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光合成蛋白質における高次π空間による光誘起電子移動反応の分子制御機構

公募研究

研究領域高次π空間の創発と機能開発
研究課題/領域番号 21108506
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関名古屋大学 (2010)
筑波大学 (2009)

研究代表者

野口 巧  名古屋大学, 理学研究科, 教授 (60241246)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2009年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード光合成 / 光化学系II / 赤外分光 / π系共役色素 / 電子移動
研究概要

光合成系II蛋白質複合体に働く除草剤は、第二キノン電子受容体Q_B部位に結合し、第一キノン電子受容体Q_Aから先の電子移動反応を阻害する。ブロモキシニルなどのπ電子系を持つフェノール系除草剤は、Q_B部位への結合によってQ_Aの酸化還元電位を低下させることが知られているが、その酸化還元電位コントロールの分子メカニズムは不明であった。そこで本研究では、フーリエ変換赤外分光法(FTIR)とドッキング計算を用いてフェノール系除草剤とQ_Aとの相互作用および酸化還元電位への影響を調べた。
ブロモキシニルを作用させた光化学系IIについて、Q_AとQ_Bの中間に存在する非ヘム鉄の光誘起還元反応の際のFTIRスペクトルを測定した。そのスペクトルにおいて、ブロモキシニルのCN及びCO伸縮振動が、それぞれ2209及び1516cm^<-1>に観測された。エタノール中のブロモキシニルのスペクトルや密度汎関数法(DFT)解析から、フェノール系除草剤は脱プロトン化したフェノレートアニオンの状態でQ_B部位に結合していることが示された。また、ヒスチジン由来のバンドの顕著な変化から、このフェノーレートアニオンの酸素原子が非ヘム鉄に配位するD1-His215に水素結合していることが示唆された。ドッキング計算によってもこの結果が支持された。これらの結果から、フェノール系除草剤は、フェノレートCOのHis側鎖への強い水素結合により、その相互作用シグナルがπ共役と水素結合よりなるQ_A-His-Fe-His-phenolate架橋構造を介してQ_Aに伝わり、Q_Aの酸化還元電位を低下させることが示された。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (46件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 13件) 学会発表 (32件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The cyanobacteriochrome, TePixJ, isomerizes its own chromophore by converting phycocyanobilin to phycoviolobilin2011

    • 著者名/発表者名
      T.Ishizuka, A.Kamiya, H.Suzuki, R.Narikawa, T.Noguchi, T.Kohchi, K.Inomata, M.Ikeuchi
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 50 ページ: 953-961

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural coupling of an arginine side chain with the oxygen evolving Mn4Ca cluster in photosynstem II as revealed by isotope-edited Fourier transform infrared spectroscopy2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Shimada, H.Suzuki, T.Tsuchiya, M.Mimuro, T.Noguchi
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc.

      巻: 133 ページ: 3808-3811

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interaction and inhibitory effect of ammonium cation in the oxygen evolvingcenter of photosytem II2011

    • 著者名/発表者名
      M.Tsuno, H.Suzuki, T.Kondo, H.Mino, T.Noguchi
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 50 ページ: 2506-2514

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fourier transform infrared spectroscopy of special pair bacteriochlorophylls in homodimeric reaction centers of heliobacteria and green sulfur bacteria2010

    • 著者名/発表者名
      T.Noguchi
    • 雑誌名

      Photosynth.Res.

      巻: 104 ページ: 321-331

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Orientations of carboxylate groups coupled to the Mn cluster in the photosynthetic oxygen-evolving center as studied by polarized ATR-FTIR spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      M.Iizasa, H.Suzuki, T.Noguchi
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 49 ページ: 3074-3082

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Energetics in photosystem II from Thermosynechococcus elongatus with a D1 protein encoded by either the psbA1 or psbA3 gene2010

    • 著者名/発表者名
      M.Sugiura, Y.Kato, R.Takahashi, H.Suzuki, T.Watanabe, T.Noguchi, F.Rappaport, A.Boussac
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta

      巻: 1797 ページ: 1491-1499

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structures and binding sites of phenolic herbicides in the Q_B pocket of photosystem II2010

    • 著者名/発表者名
      R.Takahashi, K.Hasegawa, A.Takano, T.Noguchi
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 49 ページ: 5445-5454

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydrogen bond interactions of the pheophytin electron acceptor and its radical anion in photosystem II as revealed by Fourier transform infrared difference spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Shibuya, R.Takahashi, T.Okubo, H.Suzuki, M.Sugiura, T.Noguchi
    • 雑誌名

