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DNA結合タンパク質のATPaseの蛍光1分子イメージング

公募研究

研究領域水を主役としたATPエネルギー変換
研究課題/領域番号 21118510
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関京都大学

研究代表者

横田 浩章  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 講師 (90415547)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2010年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2009年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード1分子計測 / ナノバイオ / 核酸 / 酵素反応
研究概要

DNA複製・修復・組み換えは、種の遺伝的連続性を保証する最も重要な機構である。現時点では、さまざまなタンパク質分子が実際にどのように相互作用しつつ、非常に複雑な反応を速やかに、そして絶妙な精度で触媒するのかについてのダイナミクスはわかっていない。ましてや、それらのタンパク質がエネルギー源であるATPをどのように結合・解離し、その加水分解エネルギーを化学力学変換して、DNAと相互作用し機能を発揮しているのかについての詳細はわかっていない。このATPの加水分解エネルギーの化学力学変換機構の理解のためには、直接ATPとタンパク質が相互作用している現場を可視化することが鍵となる。そこで本研究では、1分子蛍光イメージング観察系の改良を通して、DNA結合タンパク質のATPの結合・解離状態を高濃度ATP条件下で1分子可視化できる系を構築し、その化学力学変換機構に迫ることを目的とした。
平成22年度は前年度に引き続き、高濃度蛍光性ATP存在下でのATP結合・解離の1分子イメージングのための観察系として本研究にて提案した(i)ゼロモード導波路(ナノ開口アレイ)及び(ii)Qdotをドナーとして用いる1分子FRET光学系の有用性の検討、基質ATPとしてはたらきのよい蛍光標識ATPの探索、基板表面へのタンパク質の非特異吸着を抑制するための表面コーティング法の開発を行った。
その結果、1分子観察系としては、ゼロモード導波路(ナノ開口アレイ)が有効であることを見いだすと共に、開発してきた要素技術をもとに、ナノ開口に固定したヘリカーゼ1分子のATPaseに起因すると思われるATP1分子の行き来のイメージングに成功した。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2011 2010

すべて 学会発表 (5件)

  • [学会発表] Single-molecule imaging of ATPase by helicase with zero-mode waveguides2011

    • 著者名/発表者名
      Takuma Iwasa
    • 学会等名
      第9回国際学生セミナー
    • 発表場所
      京都大学芝蘭会館
    • 年月日
      2011-03-07
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] DNA結合タンパク質の1分子動態計測-1分子直視と手法開発-2011

    • 著者名/発表者名
      横田浩章
    • 学会等名
      九州大学P&P 超高次複合体解析に基づくゲノム動態研究プロジェクト拡大研究会
    • 発表場所
      九州大学(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-12
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ナノ開口を使った生体分子1分子の機能・活性測定2010

    • 著者名/発表者名
      岩佐拓磨
    • 学会等名
      第6回 学生フェスティバル
    • 発表場所
      京都大学時計台国際交流ホール
    • 年月日
      2010-11-01
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Development of nano/micrometer-sized platforms and a novel fluorescent probe for single-molecule biology2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Yokota
    • 学会等名
      2nd iCeMS Retreat
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場
    • 年月日
      2010-10-01
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule visualization of the oligomeric form of Escherichia coli UvrD helicase in vitro2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Yokota
    • 学会等名
      International Symposium on Hydration and ATP Energy
    • 発表場所
      仙台秋保温泉岩沼屋
    • 年月日
      2010-03-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2018-03-28  

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