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ロドプシンを起動分子とした「化学・力学・光」エネルギー発動機構の理解と利用

公募研究

研究領域発動分子科学:エネルギー変換が拓く自律的機能の設計
研究課題/領域番号 21H00404
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関岡山大学

研究代表者

須藤 雄気  岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (10452202)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2022年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2021年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
キーワードロドプシン / 光 / 生物物理 / オプトジェネティクス / エネルギー変換 / 受容体
研究開始時の研究の概要

光受容タンパク質「ロドプシン」は光エネルギーを吸収し、レチナールの異性化を介して化学エネルギーへと変換する。化学エネルギーは、タンパク質の構造変化として力学エネルギーに変換され、分子機能が発現する。また、ロドプシンが吸収した光は、蛍光(光エネルギー)にも変換される。このように、本領域における『発動分子』の定義(外部エネルギーを別エネルギーに変えるもの)から、ロドプシンはまさに「発動分子」そのものと言える。このような背景のもと、本研究では、ロドプシンによる『光→化学・力学・光』エネルギーへの変換機構の理解と光生命機能操作への利用を行い、ロドプシン型『発動分子』の基礎学理構築を行う。

研究実績の概要

ロドプシンは光エネルギーを吸収し、レチナールの異性化を介して化学エネルギーへと変換する。化学エネルギーは、タンパク質の構造変化として力学エネルギーに変換され、分子機能が発現する。また、ロドプシンは、蛍光を発する特性を有し、光エネルギーにも変換可能である。このように、本領域における『発動分子』の定義(外部エネルギーを別エネルギーへ変えるもの)から、ロドプシンはまさに“発動分子”そのものと言える。このような背景のもと、本研究では、ロドプシンによる『光-->化学・力学・光』エネルギーへの変換機構の理解と光遺伝学的利用を行うことで、ロドプシン型『発動分子』の基礎学理構築を行うことを目的とした。
本研究では各項目について以下の成果を得た。
(1)『光→化学変換』:ここでは、特に色(吸収波長)と反応速度に着目し、その改変体を作成した。色の変化は励起可能な波長域を拡げ、光操作に新たなツールを提供するものであり、反応が早い/遅い分子は、分子機能の高速制御/活性型中間体の滞留時間の延長による1光子あたりの分子機能活性の増大が期待される。
(2)『光→力学変換』:ここでは、タンパク質の力学的構造変化が生理応答に直結していることに着目し、ロドプシンによる多様な力学変換分子の創成と生命機能操作(細胞死、神経制御等)を実現した。
(3)『光→光変換』:一部のロドプシンが、高発光性を示すことを明らかにし、さらに網羅的変異導入による高発光化にも成功した。また、動物個体において閾値以下かつ高速(ms)の膜電位センサーとして利用可能であることを実証した。これらのロドプシンは、従来のCa2+インディケーター型膜電位センサーに代わるツールとなることが期待される。
以上の成果は、12報の原著論文、10報の総説・解説論文、2件の特許出願、各種メディア報道、研究代表者および研究協力者の各種受賞につながった。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (23件) (うち国際共著 2件、 査読あり 17件、 オープンアクセス 16件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 2件、 招待講演 7件) 備考 (1件) 産業財産権 (4件) (うち外国 2件)

  • [国際共同研究] The Pennsylvania State University/Montana State University(米国)

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    • 著者名/発表者名
      Kurihara Marie、Thiel Vera、Takahashi Hirona、Kojima Keiichi、Ward David M.、Bryant Donald A.、Sakai Makoto、Yoshizawa Susumu、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 71 号: 2 ページ: 154-164

    • DOI

      10.1248/cpb.c22-00774

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2023-02-01
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    • 著者名/発表者名
      Kawanishi Shiho、Kojima Keiichi、Shibukawa Atsushi、Sakamoto Masayuki、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      ACS Omega

      巻: 8 号: 5 ページ: 4826-4834

    • DOI

      10.1021/acsomega.2c06980

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    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure and mechanism of oxalate transporter OxlT in an oxalate-degrading bacterium in the gut microbiota2023

    • 著者名/発表者名
      Jaunet-Lahary Titouan、Shimamura Tatsuro、Hayashi Masahiro、Nomura Norimichi、Hirasawa Kouta、Shimizu Tetsuya、Yamashita Masao、Tsutsumi Naotaka、Suehiro Yuta、Kojima Keiichi、Sudo Yuki、Tamura Takashi、Iwanari Hiroko、Hamakubo Takao、Iwata So、Okazaki Kei-ichi、Hirai Teruhisa、Yamashita Atsuko
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 1730-1730

    • DOI

      10.1038/s41467-023-36883-5

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    • 著者名/発表者名
      Kojima Keiichi、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 13 号: 8 ページ: 5367-5381

    • DOI

      10.1039/d2ra07073a

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    • 著者名/発表者名
      Sudo Yuki、Terakita Akihisa、Kandori Hideki
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 20 号: Supplemental ページ: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.s001

