020

    • 著者名/発表者名
      上野佑也、山崎祥他、細木亮輔、小川雄一、保科弘道、大谷知行、原田昌彦
    • 学会等名
      東北大学&理化学研究所 連携シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] アクチンファミリータンパク質Arp4は核内アクチン繊維の形成と機能を制御する、The actin-family protein Arp4 regulates the formation and functions of nuclear actin filament2020

    • 著者名/発表者名
      上野佑也 、山崎祥他 、Christian Gerhold 、山本浩志 、宮本圭 、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary conservativeness of the histone variant H2A.Z in its deposition and functions2020

    • 著者名/発表者名
      北川紗帆 、日下部将之 、奥裕之 、高橋大輔 、成宮巧 、中林悠、関政幸、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 早老症細胞における核内アクチン繊維の形成異常と早老症病態との関連性 Nuclear F-actin formation and the etiology of Hutchinson-Gilford progeria syndrome2020

    • 著者名/発表者名
      高橋祐人、平塚晶吾、町田奈々子、Pavel Hozak、Tom Misteli、宮本圭、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンバリアントH2A.Zのゲノム導入部位決定機構解析2020

    • 著者名/発表者名
      高橋大輔、北川紗帆、小田有沙、仮屋園遼、尾間由佳子、太田邦史、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] H2A.Zヒストンバリアントアイソフォーム間における酸化ストレス応答遺伝子EGR1転写制御機構の差異の解析2020

    • 著者名/発表者名
      荻原望、高橋大輔、堀哲也、深川竜郎、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] テラヘルツ光照射による細胞内アクチン重合化の促進2020

    • 著者名/発表者名
      細木亮輔、山崎祥他、上野佑也、保科宏道、小川雄一、原田昌彦
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
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公開日: 2020-11-30   更新日: 2022-12-28  

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