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生体内ニューロン分化における高時間解像度・多階層クロマチンポテンシャルの解析

公募研究

研究領域遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル
研究課題/領域番号 21H00242
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

岸 雄介  東京大学, 定量生命科学研究所, 准教授 (00645236)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円)
2022年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2021年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
キーワードニューロン / クロマチン / 核 / 分化 / 大脳新皮質 / 神経幹細胞 / scATAC-seq
研究開始時の研究の概要

発生過程において、幹細胞が機能細胞に分化する過程では、必要な遺伝子や不要な遺伝子のクロマチン構造が次々に変化し、その後の遺伝子発現を制御する。本研究では、生体内において神経幹細胞が成熟ニューロンに分化する過程で起こる様々なイベントについて、どのゲノム領域で形成されたクロマチンポテンシャルが、その後どのように遺伝子発現に影響し、最終的にニューロンの機能にどういった影響を与えるか、を明らかにすることを目的とする。

研究実績の概要

本年度は、生体内ニューロンの発生過程の一つである神経活動依存的な分化における、クロマチン構造・核の形態変化に着目して研究を進めた。
ニューロン可塑性は、外界からの刺激に応じてその性質を変化させる能力のことであり、私たちが覚えたり忘れたりするときのベースとなるメカニズムである。興味深いことにこれまでの研究において、ニューロンが刺激に応じて遺伝子発現パターンを変化させるときに、核の形が大きく変形して陥入することが知られており、これが遺伝子発現の応答性に寄与することが示唆されていた。私たちは、生体内のニューロンにて生理的な刺激でも同じことが観察されるかを調べるために、視覚刺激に応答する視覚野ニューロンの核の形態をタイムラプスイメージングにて調べた。その結果、高い時間解像度で核の形態変化を捉えることができ、若齢ニューロンでは15-20分の間に核が陥入することがわかった。一方、老化に伴ってニューロン可塑性は低下するが、老齢ニューロンでは核の変形は観察されなかった。またこのとき、核のかたさを原子間力顕微鏡で調べたところ、老齢ニューロンの核は若齢ニューロンよりかたくなっていることがわかった。この結果から、核がかたくなることでフレキシブルに核が変形できなくなったことが、老化に伴う遺伝子発現応答性の低下、ひいてはニューロン可塑性の低下の原因である可能性が示唆された(Frey et al., bioRxiv, 2022)。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 5件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] UTX deficiency in neural stem/progenitor cells results in impaired neural development, fetal ventriculomegaly, and postnatal death2022

    • 著者名/発表者名
      Koizumi M, Eto H, Saeki M, Seki M, Fukushima T, Mukai S, Ide H, Sera Y, Iwasaki M, Suzuki Y, Tohei A, Kishi Y, Honda H.
    • 雑誌名

      FASEB journal

      巻: 36(12) 号: 12 ページ: 22662-22662

    • DOI

      10.1096/fj.202201002rr

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Age-associated reduction of nuclear shape dynamics in excitatory neurons of the visual cortex2022

    • 著者名/発表者名
      Tanita Frey, Tomonari Murakami, Koichiro Maki, Takumi Kawaue, Ayaka Sugai, Naotaka Nakazawa, Taiji Adachi, Mineko Kengaku, Kenichi Ohki, Yukiko Gotoh, Yusuke Kishi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 504704-504704

    • DOI

      10.1101/2022.08.22.504704

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ezh1 regulates expression of <i>Cpg15/Neuritin</i> in mouse cortical neurons2021

    • 著者名/発表者名
      Shun Utsunomiya#, Yusuke Kishi#, Masafumi Tsuboi, Daichii Kawaguchi, Yukiko Gotoh, Manabu Abe, Kenji Sakimura, Kazuma Maeda, and Hiroshi Takemoto (#Equal contribution)
    • 雑誌名

      Drug Discoveries & Therapeutics

      巻: 15 号: 2 ページ: 55-65

    • DOI

      10.5582/ddt.2021.01017

    • NAID

      130008037031

    • ISSN
      1881-7831, 1881-784X
    • 年月日
      2021-04-30
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] HMGB1-mediated chromatin remodeling attenuates Il24 gene expression for the protection from allergic contact dermatitis2021

    • 著者名/発表者名
      Senda N, Yanai H, Hibino S, Li L, Mizushima Y, Miyagaki T, Saeki M, Kishi Y, Hangai S, Nishio J, Sugaya M, Taniguchi T, Sato S
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A

      巻: 118 号: 1

    • DOI

      10.1073/pnas.2022343118

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Brain regionalization by Polycomb-group proteins and chromatin accessibility2021

