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非ゲノム情報としてのグアニン4重鎖の形成と複製開始における役割と生物学的意義

公募研究

研究領域多様かつ堅牢な細胞形質を支える非ゲノム情報複製機構
研究課題/領域番号 20H05399
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関公益財団法人東京都医学総合研究所

研究代表者

正井 久雄  公益財団法人東京都医学総合研究所, 基礎医科学研究分野, 所長 (40229349)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
2021年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2020年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
キーワードグアニン4重鎖構造 / 複製開始 / RNA-DNAハイブリッド / 大腸菌染色体 / 複製環境適応 / 非ゲノム情報 / 変異 / 組換え / グアニン4重鎖 / DNA複製開始 / 大腸菌染色体複製 / 環境適応
研究開始時の研究の概要

本研究では、非ゲノム情報であるG4/RNA-DNA ハイブリッドが、DNA 複製開始のシグナルとして機能する可能性を検証し、そのメカニズムと生物学的意義について解明する。具体的には、大腸菌のG4/RNA-DNA ハイブリッド依存的複製システムを用いてG4 形成が実際に複製開始に必須かを検証し、複製開始に関与するタンパク質-G4 相互作用を解明する。更にこの複製システムの、生物学的・進化的意義の解明を目指した実験を行う。又、動物細胞においてもG4 依存的DNA 複製を検証する。更に一細胞解析により、G4 の存在部位と複製開始部位の分布を比較し、G4 形成と複製開始の確率論的発生の関連を検証する。

研究実績の概要

典型的な非B型DNA構造である、グアニン4重鎖(G4)構造は、生物種を問わず普遍的に存在し、その生物学的機能も次々と報告されている。G4は、配列ではなく、形成する核酸形態が重要な役割を果たす。又、G4の形成と崩壊は、生体内でダイナミックに変動している可能性があり、これまで見逃されている重要な非ゲノム情報である。数年前にヒトを含む高等生物の複製起点の近傍に高い頻度でG4形成配列が存在する事が明らかとなり、G4の複製開始における役割が示唆された。私たちは、G4がDNA複製開始のシグナルとして、あるいは、複製を抑制するクロマチン形成の拠点として機能することを発見した。本研究では、非ゲノム情報としてのG4の細胞内でのダイナミックな形成が、DNA複製開始をどのように制御するか、またその存在がゲノムの安定な維持継承にどのような影響を及ぼすかを解析し、その分子機構と生物学的意義の解明を目指す。本年度、転写プロモーターとG-rich配列を連結し、転写に依存して自律的に複製できるユニットを大腸菌細胞内で合成生物学的に樹立した。この複製システムを酵母と動物細胞に導入し、自律的に複製するかどうかを現在検討している。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 4件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (22件) (うち国際学会 7件、 招待講演 5件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Loss of full-length DNA replication regulator Rif1 in two-cell embryos is associated with zygotic transcriptional activation2021

    • 著者名/発表者名
      Yoshizawa-Sugata Naoko、Yamazaki Satoshi、Mita-Yoshida Kaoru、Ono Tomio、Nishito Yasumasa、Masai Hisao
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 297 号: 6 ページ: 101367-101367

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.101367

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Discovery of AS-0141, a Potent and Selective Inhibitor of CDC7 Kinase for the Treatment of Solid Cancers2021

    • 著者名/発表者名
      Irie Takayuki、Asami Tokiko、Sawa Ayako、Uno Yuko、Taniyama Chika、Funakoshi Yoko、Masai Hisao、Sawa Masaaki
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 64 号: 19 ページ: 14153-14164

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.1c01319

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Extracellular DJ-1 induces sterile inflammation in the ischemic brain.2021

    • 著者名/発表者名
      Nakamura K, Sakai S, Tsuyama J, Nakamura A, Otani K, Kurabayashi K, Yogiashi Y, Masai H, Shichita T
    • 雑誌名