      Biochemistry 49

      ページ: 493-501

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fourier transform infrared spectroscopy of special pair bacteriochlorophylls in homodimeric reaction centers of heliobacteria and green sulfur bacteria2010

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 雑誌名

      Photosynth.Res. (in press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 共鳴ラマン分光法2009

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 雑誌名

      「光合成研究法」低温科学 67

      ページ: 491-496

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 光誘起フーリエ変換赤外差スペクトル法2009

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 雑誌名

      「光合成研究法」低温科学 67

      ページ: 483-489

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Monitoring proton release during photosynthetic water oxidation in photosystem II by means of isotope-edited infrared spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      H.Suzuki, M.Sugiura, T.Noguchi
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 131

      ページ: 7849-7857

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural coupling of a tyrosine side chain with the non-heme iron center in photosystem II as revealed by light-induced Fourier transform infrared difference spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      R.Takahashi, A.Boussac, M.Sugiura, T.Noguchi
    • 雑誌名

      Biochemistry 48

      ページ: 8994-9001

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 光合成水分解反応の赤外分光解析2011

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 学会等名
      阪大蛋白研セミナー「分子科学と生理学が解き明かす植物の光エネルギー変換の新展開」
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 光合成酸素発生反応におけるアンモニウムイオンの阻害効果2011

    • 著者名/発表者名
      津野将弥、鈴木博行、野口巧
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      (要旨集)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] FTIR法による光合成酸素発生サイクルにおける各S状態遷移の効率の評価2011

    • 著者名/発表者名
      鈴木博行、杉浦美羽、野口巧
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      (要旨集)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系II-金ナノ粒子複合体の形成2011

    • 著者名/発表者名
      野地智康、鈴木博行、五藤俊明、鞆達也、野口巧
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      (要旨集)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系IIにおける電子伝達πコファクターの光傷害機構2011

    • 著者名/発表者名
      井手段一聖、野口巧
    • 学会等名
      「高次π空間の創発と機能開発」第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      (要旨集)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系II-金ナノ粒子複合体の形成2011

    • 著者名/発表者名
      野地智康、鈴木博行、五藤俊明、岩井雅子、池内昌彦、鞆達也、野口巧
    • 学会等名
      日本生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 光合成酸素発生研究:試料系と分光測定のカップリング2010

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 学会等名
      光合成シンポジウム「光合成による光エネルギー利用の過去・現状・未来」
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2010-12-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] カロテノイドの励起移動と電子移動2010

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 学会等名
      嶋田敬三先生退職記念シンポジウム―光合成細菌:色素タンパク質からの広がり―
    • 発表場所
      首都大学東京
    • 年月日
      2010-03-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of photosynthetic water oxidation2010

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 学会等名
      1st Symposium of the Innovative Center of Nanomaterials Science for Environment and Energy
    • 発表場所
      NIMS, Tsukuba
    • 年月日
      2010-02-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 光合成酸素発生反応におけるアンモニア阻害のメカニズム2010

    • 著者名/発表者名
      津野将弥、鈴木博行、野口巧
    • 学会等名
      日本光合成学会年会
    • 発表場所
      東京大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 光合成酸素発生反応における各S状態遷移の効率:FTIR法による解析2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木博行, 杉浦美羽, 野口巧
    • 学会等名
      日本光合成学会年会
    • 発表場所
      東京大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 赤色・緑色光センサータンパク質AnPixJの光反応のFTIR解析2010

    • 著者名/発表者名
      富田祐介、鈴木博行、成川礼、池内昌彦、伊藤繁、野口巧
    • 学会等名
      日本光合成学会年会
    • 発表場所
      東京大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 光合成蛋白質におけるπ共役系を介したフェノール系除草剤と第一キノン電子受容体の相互作用2010

    • 著者名/発表者名
      高橋亮太、長谷川浩司、高野晃、野口巧
    • 学会等名
      「高次π空間の創発と機能開発」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Infrared detection of water oxidation reactions in photosystem II2010

    • 著者名/発表者名
      Takumi Noguchi
    • 学会等名
      15th International Congress of Photosynthesis
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Functional roles of the amino- and carboxyl-regions of PsbP protein in photosystem II2010

    • 著者名/発表者名
      Shusuke Kakiuchi, Megumi Tomita, Kunio Ido, Kentaro Ifuku, Takumi Noguchi, Fumihiko Sato
    • 学会等名
      15th International Congress of Photosynthesis
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Estimation of the efficiencies of individual S-state transitions during photosynthetic water oxidation using FTIR spectroscopy(FTIR法による光合成酸素発生反応における各S状態遷移の効率の評価)2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Suzuki, Miwa Sugiura, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] The molecular mechanism of ammonia inhibition of photosynthetic oxygen evolution(光合成酸素発生反応におけるアンモニア阻害の分子機構)2010

    • 著者名/発表者名
      Masaya Tsuno, Hiroyuki Suzuki, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] FTIR analysis of the photoreactions of red/green light sensor protein AnPixJ(FTIR法による赤色・緑色光センサータンパク質AnPixJの光反応の解析)2010

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Tomita, Hiroyuki Suzuki, Rei Narikawa, Masahiko Ikeuchi, Shigeru Itoh, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Redox Potential Control of π-Conjugated Redox Cofactors in Photosynthetic Protein2010

    • 著者名/発表者名
      Takumi Noguchi
    • 学会等名
      2nd International symposium on emergence of highly elaborated π-space and its function
    • 発表場所
      Kyoto University
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Infrared studies of photosynthetic oxygen evolving reactions2010

    • 著者名/発表者名
      Takumi Noguchi
    • 学会等名
      The 70th Okazaki International Conference on Molecular Mechanism of Photosynthetic Energy Conversion : The Present Research and Future Prospects
    • 発表場所
      Okazaki Conference Center
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] FTIR study on the efficiencies of individual S-state transitions during photosynthetic water oxidation2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Suzuki, Miwa Sugiura, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      The 70th Okazaki International Conference on Molecular Mechanism of Photosynthetic Energy Conversion : The Present Research and Future Prospects
    • 発表場所
      Okazaki Conference Center
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] FTIR study of the hydrogen-bond structure of the quinone electron accepter Q_A in photosystem II2010

    • 著者名/発表者名
      Yuta Kozue, Akira Takano, Hiroyuki Suzuki, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      Joint Conference of NIMS International Workshop on Photocatalysis and Environmental Remediation Materials 2010 & 3rd Japan-China Symposium on Advanced Photocatalytic Materials
    • 発表場所
      NIMS, Tsukuba
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Herbicide effect on the photodamage to photosystem II as studied by FTIR spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      井手段一聖, 野口巧
    • 学会等名
      Joint Conference of NIMS International Workshop on Photocatalysis and Environmental Remediation Materials 2010 & 3rd Japan-China Symposium on Advanced Photocatalytic Materials
    • 発表場所
      NIMS, Tsukuba
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] π共役カルボニル基への水素結合によるフェオフィチン電子受容体の酸化還元電位制御機構2010

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 学会等名
      「高次π空間の創発と機能開発」第3回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 除草剤効果による光化学系IIの光傷害機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      井手段一聖、野口巧
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      熊本
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系IIにおけるチロシンY_zとD1-H190の相互作用2010

    • 著者名/発表者名
      高橋亮太、杉浦美羽、Alain Boussac、野口巧
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      熊本
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 光合成蛋白質における高次π空間による光誘起電子移動反応の分子制御機構2009

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 学会等名
      「高次π空間の創発と機能開発」第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      京都テルサ
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] FTIR study on the structure of CP43-E354 in the photosynthetic oxygen-evolving center2009

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Suzuki, Yuichiro Shimada, Tohru Tsuchiya, Tatsuya Tomo, Mamoru Mimuro, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Interactions of herbicides in the Q_B binding site in photosystem II : Analysis by Fourier transform infrared spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      高橋亮太, 野口巧
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Molecular interaction of the primary quinone electron acceptor Q_A in photosystem II as studied by Q_A reconstitution and FTIR analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Yuta Kozue, Akira Takano, Ikuyo Sugimoto, Hiroyuki Suzuki, Miwa Sugiura, Yuichiro Takahashi, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] The mechanism of photodamage of phososystem II as revealed by herbicide effects and FTIR difference spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      Issei Idedan, Yuichi Shibuya, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Structural Couplings of π-Amino Acids with the Iron-Quinone Electron Acceptor in Photosystem II2009

    • 著者名/発表者名
      高橋亮太, 野口巧
    • 学会等名
      1st International Symposium on Emergence of Highly Elaborated π-Space and Its Function
    • 発表場所
      Osaka
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://glab.phys.nagoya-u.ac.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2018-03-28  

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