    • ISSN
      2189-4779
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    • 著者名/発表者名
      Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 20 号: Supplemental ページ: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.s021

    • ISSN
      2189-4779
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      巻: 12 号: 1 ページ: 16422-16422

    • DOI

      10.1038/s41598-022-20784-6

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    • 著者名/発表者名
      須藤雄気
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      生物物理

      巻: 62 号: 1 ページ: 1-1

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      0582-4052, 1347-4219
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    • 著者名/発表者名
      須藤 雄気
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 62 号: 5 ページ: 312-313

    • DOI

      10.2142/biophys.62.312

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
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  • [雑誌論文] Expression of microbial rhodopsins in Escherichia coli and their extraction and purification using styrene-maleic acid copolymers2022

    • 著者名/発表者名
      Kojima Keiichi、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 3 号: 1 ページ: 101046-101046

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2021.101046

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    • 著者名/発表者名
      Yasuda Satoshi、Akiyama Tomoki、Kojima Keiichi、Ueta Tetsuya、Hayashi Tomohiko、Ogasawara Satoshi、Nagatoishi Satoru、Tsumoto Kouhei、Kunishima Naoki、Sudo Yuki、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 126 号: 5 ページ: 1004-1015

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.1c08684

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  • [雑誌論文] Phototriggered Apoptotic Cell Death (PTA) Using the Light-Driven Outward Proton Pump Rhodopsin Archaerhodopsin-32022

    • 著者名/発表者名
      Nakao Shin、Kojima Keiichi、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 144 号: 9 ページ: 3771-3775

    • DOI

      10.1021/jacs.1c12608

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  • [雑誌論文] 光がくすりになる!?―ロドプシンによる生命機能の光操作2022

    • 著者名/発表者名
      須藤雄気、小島慧一
    • 雑誌名

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      巻: 77 ページ: 64-65

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  • [雑誌論文] 光+ロドプシン=くすり2022

    • 著者名/発表者名
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    • 雑誌名

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    • 著者名/発表者名
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    • 雑誌名

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      巻: 31 ページ: 49-57

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  • [雑誌論文] Microbial Rhodopsins as Multi-functional Photoreactive Membrane Proteins for Optogenetics2021

    • 著者名/発表者名
      Nakao Shin、Kojima Keiichi、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Biological & Pharmaceutical Bulletin

      巻: 44 号: 10 ページ: 1357-1363

    • DOI

      10.1248/bpb.b21-00544

    • NAID

      130008095840

    • ISSN
      0918-6158, 1347-5215
    • 年月日
      2021-10-01
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    • 著者名/発表者名
      Hayashi Masahiro、Kojima Keiichi、Sudo Yuki、Yamashita Atsuko
    • 雑誌名

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      巻: 30 号: 10 ページ: 2161-2169

    • DOI

      10.1002/pro.4154

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    • 著者名/発表者名
      Kikuchi Masuzu、Kojima Keiichi、Nakao Shin、Yoshizawa Susumu、Kawanishi Shiho、Shibukawa Atsushi、Kikukawa Takashi、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 14765-14765

    • DOI

      10.1038/s41598-021-94181-w

    • NAID

      120007147387

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    • 著者名/発表者名
      Kawamura Izuru、Seki Hayato、Tajima Seiya、Makino Yoshiteru、Shigeta Arisu、Okitsu Takashi、Wada Akimori、Naito Akira、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: advpub 号: 0 ページ: 177-185

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v18.019

    • NAID

      130008072373

    • ISSN
      2189-4779
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    • 著者名/発表者名
      Tsujimura Masaki、Kojima Keiichi、Kawanishi Shiho、Sudo Yuki、Ishikita Hiroshi
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 10

    • DOI

      10.7554/elife.72264

    • NAID

      120007183236

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    • 著者名/発表者名
      Tsuneishi Taichi、Takahashi Masataka、Tsujimura Masaki、Kojima Keiichi、Ishikita Hiroshi、Takeuchi Yasuo、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Frontiers in Molecular Biosciences

      巻: 8 ページ: 794948-794948

    • DOI

      10.3389/fmolb.2021.794948

    • NAID

      120007183231

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    • 著者名/発表者名
      Sudo Y.
    • 学会等名
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    • 著者名/発表者名
      須藤雄気
    • 学会等名
      第59回・日本生物物理学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
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  • [学会発表] 『光がくすりになる!?』2021

    • 著者名/発表者名
      須藤雄気
    • 学会等名
      第42回・生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.pharm.okayama-u.ac.jp/lab/bukka/

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      須藤雄気、小島慧一
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    • 産業財産権種類
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      特許
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      2021-153788
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      2021
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    • 権利者名
      須藤雄気、小島慧一、中尾新
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2021
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URL: 

公開日: 2021-04-28   更新日: 2023-12-25  

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