    • 著者名/発表者名
      Hikaru Eto and Yusuke Kishi* (*Correspondence)
    • 雑誌名

      BioEssays

      巻: 43 号: 11 ページ: 2100155-2100155

    • DOI

      10.1002/bies.202100155

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation of genetically manipulated neural progenitors and immature neurons from embryonic mouse neocortex by FACS2021

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kishi* and Yukiko Gotoh (*Correspondence)
    • 雑誌名

      STAR protocol

      巻: 2 号: 2 ページ: 100540-100540

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2021.100540

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] FoxG1 regulates the formation of cortical GABAergic circuit during an early postnatal critical period resulting in autism spectrum disorder-like phenotypes2021

    • 著者名/発表者名
      Miyoshi Goichi、Ueta Yoshifumi、Natsubori Akiyo、Hiraga Kou、Osaki Hironobu、Yagasaki Yuki、Kishi Yusuke、Yanagawa Yuchio、Fishell Gord、Machold Robert P、Miyata Mariko
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 3773-3773

    • DOI

      10.1038/s41467-021-23987-z

    • NAID

      120007125060

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Preparation of optimized concanavalin A-conjugated Dynabeads magnetic beads for CUT&Tag2021

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Fujiwara, Yuji Tanno, Hiroki Sugishita, Yusuke Kishi, Yoshinori Makino, and Yuki Okada*
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 16 号: 11 ページ: e0259846-e0259846

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0259846

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] In utero gene transfer system for embryos before neural tube closure reveals a role for Hmga2 in the onset of neurogenesis2020

    • 著者名/発表者名
      Naohiro Kuwayama, Yusuke Kishi*, Yurie Maeda, Yurie Nishiumi, Yutaka Suzuki, Haruhiko Koseki, Yusuke Hirabayashi, Yukiko Gotoh (*Correspondence)
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 086330-086330

    • DOI

      10.1101/2020.05.14.086330

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] The role of epigenome in neuronal aging2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kishi, Mai Saeki, Yukiko Gotoh
    • 学会等名
      The 16th Annual Meeting and Korea-Japan Joint Meeting for Developmental Neuroscientists
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Analysis of complex brain development by single-cell transcriptome profiling of ferret neural progenitors2023

    • 著者名/発表者名
      Merve Bilgic、Fumio Matsuzaki
    • 学会等名
      The 16th Annual Meeting and Korea-Japan Joint Meeting for Developmental Neuroscientists
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ニューロン老化におけるエピゲノムの役割の解明2022

    • 著者名/発表者名
      岸雄介、佐伯麻衣、Merve Bilgic、後藤由季子
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ニューロン老化におけるエピゲノムの役割2022

    • 著者名/発表者名
      岸雄介、佐伯麻衣、Merve Bilgic、後藤由季子
    • 学会等名
      新学術・学術変革領域合同若手の会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ALTERATIONS IN TRANSCRIPTOME AND CHROMATIN ACCESSIBILITY OF NEURONAL SUBTYPES IN AGED HIPPOCAMPUS2022

    • 著者名/発表者名
      Merve Bilgic、後藤由季子、岸雄介
    • 学会等名
      新学術・学術変革領域合同若手の会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 老齢マイクログリアにおける転写プロファイルの不均一性の解析2022

    • 著者名/発表者名
      菅井彩香、Merve Bilgic、後藤由季子、岸雄介
    • 学会等名
      新学術・学術変革領域合同若手の会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Alterations in transcriptome and chromatin accessibility of neuronal subtypes in aged hippocampus2022

    • 著者名/発表者名
      Merve Bilgic、後藤由季子、岸雄介
    • 学会等名
      The Transcription, Chromatin, and Epigenetics in Aging Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Dynamic changes in the chromatin and nuclear state during neuronal differentiation ニューロン分化過程におけるクロマチンと核の変化2022

    • 著者名/発表者名
      岸雄介、佐伯麻衣、後藤由季子
    • 学会等名
      55th Annual Meeting of the Japanese Society of Developomental Biologists
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nuclear morphology of cortical excitatory neurons is regulated by visual experience and aging2022

    • 著者名/発表者名
      Tanita M. Frey, Tomonari Murakami, Kenichi Ohki, Yukiko Gotoh, Yusuke Kishi
    • 学会等名
      Society for Neuroscience 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The role of PcG in regionalization of the mouse telencephalon2022

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kishi
    • 学会等名
      The International Symposium on Development and PLASTICITY of NEURAL
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ニューロンの発生・老化過程におけるクロマチン制御2022

    • 著者名/発表者名
      岸雄介
    • 学会等名
      第421回発生研セミナー
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ニューロン分化過程におけるクロマチン構造変化2021

    • 著者名/発表者名
      岸雄介、坂井星辰、後藤由季子
    • 学会等名
      Neuro2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2023-12-25  

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