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tRNAレパートリーの変化が与えるタンパク質の多面性

公募研究

研究領域マルチファセット・プロテインズ:拡大し変容するタンパク質の世界
研究課題/領域番号 21H05726
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
研究機関兵庫県立大学

研究代表者

吉久 徹  兵庫県立大学, 理学研究科, 教授 (60212312)

研究期間 (年度) 2021-09-10 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2022年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2021年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
キーワードtRNA / tRNAレパートリー / 翻訳環境 / ミトコンドリア / リボソーム / 翻訳 / コドン選択 / 核膜孔 / 出芽酵母
研究開始時の研究の概要

申請者らは酵母において、量の少ないtRNA種が呼吸条件下では軒並み発酵条件の2倍程度に増え、これによって翻訳におけるtRNA環境適合性指標が上昇する上位のタンパク質には、ミトコンドリアタンパク質や天然変性領域を持つ核膜孔タンパク質等が偏って分布することを見出した。こうした翻訳延長環境の変化が、各生育条件下でのタンパク質の量では無く、機能の質的な違い、すなわち、マルチファセット性を生む可能性について、本研究では酵母を用いて解析する。特に、こうしたタンパク質のオルガネラへの局在化や複合体形成の効率に多様性を与えるかに絞って検討を進める。

研究実績の概要

我々は酵母におけるtRNAレパートリーが生理条件でどう変化するかを、新規tRNA絶対定量法の開発などを通じて解析してきた。この中で、酵母では、発酵条件と呼吸条件とでは、後者に於いてminor tRNA全般が増加し、major tRNAが減少することを明らかにした。本計画ではtRNAレパートリーの制御が、翻訳環境を通じてタンパク質に多面性を与える可能性の検討を試みた。tRNAレパートリが個々のタンパク質の翻訳効率に与える影響は、tRNA adaptation index(tAI)で見積もられるが、発酵条件に比べて呼吸条件でtAIが上昇するタンパク質にはミトコンドリアタンパク質が多く見られる。今年度はミトコンドリア近傍で翻訳され翻訳に共役してミトコンドリアに取り込まれるタンパク質の翻訳状況をproximity specific ribosome profilingで解析する事を目指した。TOM膜透過装置に近接するミトコンドリア局在化シグナル受容体であるTom70にbirAを融合した場合、Om45との融合タンパク質に比べて、Avi-tag融合ribosomeタンパク質のbiotin化効率が非常に高く、適切なレベルのbiotin化条件の至適化が必要であった。残念ながら、酵母サンプルの調製には至ったものの、ribosome profilingまでは進めず、現在、継続して研究を進めている。他方、ミトコンドリア内膜のタンパク質膜透過装置TIM23複合体のサブユニットのうち呼吸条件下でtAIの上昇するTim17と変化しないTim50について、それらの安定性が発酵培地と呼吸培地で異ならないかをシクロヘキシミドチェイスで検討したが、両者とも基本的には両培養条件での安定性の違いを見いだせなかった。現在、継続して他のタンパク質の安定性や複合体形成に関しての解析を継続している。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Six identical tRNATrpCCA genes express a similar amount of mature tRNATrpCCA but unequally contribute to yeast cell growth2022

    • 著者名/発表者名
      Sachiko Hayashi, Masaya Matsui, Ayano Ikeda, Tohru Yoshihisa
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 86 号: 10 ページ: 1398-1404

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac134

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Multiphasic regulation of tRNA repertoires in budding yeast.2022

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshihisa, Nayuko Sasada, Momoka Irie, Moeka Taniwaki, Akihisa Nagai
    • 学会等名
      第23回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Formation and Maintenance of tRNA Repertoires in Saccharomyces cerevisiae2022

    • 著者名/発表者名
      Nayuko Sasada, Momoka Irie, Moeka Taniwaki, Masaya Matsui, Ayano Ikeda, Sachiko Hayashi, Akihisa Nagai, Tohru Yoshihisa
    • 学会等名
      The 30th Tokyo RNA Club
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 酵母の6つの完全に相同なtRNATrpCCA遺伝子は、等しく成熟tRNATrpCCAを供給するものの、生育に遺伝子座固有の影響を持つ。2022

    • 著者名/発表者名
      林紗千子、松井将也、池田彩乃、吉久徹
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Regulation of tRNA repertoires in the budding yeast.2022

    • 著者名/発表者名
      Nayuko Sasada, Momoka Irie, Akihisa Nagai, Moeka Taniwaki, Sachiko Hayashi, Tohru Yoshihisa
    • 学会等名
      CSH Asia RNA Biology
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Paralogue-specific regulation of RPS7/eS7 mRNAs via the 3’-UTR in budding yeast2022

    • 著者名/発表者名
      Sachiko Hayashi and Tohru Yoshihisa
    • 学会等名
      第23回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] tL(CAA) 遺伝子のイントロンの有無との奇妙な繋がり:出芽酵母でのRps7パラログ選択性と関連した細胞質及びミトコンドリアでの翻訳2022

    • 著者名/発表者名
      林 紗千子、吉久 徹
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Pumilio homologue Puf3p coordinates CAT5/COQ7 expression non-canonical binding-sequence dependently2022

    • 著者名/発表者名
      Sachiko Hayashi, Kazumi Iwamoto, Tohru Yoshihisa
    • 学会等名
      CSH Asia RNA Biology
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 出芽酵母におけるtRNAレパートリーの多面的制御2022

    • 著者名/発表者名
      笹田奈友子、入江百香、谷脇萌佳、永井陽久、吉久徹
    • 学会等名
      日本RNA学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-10-22   更新日: 2023-12-25  

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