• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

特異的遺伝子DNAメチル化可視化技術による核内メチル化制御の時空間的解析

公募研究

研究領域遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
研究課題/領域番号 21114514
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

滝沢 琢己  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助教 (30531115)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円)
2010年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2009年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
キーワード核構造 / エピジェネティクス / DNAメチル化 / 細胞分化
研究概要

申請者らがこれまでにDNAメチル化が分化に伴い減少することを明らかにしたアストロサイト特異的遺伝子glial fibrillary acidic protein (GFAP)のプロモーター上のSTAT3結合配列を標的とし、メチル化頻度が高いマウス胎生11.5日由来神経上皮細胞を用いて検討した。既に、定量的PCRにてメチル化に感受性があることを確認しているICONプローブ技術を用いて、標的配列に相補的なプローブを作成した。プローブを複数のビオチン分子で標識し、定法に則ってハイブリダイゼーションした後、オスミウム存在下で反応させプローブとメチル化標的配列との間にオスミウム塩による架橋を形成させた。ストレプトアビジンペルオキシダーゼによりプローブにペルオキシダーゼを結合させ、tyramidとAlexa555色素の化合物を反応させ、プローブの蛍光色素ラベルを試みが、プローブの検出はできなかった。一方、アストロサイト分化に伴って脱メチル化遺伝子の網羅的解析にて同定された複数の遺伝子を選出し、メチル化頻度の高い胎生11.5日および頻度の低い14.5日由来神経上皮細胞を用いて複数遺伝子間の会合を検討した結果、メチル化された状態で、アストロサイト特異的遺伝子であるGFAPとTnfsf13が高頻度に会合することが分かった。このようなCandidate approachではなく、網羅的な解析を行うために、Enhanced Circular Chromosome Conformation Capture (e4C)法にて、GFAP遺伝子座と会合する遺伝子をNimblgenのカスタムマイクロアレイを用いて解析した。すでに、データの取得は終了しており、現在解析中である。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (27件)

  • [雑誌論文] ゲノムDNAの核内配置と遺伝子発現制御2010

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己、高木美智、笹岡寛敏
    • 雑誌名

      生化学 82

      ページ: 143-149

    • NAID

      10026300564

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 神経系におけるゲノム核内配置2009

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己
    • 雑誌名

      Clinical Neuroscience 26

      ページ: 848-849

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] 神経系細胞における核内機能ドメイン配置2009

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己、中島欽一
    • 雑誌名

      実験医学 10月増刊号 27

      ページ: 146-152

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 神経活動依存性遺伝子発現の時空間的制御2011

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2011年度大会
    • 発表場所
      (京都女子大学の予定が中止となり、講演予稿集の発行をもって成立)
    • 年月日
      2011-03-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Identification and Spatio-temporal Regulation of Distinct Classes of Activity-dependent Genes in Post-mitotic Neurons2011

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己
    • 学会等名
      International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場
    • 年月日
      2011-01-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 神経系細胞における遺伝子座核内配置2010

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己
    • 学会等名
      BMB2010
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2010-12-08
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of DNA methylation-independent regulatory mechanisms of astrocyte specific gene expression in embryonic stem cells (ESCs)2010

    • 著者名/発表者名
      裏山悟司、滝沢琢己、神山淳、中島欽一
    • 学会等名
      BMB2010
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2010-12-08
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Spatiotemporal regulation of activity dependent genes in post-mitotic neurons2010

    • 著者名/発表者名
      Takumi Takizawa, Misato Takagi, Kenji Itoh, Kinichi Nakashima
    • 学会等名
      40^<th> Annual Meeting NEUROSCIENCE2010
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 年月日
      2010-11-15
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Meningeal cells express astrocyte inducing cytokines in the developing mouse brain.2010

    • 著者名/発表者名
      Tsukasa Sanosaka, Masakazu Namihira, Takumi Takizawa, Kinichi Nakashima
    • 学会等名
      40^<th> Annual Meeting NEUROSCIENCE2010
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 年月日
      2010-11-15
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of DNA methylation independent reguylatory mechanisums of astrocyte specific gene expression in embryonic stem cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Urayama, Takumi Takizawa, Yukina Hori, Jun Kohyama, Kinichi Nakashima
    • 学会等名
      40^<th> Annual Meeting NEUROSCIENCE2010
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 年月日
      2010-11-15
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Meningeal Cells Induce Astrocyte Differentiation of Neural Stem Cells.2010

    • 著者名/発表者名
      佐野坂司、波平昌一、滝沢琢己、中島欽一
    • 学会等名
      The 29^<th> NAITO CONFERENCE ON GLIA WORLD
    • 発表場所
      湘南国際村センター
    • 年月日
      2010-10-06
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] アストロサイト分化誘導性サイトカイン発現細胞の同定2010