      PLOS Biol

      巻: 19 号: 5 ページ: e3000939-e3000939

    • DOI

      10.1371/journal.pbio.3000939

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A KDM6 inhibitor potently induces ATF4 and its target gene expression through HRI activation and by UTX inhibition2021

    • 著者名/発表者名
      Kitajima Shojiro、Sun Wendi、Lee Kian Leong、Ho Jolene Caifeng、Oyadomari Seiichi、Okamoto Takashi、Masai Hisao、Poellinger Lorenz、Kato Hiroyuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 4538-4538

    • DOI

      10.1038/s41598-021-83857-y

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Detection of cellular G-quadruplex by using a loop structure as a structural determinant2020

    • 著者名/発表者名
      Masai Hisao、Kanoh Yutaka、Kakusho Naoko、Fukatsu Rino
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 531 号: 1 ページ: 75-83

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.05.191

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] G-quadruplex DNA and RNA: Their roles in regulation of DNA replication and other biological functions2020

    • 著者名/発表者名
      Masai Hisao、Tanaka Taku
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 531 号: 1 ページ: 25-38

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.05.132

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] G-quadruplexes: tools, roles, and goals2020

    • 著者名/発表者名
      Masai Hisao、Tan Zheng
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 531 号: 1 ページ: 1-2

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.05.092

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] LDL-mimetic lipid nanoparticles prepared by surface KAT ligation for<i>in vivo</i>MRI of atherosclerosis2020

    • 著者名/発表者名
      Fracassi Alessandro、Cao Jianbo、Yoshizawa-Sugata Naoko、T?th ?va、Archer Corey、Gr?ninger Olivier、Ricciotti Emanuela、Tang Soon Yew、Handschin Stephan、Bourgeois Jean-Pascal、Ray Ankita、Liosi Korinne、Oriana Sean、Stark Wendelin、Masai Hisao、Zhou Rong、Yamakoshi Yoko
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 11 号: 44 ページ: 11998-12008

    • DOI

      10.1039/d0sc04106h

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Cancer-derived UTX TPR mutations G137V and D336G impair interaction with MLL3/4 complexes and affect UTX subcellular localization.2020

    • 著者名/発表者名
      Kato H, Asamitsu K, Sun W, Kitajima S, Yoshizawa-Sugata N, Okamoto T, Masai H, Poellinger L
    • 雑誌名

      Oncogene.

      巻: 39 号: 16 ページ: 3322-3335

    • DOI

      10.1038/s41388-020-1218-3

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Roles of G4 binding and multimization of Rif1 in S phase regulation in fission yeast cells.2021

    • 著者名/発表者名
      Hisao Masai, Yutaka Kanoh, Kaho Takasawa, Daisuke Koida, Seiji Matsumoto
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia Conference YEAST AND LIFE SCIENCES
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Claspin is required for growth recovery from serum starvation through regulating the PI3K-PDK1-mTOR pathway.2021

    • 著者名/発表者名
      Chi-Chun Yang, Hisao Masai
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia Conference, DNA METABOLISM, GENOMIC STABILITY & HUMAN DISEASE
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Mechanisms of membrane association of Rif1 and its role in replication timing regulation2021

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Iguchi, Sayuri Ito, Naoko Kokusho, Yutaka Kanoh, Kaho, Takasawa, Kenji Moriyama, Hiroyuki Sasanuma, Hisao Masai.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting EUKARYOTIC DNA REPLICATION & GENOME MAINTENANCE
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chromatin regulation that involves assembly of protein, lipid and DNA with a special higher-order structure2021

    • 著者名/発表者名
      正井久雄
    • 学会等名
      シンポジウム「染色体の多様な機能を支えるタンパク質高次複合体」第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Association of Rif1 with nuclear membrane is essential for genome-wide replication timing regulation2021

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Iguchi, Sayuri Ito, Naoko Kakusho, Satoshi Yamazaki, Asami Oji, Rino Fukatsu, Ichiro Hiratani, Hiroyuki Sasanuma, Hisao Masai
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会 シンポジウム 「DNA構造ダイナミクスを基盤とするゲノム複製と維持の生物種を超えた共通原理」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genetic interaction network of BRCA2 tumor suppressor gene2021

