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染色体間ドメインの制御と核形態の定量的解析

公募研究

研究領域遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
研究課題/領域番号 21114518
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関熊本大学

研究代表者

斉藤 典子  熊本大学, 発生医学研究所, 助教 (40398235)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
16,640千円 (直接経費: 12,800千円、間接経費: 3,840千円)
2010年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
2009年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
キーワード細胞核内構造体 / RanBP2 / エピジェネティクス / 核スペックル / 選択的スプライシング / 組織幹細胞 / 核-細胞質間輸送 / SRタンパク質 / ヒストン修飾 / SRタンパク
研究概要

細胞核内では、転写やRNAのプロセッシングなど生命活動に重要な事象が、複雑な制御を受けながら起こる。これを反映し、核内は高度に組織化され、染色体間領域には様々な核内構造体が存在する。しかし、その形成や制御機構は不明である。細胞の増殖・分化、疾患において、細胞核形態はダイナミックに変動し、同時に遺伝子発現プロファイルが変動する。がんを含む疾患では、特に核の形態変化が診断基準に使われる場合もあるものの、その分子機序は不明で、理解するためには、核形態の客観的な計測システムを確立することが極めて重要である。本研究課題では、画像解析技術の確立とともに、細胞核内構造の機能と形成メカニズムを解明し、細胞核の意義を理解することを目的とした。具体的内容は下記のとおりである。
1.siRNAスクリーニングによりRCC1-Ran-RanBP2の核-細胞質輸送システムが、細胞分裂後の核スペックル再構築に働くことを見出した。また、リン酸化型SRタンパク質の正常な核内斑状分布が、選択的スプライシングに重要であることを見出した。核内構造体の構築を介した遺伝子の発現が核-細胞質輸送システムにより制御される、という新たな概念を創出した。また、マウス個体において、核スペックルの形成が分化にしただって制御されていることを見出した。
2.細胞イメージのハイコンテント解析装置(イメージサイトメーター)を用いて、核スペックル、核膜、カハールボディ、染色体など核内構造体を自動認識させ、定量、評価する方法を確立した。細胞診断補助への応用を考慮しながら、がん細胞・組織幹細胞に応用し、それぞれを特徴づける形態を抽出した。
3.コンピュータ教育型の新規パターン認識プログラムを用いて、細胞形態の分類、定量化を行った。疾患組織画像などに応用し、イメージインフォーマティクスの確立に貢献した。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (10件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Simian virus 40 large T antigen targets the microtubule-stabilizing protein TACC22009

    • 著者名/発表者名
      Tei, S.
    • 雑誌名

      J.Cell Sci. 122

      ページ: 31090-3198

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] MCAF1/AM is involved in Spl-mediated maintenance of cancer-associated telomerase activity2009

    • 著者名/発表者名
      Liu, L
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem 284

      ページ: 5165-5174

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 組織幹細胞におけるエピジェネティックな制御機構2009

    • 著者名/発表者名
      徳永和明
    • 雑誌名

      最新医学 64

      ページ: 52-63

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] 核異型の背景にあるエピジェネティクスのダイナミズム2009

    • 著者名/発表者名
      斉藤典子
    • 雑誌名

      病理と臨床 27

      ページ: 653-658

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 定量的画像解析法の疾患組織及び細胞生物学への応用2011

    • 著者名/発表者名
      斉藤典子
    • 学会等名
      バイオイメージインフォーマティクス ワークショップ 2011
    • 発表場所
      理化学研究所横浜研究所、神奈川県(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Alternative splicing and nuclear domain formation are regulated by the RAN-RANBP2 system.2011

    • 著者名/発表者名
      Saitoh, N.
    • 学会等名
      International symposium Physicochemicalfield for geneticactivities
    • 発表場所
      A waji Yumebutai International Conference Center, Hyogo(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Nuclear sub-structure formation that is regulated by the Ran-RanBP2 system.2010

    • 著者名/発表者名
      Saitoh, N.
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 シンポジウム
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、兵庫県(招待講演)
    • 年月日
      2010-12-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 細胞形態の定量解析と分類2010

    • 著者名/発表者名
      斉藤典子
    • 学会等名
      定量生物学の会 第三回年会
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所、東京都(招待講演)
    • 年月日
      2010-11-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Novel link between Nuclear speckles formation and Ran-RanBP2 system.2010

    • 著者名/発表者名
      Saitoh, N.
    • 学会等名
      The 75^<th> Cold Spring Harbor Symposium on Quantitative Biology "Nuclear organization and function"
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory, NY, USA
    • 年月日
      2010-06-06
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 核スペックルの形成と選択的スプライシングはRam-RanBP2システムにより制御される2010

    • 著者名/発表者名
      斉藤典子
    • 学会等名
      第4回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      米子市文化ホール、鳥取県
    • 年月日
      2010-05-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 細胞核形態の定量解析の試み2010

    • 著者名/発表者名
      斉藤典子
    • 学会等名
      定量生物学学会 第二回年会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-01-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子の発現制御に関わる染色体間ドメインの形成機序2009

    • 著者名/発表者名
      斉藤典子
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会 ワークショップ
    • 発表場所
      横浜パミフィコ横浜
    • 年月日
      2009-12-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Nuclear architecture involved in gene expression2009

    • 著者名/発表者名
      Saitohm N.
    • 学会等名
      The Kumamoto University Global COE International Joint Symposium
    • 発表場所
      熊本空白空ホテル熊本ニュースカイ
    • 年月日
      2009-11-26
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Nuclear architectures involved in gene expression and RNA regulation2009

    • 著者名/発表者名
      Saitoh, N.
    • 学会等名
      The 24^<th> Naito Conference on Nucelar Dynamics and RNA [II]
    • 発表場所
      北海道ミャトレーゼガトーキングダムサッポロ
    • 年月日
      2009-06-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [産業財産権] 細胞核を構成する構造体の解析方法、及び細胞核の形態の解析方法2009

    • 発明者名
      村瀬八重子
    • 権利者名
      オリンパス株式会社国立大学法人熊本大学
    • 産業財産権番号
      2009-223587
    • 出願年月日
      2009-09-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2018-03-28  

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