糞石ゲノム解析による摂食物同定法の確立

• 研究領域: 中国文明起源解明の新・考古学イニシアティブ
• 研究課題/領域番号: 21H05362
• 研究種目: 学術変革領域研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 学術変革領域研究区分(Ⅰ)
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 太田 博樹 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (40401228)
• 研究期間 (年度): 2021-09-10 – 2023-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2022年度)
• 配分額: 10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円); 2022年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2021年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
• キーワード: 糞石 / ゲノム解析 / 摂食物 / 古代DNA / キャプチャー法 / ゲノム / 古代ゲノム / NGS / 食性

研究開始時の研究の概要

糞便には、その糞便をした生物（ホスト）由来のDNAの他に、腸内細菌由来DNAおよび摂食物由来DNAなどが含まれている。糞便に含まれるDNAを次世代シークエンサー（next generation sequencer：NGS）を用いて網羅的ゲノム解析することにより得られる情報は、その糞便をした生物を取り巻く環境や生態系をも反映している。糞石は、過去の生物の糞便が形状を維持して残存しているものである。糞石ゲノム解析を行うことができれば、過去の環境や生態系の情報をも獲得できる。本研究は、私達の研究グループがもつ古代ゲノム解析技術を応用し、糞石ゲノム解析による摂食物同定法の確立を目指す。