    • 著者名/発表者名
      佐野坂司、波平昌一、滝沢琢己、中島欽一
    • 学会等名
      Neuro 2010
    • 発表場所
      神戸コンベンションセンター
    • 年月日
      2010-09-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 神経活動依存性遺伝子発現の時空間的制御2010

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己、高木美智、笹岡寛敏、伊藤謙治、中島欽一
    • 学会等名
      Neuro 2010
    • 発表場所
      神戸コンベンションセンター
    • 年月日
      2010-09-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 胚性幹細胞におけるGFAP遺伝子の発現制御機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      裏山悟司、滝沢琢己、堀由貴奈、神山淳、中島欽一
    • 学会等名
      日本分子生物学会 第10回春季シンポジウム
    • 発表場所
      ホテル松島大観荘
    • 年月日
      2010-06-08
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Spatiotemporal regulation of activity-dependent genes in post-mitotic neurons2010

    • 著者名/発表者名
      Misato Tkagi, Hirotoshi Sasaoka, Kenji Itoh, Hiroshi Kimura, Kinichi Nakashima, Takumi Takizawa
    • 学会等名
      The 75^<th> Cold Spring Harbor Symposium : Nuclear Organization & Function
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory, NY, USA
    • 年月日
      2010-06-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 神経活動依存性転写の時空間的制御2010

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己、高木美智、伊藤謙治、中島欽一
    • 学会等名
      第9回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      ラフォーレ修善寺
    • 年月日
      2010-05-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of DNA methylation-independent regulatory mechanisms of astrocyte specific gene expression2009

    • 著者名/発表者名
      裏山悟司, 滝沢琢己, 堀由貴奈, 神山淳, 中島欽一
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] A source of astrocyte-inducing cytokines in the developing mouse brain2009

    • 著者名/発表者名
      佐野坂司, 犬伏浩規, 神山淳, 滝沢琢己, 中島欽一
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of chromatin modifications and trascriptional regulations of activity-dependent genes in post-mitotic neurons2009

    • 著者名/発表者名
      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 木村宏, 中島欽一
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ニューロン活動依存的に発現する遺伝子の核内空間配置解析2009

    • 著者名/発表者名
      高木美智, 滝沢琢己, 笹岡寛敏, 中島欽一
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] The spatiotemporal regulation of activity-dependent genes in post-mitotic neurons2009

    • 著者名/発表者名
      Takumi Takizawa
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] The spatio-temporal regulation of activity-dependent genes in post-mitotic neurons2009

    • 著者名/発表者名
      Takizawa T, Sasaoka H, Takagi M, Kimura H, Nakashima K
    • 学会等名
      The 4th International Workshop on Cell Regulations in Division and Arrest
    • 発表場所
      沖縄
    • 年月日
      2009-11-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ニューロン活動依存的に発現する遺伝子の核内空間配置解析2009

    • 著者名/発表者名
      高木美智, 笹岡寛敏, 滝沢琢己, 中島欽一
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2009-10-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ニューロンでの遺伝子発現におけるエピジェネティック修飾の解析2009

    • 著者名/発表者名
      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 木村宏, 中島欽一
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2009-10-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] DYNAMIC CHANGES IN DNA METHYLATION AND SPATIAL POSITIONING OF AN ASTROCYTE SPECIFIC GENE,GFAP DURING ASTROCYTE DIFFERENTIATION2009

    • 著者名/発表者名
      Takizawa T, Taga T, Misteli T, Nakashima K
    • 学会等名
      ISSCR 7th Annual Meeting
    • 発表場所
      Barcelona, Spain
    • 年月日
      2009-07-08
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Allele-specific nuclear positioning of the monoallelically expressed astrocyte marker GFAP2009

    • 著者名/発表者名
      Takizawa T, Nakashima K, Gudla RP, Lockett S, Misteli T
    • 学会等名
      第24回内藤コンファレンス
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2009-06-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] アストロサイト特異的遺伝子GEAP発現制御に関するDNAメチル化と遺伝子座核内配置2009

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己, 中島欽一
    • 学会等名
      第52回日本神経化学会大会
    • 発表場所
      渋川市
    • 年月日
      2009-06-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] アストロサイト特異的遺伝子GEAPの核内配置と転写活性2009

    • 著者名/発表者名
      滝沢琢己、Tom Misteli
    • 学会等名
      第8回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆市
    • 年月日
      2009-06-19
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] アストロサイト特異的遺伝子GEAPの核内配置と転写活性2009

    • 著者名/発表者名
      滝沢塚己, Tom Misteli, 中島欽一
    • 学会等名
      第3回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2009-05-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ニューロンでの遺伝子発現におけるエピジェネティック修飾の解析2009

    • 著者名/発表者名
      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 中島欽一
    • 学会等名
      第3回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2009-05-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2018-03-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi