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大規模量子化学計算と結晶構造DBを用いた超秩序構造のシナジー効果・動的特性の解明

公募研究

研究領域超秩序構造が創造する物性科学
研究課題/領域番号 21H05544
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関北海道大学

研究代表者

小林 正人  北海道大学, 理学研究院, 准教授 (40514469)

研究期間 (年度) 2021-09-10 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
2022年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2021年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
キーワード超秩序構造 / 大規模計算 / 準安定結晶構造 / データベース / 反応経路自動探索 / 量子化学 / 分子動力学 / 位相的データ解析 / 理論化学 / 大規模系計算 / 結晶構造
研究開始時の研究の概要

「シナジー効果」と「動的特性」の2点に焦点を当て、超秩序構造材料の機能発現機構を原子レベルで解明するための計算化学プラットフォームを構築して領域内の融合研究に利用する。具体的には、(1)多様な超秩序構造材料の大規模量子分子動力学計算を実現するプログラムの開発と応用、(2)準安定結晶構造データベースとパーシステント・ホモロジー解析を利用したアモルファス構造と結晶構造の対応付けを行う。プラットフォーム構築と応用研究を通じて、超秩序構造の学理形成に資する。

研究実績の概要

本研究では、(1)多様な超秩序構造材料の大規模量子分子動力学計算を実現するプログラムの開発と、(2)準安定結晶構造データベースとパーシステント・ホモロジー解析を利用したアモルファス-結晶の構造相関解析手法の開発を推進することにより、超秩序構造材料の機能発現機構を原子レベルで解明する計算化学プラットフォームを構築し、領域内の融合研究に利用する。
(1)に関して、昨年度開発した複合欠陥の大規模量子化学計算手法であるDC-xTB法のプログラムを拡張し、周期境界条件計算に対応した。本プログラムではエネルギー勾配の算定も可能であり、分子動力学計算に利用することもできる。また、部分状態密度(PDOS)のような電子状態を見ることも可能であり、これらの機能を利用した領域内共同研究も展開した。
(2)に関して、これまでSiO2とTiO2、MgOのデータベースを作成してきたが、本年度はSiO2と同様にガラス形成能の高いGeO2、また、酸化物以外で比較的ガラス形成能の高いZnCl2の準安定結晶構造データベースを作成し、そのパーシステント・ホモロジー解析を行った。低エネルギー準安定構造のダイアグラムを重ね合わせると、GeO2はSiO2と同様の傾向が見られたが、ZnCl2は低エネルギー準安定構造の数が非常に多く、酸化物と同様には比較できないことがわかった。
その他、領域内の融合研究として、GRRMを用いた4-ヒドロキシメチルフルフラールからのフミン生成初期過程の探索、パーシステント・ホモロジーを用いた反応経路地図の特徴量抽出法の開発、などを行った

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 3件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Divide-and-Conquer Linear-Scaling Quantum Chemical Computations2023

    • 著者名/発表者名
      H. Nakai, M. Kobayashi, T. Yoshikawa, J. Seino, Y. Ikabata, Y. Nishimura
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry A

      巻: 127 号: 3 ページ: 589-618

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.2c06965

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] DC-xTB-MD法: 複合欠陥を含む超大規模系の量子分子動力学計算手法の開発2023

    • 著者名/発表者名
      藤原孝太郎・西田叡倫・小林正人・武次徹也
    • 学会等名
      化学系学協会北海道支部2023年冬季研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Characterizing Reaction Route Map of Realistic Molecular Reactions based on Weight Rank Clique Filtration of Persistent Homology2023

    • 著者名/発表者名
      B. Murayama, M. Kobayashi, M. Aoki, S. Ishibashi, T. Saito, T. Nakamura, H. Teramoto, and T. Taketsugu
    • 学会等名
      10th conference of the Asia Pacific Association of Theoretical and Computational Chemistry (APATCC-10)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Toward large-scale quantum chemical calculations with annealers: Divide-and-conquer (DC) and annealing + Bayesian-optimization configuration interaction (ABCI) methods2023

    • 著者名/発表者名
      M. Kobayashi
    • 学会等名
      10th conference of the Asia Pacific Association of Theoretical and Computational Chemistry (APATCC-10)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] DC-xTB法: 複合欠陥を含む超大規模系の量子化学計算手法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      藤原孝太郎・西田叡倫・小林正人・武次徹也
    • 学会等名
      第24回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 大規模量子化学計算法divide-and-conquer法の現在と展望2022

    • 著者名/発表者名
      小林正人
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会 20周年記念シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Large-scale quantum chemical calculations based on divide-and-conquer (DC) method: Recent developments and future prospects2022

    • 著者名/発表者名
      M. Kobayashi
    • 学会等名
      T2CoMSA monthly talk
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] バイオマス由来HMFのフミン化とアセタール保護によるその抑制に関する計算化学的研究2022

    • 著者名/発表者名
      田代啓介・小林正人・中島清隆・武次徹也
    • 学会等名
      シンポジウム「化学反応経路探索のニューフロンティア2022」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 準安定結晶構造探索とパーシステント・ホモロジー解析によるアモルファス構造と結晶構造の橋渡し2022

    • 著者名/発表者名
      小林正人・宮越洸二・斉田謙一郎・小野寺陽平・志賀元紀・小原真司・武次徹也
    • 学会等名
      シンポジウム「化学反応経路探索のニューフロンティア2022」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 反応経路に基づくフミン生成反応の計算化学的研究2022

    • 著者名/発表者名
      田代啓介・小林正人・中島清隆・武次徹也
    • 学会等名
      分子科学討論会2022横浜
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Weight Rank Clique Filtrationを用いたパーシステント・ホモロジーによる実在分子の反応経路地図の可視化2022

    • 著者名/発表者名
      村山武来・小林正人・青木雅允・石橋卓・齋藤琢弥・中村壮伸・寺本央・武次徹也
    • 学会等名
      分子科学討論会2022横浜
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 大規模量子化学計算法divide-and-conquer法の現在と展望2022

    • 著者名/発表者名
      小林正人
    • 学会等名
      2022年度第1回計算科学フォーラム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 重み付きグラフに対するパーシステント・ホモロジー解析と化学反応経路地図への応用2022

    • 著者名/発表者名
      小林正人・青木雅允・村山武来・石橋卓・齋藤琢弥・中村壮伸・寺本央・武次徹也
    • 学会等名
      TDA-MI Workshop 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒドロキシメチルフルフラールからのフミン生成に対する反応経路解析2021

    • 著者名/発表者名
      田代啓介・小林正人・中島清隆・武次徹也
    • 学会等名
      シンポジウム「化学反応経路探索のニューフロンティア2021」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-10-22   更新日: 2023-12-25  

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