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Sasanuma, Kousei Yamada, Ngo Trinh, Hisao Masai, Kosuke Yusa
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会 ワークショップ「ゲノム安定性:その破綻を誘導する分子機構と破綻によりおこるゲノム異常」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Claspin, a key regulator of replication checkpoint, is differentially regulated in cancer and non-cancer cells.2020

    • 著者名/発表者名
      Chi-Chun Yang、Hisao Masai
    • 学会等名
      11th international symposium on DNA Damage Response & Human Disease
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] グアニン4重鎖/RNA-DNAハイブリッド構造によるDNA複製の制御機構2020

    • 著者名/発表者名
      正井久雄
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会 シンポジウム『ゲノム反応中間体としての非B型核酸:その構造と生物学的意義』
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] G4/RNA-DNAハイブリッドに依存する環状染色体DNAの複製機構2020

    • 著者名/発表者名
      正井 久雄 、 田中 卓 、鷺 朋子 、深津 理乃 、関 由美香
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020 ワークショップ 『核様体DNAの複製と品質維持の最前線研究』
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Cdc7ーASKキナーゼ複合体の脳の発生における役割2020

    • 著者名/発表者名
      堀 かりん、 井口 智弘、山崎 聡志、小野 富男、丸山 千秋、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 転写によるRNA-DNAハイブリッド上でのG4構造形成2020

    • 著者名/発表者名
      井上 直也 、覺正 直子 、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 細胞融合によるPD-L1の発現上昇は腫瘍形成を促進する2020

    • 著者名/発表者名
      田島 陽一 、 芝崎 太 、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 免疫細胞の増殖と分化におけるCdc7と活性化サブユニットASK(Dbf4)の役割2020

    • 著者名/発表者名
      井口 智弘、 山崎 聡志、小野 富男、石井 里絵、堀 かりん、小林 駿介、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] multi-replicon 様式の大腸菌染色体複製メカニズム2020

    • 著者名/発表者名
      田中 卓、 鷺 朋子、西藤 泰昌、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Rif1多量体形成能の複製タイミング制御における役割の解明2020

    • 著者名/発表者名
      高沢 佳芳、 加納 豊、松本 清治、小林 駿介、深津 理乃、覺正 直子、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] RNA-DNAハイブリッド/G4構造に依存する大腸菌plasmidの複製開始メカニズムの解析2020

    • 著者名/発表者名
      深津 理乃 、 田中 卓 、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] リン酸化によるClaspinの分子内相互作用によるDNA複製の制御2020

    • 著者名/発表者名
      YOU Zhiying 、 YANG ChiChun 、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 分裂酵母のRif1の過剰発現は増殖を阻害し、M期の進行を妨害することで細胞死を誘導する2020

    • 著者名/発表者名
      加納 豊、 松本 清治、上野 勝、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌におけるゲノム上のRNA-DNA hybrid・グアニン4重鎖構造のプロファイルと第二の複製系での役割の解明2020

    • 著者名/発表者名
      鷺 朋子、 田中 卓、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ClaspinはPI3 kinaseとmTORと相互作用し、血清飢餓からの増殖と栄養系シグナル伝達に必要である2020

    • 著者名/発表者名
      楊 其駿 、 正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ヒトRif1C末領域はその核膜局在と複製タイミング制御に必要とされる2020

    • 著者名/発表者名
      伊藤 さゆり、 井口 智弘、覺正 直子、大字 亜沙美、平谷 伊智朗、正井 久雄
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Molecular Insights into Claspin-Mediated Skew of CD4+ T Cell Differentiation and Its Response to Replication Stress.2020

    • 著者名/発表者名
      HSIAO Hao-Wen、 IGUCHI Tomohiro、MASAI Hisao
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] ゲノム動態プロジェクト

    • URL

      https://www.igakuken.or.jp/genome/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2022-12-28  

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