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植物自然免疫を担う活性酸素生成酵素の制御機構の構造生物学的解明

公募研究

研究領域活性酸素のシグナル伝達機能
研究課題/領域番号 21117513
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学 (2010)
横浜市立大学 (2009)

研究代表者

清水 敏之  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 教授 (30273858)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2010年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2009年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワード活性酸素 / Rboh / X線結晶解析 / EFハンド / カルシウム / Rac1
研究概要

活性酸素種は動植物を問わず重要な生理活性物質でありその生成は厳密に制御されている。本申請は植物の感染防御応答において中心的な役割を果たす膜タンパク質の活性酸素生成酵素(NADPH oxidase;イネではOsRbohB)に焦点をあて、動物食細胞のものとは異なる活性化機構を明らかにし、活性酸素生成の制御過程を原子レベルで明らかにすることを目的とする。イネ由来のOsRac1とOsrbohBの相互作用をタンパク質構造学的に解析するため、OsRaclの相互作用ドメインであるOsrbohBのN末端領域の立体構造を2.4Å分解能で明らかにした。OsrbohBはスワップする形でホモ二量体を形成していた。またOsrbohBはN末端領域に2つのEF-hand motif(EF1とEF2)をもつと予想されていたが、カルシウムが結合しているのはEF1のみであることが明らかとなった。さらにアミノ酸配列からは予想できないEF-hand様モチーフを2つ有していることが判明した。Rac1の結合領域は二量体化することで形成されるコイルドコイル領域であることが変異体実験およびNMR実験により判明した。
またRbohは細胞質側のEFハンド領域を含むN末端ドメインと、NADPHドメインとFADドメインから形成されるC末端ドメインが分子内の結合により活性が制御されていることが予想される。このため実際にN末端ドメインとC末端ドメインが相互作用をするかどうか調べたところ実際に相互作用することが判明した。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The structure of the N-terminal regulatory domain of a plant NADPH oxidase and its functional implications2010

    • 著者名/発表者名
      Oda, et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 285 ページ: 1435-1445

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression, Purification and crystallization of Swi5 and the Swi5-Sfr1 complex from fission yeast2010

    • 著者名/発表者名
      Kuwabara, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.

      巻: F66 ページ: 1124-1126

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of human REV7 in complex with a human REV3 fragment and structural implication of the interaction between DNA polymerase ζ and REV12010

    • 著者名/発表者名
      Hara, et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 285 ページ: 12299-122307

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of human REV7 in complex with a REV3 fragment.2009

    • 著者名/発表者名
      Hara, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crysatallogr. F65

      ページ: 1302-1305

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of the zinc-finger domain of zebrafish Nanos2009

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crysatallogr. F65

      ページ: 959-961

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for novel interactions between human translesion synthesis polymerases and PCNA2009

    • 著者名/発表者名
      Hishiki, et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 284

      ページ: 10552-10560

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intrinsic Dynamics of Restriction Endonuclease EcoO109I Studied by Molecular Dynamics Simulations and X-Ray Scattering Data Analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Oroguchi, et al.
    • 雑誌名

      Biophys.J 96

      ページ: 2808-2822

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞質から核内へのタンパク質輸送機構-核内輸送受容体(トランスポーチン)の構造生物学-2010

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      九州大学研究拠点形成プロジェクトP&P
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2010-01-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Structural Studies of Chromatin-related Proteins PAD4 and NML Recognizing Intrinsically Disordered Region2009

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      Yokohama NMR workshop
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2009-11-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/xtal/index.html

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2018-03-28  

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