APEX-Ribo-Seq: 近傍標識による非典型局所翻訳の網羅解析

• 研究領域: マルチファセット・プロテインズ：拡大し変容するタンパク質の世界
• 研究課題/領域番号: 21H05734
• 研究種目: 学術変革領域研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 七野 悠一 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 基礎科学特別研究員 (40748365)
• 研究期間 (年度): 2021-09-10 – 2023-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2022年度)
• 配分額: 10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円); 2022年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2021年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
• キーワード: リボソームプロファイリング / 翻訳 / RNA / 近傍標識 / 次世代シーケンサー

研究開始時の研究の概要

細胞内の翻訳状況を網羅的に解析するリボソームプロファイリング法の登場により、非典型的な翻訳動態が次々と明らかになっている。特定の箇所に局在したリボソームによって行われる局所翻訳も、非典型的な翻訳の1つである。局所翻訳はタンパク質の局在制御、そして細胞の機能に重要であるが、簡便で様々な局所環境に適応できる網羅的解析手法はこれまでにない。本研究では、近傍標識を用いて多様な局所翻訳を網羅的に解析する新規手法APEX-Ribo-Seqを確立する。