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クロマチン再構築因子が複製阻害からゲノム安定性を守る機構の解明

公募研究

研究領域多様かつ堅牢な細胞形質を支える非ゲノム情報複製機構
研究課題/領域番号 20H05382
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

佐々木 真理子  東京大学, 定量生命科学研究所, 講師 (50722013)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
2021年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
キーワードCAF-1複合体 / クロマチン構造 / DNA複製阻害 / ゲノム安定性 / 非ゲノム情報 / rDNA
研究開始時の研究の概要

DNA複製装置の進行はDNA上の様々な障害によって阻害さるが、複製阻害に対する応答機構は十分に理解されていない。真核生物において、複製はクロマチン上で起こる。よって、クロマチン構造制御因子は複製阻害応答に関与すると考えられているがその分子機構の詳細も不明である。そこで本研究課題では複製阻害が高頻度で起こる出芽酵母のrDNA領域を用いて、クロマチン構造再構築因子が複製阻害からゲノム安定性を守る機構を明らかにすることを目指す。

研究実績の概要

DNA複製装置の進行はDNA上の様々な障害によって阻害されるが、クロマチン構造を制御する因子がどのような分子機構でDNA複製阻害応答を制御するのかは不明である。出芽酵母のリボソームRNA遺伝子(rDNA)領域には約150個のrDNA配列が縦列に連なっている。この領域ではDNA複製阻害が高頻度で起こるだけでなく、このDNA複製阻害に正しく応答できないとrDNAコピー数変動が高頻度で起こる。研究代表者は先行研究において、ヌクレオソーム再構築因子であるCAF-1複合体がDNA複製阻害時にrDNAコピー数変化を抑制し、ゲノム安定性を守る上で重要な因子であることを明らかにした。そこで本研究課題では、CAF-1複合体がどのような分子メカニズムで複製阻害からゲノム安定性を維持するのかを明らかにすることを目指した。
rDNA領域では高頻度でDNA複製阻害が起こり、DNA二本鎖切断が生じることが知られている。そして、CAF-1複合体はこのDNA二本鎖切断がゲノム不安定化を誘導しやすい相同組換え経路によって修復されないように、DNA二本鎖切断末端の削り込みを抑制することを明らかにした。また、rDNA領域には非コードRNAの転写を行うプロモーターが存在するが、CAF-1複合体はこの非コードRNAの転写の抑制に関与していることも明らかとなった。これらの結果から、CAF-1複合体欠損細胞では非コードRNAの転写が活発に起こることによって、DNA二本鎖切断の削り込みが脱抑制され相同組換え経路が用いられることによってrDNAコピー数変動がおこりやすくなっているというモデルを考えている。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Regulatory processes that maintain or alter ribosomal DNA stability during the repair of programmed DNA double-strand breaks2023

    • 著者名/発表者名
      Mariko Sasaki and Takehiko Kobayashi
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 98 号: 3 ページ: 103-119

    • DOI

      10.1266/ggs.22-00046

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 年月日
      2023-06-01
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Spt4 promotes cellular senescence by activating non-coding RNA transcription in ribosomal RNA gene clusters2023

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Yokoyama, Mariko Sasaki and Takehiko Kobayashi
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 42 ページ: 111944-111944

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spt4 drives cellular senescence by activating non-coding RNA transcription in ribosomal RNA gene clusters2022

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Yokoyama, Mariko Sasaki, Takehiko Kobayashi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 0-0

    • DOI

      10.1101/2022.04.22.488906

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] The S-phase Cyclin Clb5 Promotes rDNA Stability by Maintaining Replication Initiation Efficiency in rDNA.2021

    • 著者名/発表者名
      Mayuko Goto, Mariko Sasaki, and Takehiko Kobayashi
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Biology

      巻: 5 号: 5 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1128/mcb.00324-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Gel Electrophoresis Analysis of rDNA Instability in Saccharomyces cerevisiae2021

    • 著者名/発表者名
      Mariko Sasaki, Takehiko Kobayashi
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2153 ページ: 403-425

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-0644-5_28

    • ISBN
      9781071606438, 9781071606445
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Interplay between transcription and DNA double-strand break repair impacts genome stability upon DNA replication fork arrest2022

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会、ワークショップ「ゲノム複製研究の最前線 - Flexibility, Fidelity, Fragility」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA複製阻害時のDNA二本鎖切断修復と転写制御機構のインタープレイ2022

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子, 小林 武彦
    • 学会等名
      日本遺伝学会第94回大会 2022年9月14日
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製阻害時のDNA二本鎖切断修復によるrDNAコピー数制御機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会、企画ワークショップ「ゲノムDNA量の変化から紐解く生物の生存戦略」
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製阻害時のDNA二本鎖切断修復とゲノム不安定化2021

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子, 小林 武彦
    • 学会等名
      第26回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製阻害時のDNA二本鎖切断修復と転写制御機構のインタープレイ2021

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子
    • 学会等名
      日本遺伝学会第93回大会、企画ワークショップ「ゲノムDNA量の変化から紐解く生物の生存戦略」
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] S期サイクリンClb5によるゲノム安定性維持機構2021

    • 著者名/発表者名
      佐々木 真理子, 後藤 真由子, 小林 武彦
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告回
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-12-25  

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