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アクティブ・ネマティクスに基づく分子ロボットの逆運動学理論の構築

公募研究

研究領域分子サイバネティクス ー化学の力によるミニマル人工脳の構築
研究課題/領域番号 21H05869
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅳ)
研究機関東京大学

研究代表者

宮廻 裕樹  東京大学, 大学院情報理工学系研究科, 助教 (40881206)

研究期間 (年度) 2021-09-10 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
2022年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2021年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
キーワードアクティブネマティクス / 分子モーター / 細胞骨格 / 分子ロボット / 制御工学 / アクティブ・ネマティクス / 逆運動学 / 等角写像 / トポロジカル欠陥
研究開始時の研究の概要

分子ロボットの駆動力として用いられている細胞骨格・モータータンパク質の複合体は,分子が高密度になるとトポロジカル欠陥(細胞骨格の配向角度が定義できない特異点)がアクティブに特定の方向に運動するアクティブ・ネマティクスと呼ばれる現象が生じることが知られている.本研究の目的は,トポロジカル欠陥のアクティブ性に着目し,細胞骨格やモータータンパク質を基盤とした分子ロボットにおける流体運動の逆運動学モデルの構築とその系統的な解法を確立することである.

研究実績の概要

本研究の目的は,細胞骨格・分子モーター系において発生するトポロジカル欠陥(配向角度が定義できない特異点)に着目し,分子ロボットの形状変化の制御理論を確立することである.本年度は,(i) 細胞骨格・分子モーター系によって形成されるアクティブネマチック流体場の計算法や(ii)分子ロボット内に夾雑物が含まれる場合の欠陥位置の生成位置制御に関する研究を遂行した.
(i)については,研究代表者らの先行研究によって構成されたネマチック液晶の配向場を陽に表現する公式を用いることで,アクティブ流体を駆動する外力項や,その結果として生成される流体の速度場を構成する計算手法を構築した.構築した計算手法は欠陥の位置を陽に考慮したものとなっており,分子ロボット内の細胞骨格・分子モーターによるアクティブな流体現象を考慮した場合の欠陥の運動軌跡の計算に応用できる.
(ii)については,分子ロボット内の夾雑物によって分子ロボットの変形の起点となるトポロジカル欠陥の位置がどのように変化し,どの程度制御可能であるかを予測するための計算法を構築した.夾雑物の大きさや形によって,分子ロボット内の欠陥の有無や生成位置の制御が可能であることを数値シミュレーションにより示した.
本研究では,分子ロボットの内部・外部の幾何学的形状を利用したロボットの形状変化の予測・制御の基礎理論を構築した.本研究課題で得られた成果は,本研究領域で研究されているSPAユニットの変形部分を担うAユニットの変形の制御などにつながることが期待される.

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Rapid pattern formation in model cell membranes when using an electron beam2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Miyazako, Takayuki Hoshino
    • 雑誌名

      Colloids and Surfaces B: Biointerfaces

      巻: 220 ページ: 112967-112967

    • DOI

      10.1016/j.colsurfb.2022.112967

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Surface-limited reactions for spatial control of kinesin-microtubule motility assays using indirect irradiation of an electron beam2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Miyazako, Ryuzo Kawamura, Takayuki Hoshino
    • 雑誌名

      Biomicrofluidics

      巻: 16 号: 6 ページ: 064105-064105

    • DOI

      10.1063/5.0124921

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Explicit calculation method for cell alignment in non-circular geometries2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Miyazako, Takaaki Nara
    • 雑誌名

      Royal Society Open Science

      巻: 9 号: 1 ページ: 211663-211663

    • DOI

      10.1098/rsos.211663

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 複素関数論に基づくアクティブネマチック流体の配向・速度場の計算理論2022

    • 著者名/発表者名
      宮廻裕樹, 奈良高明
    • 学会等名
      第6回分子ロボティクス年次大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Predictive Design of Orientational Order in Confined Active Nematic Materials2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Miyazako, Kohei Tsuchiyama, Takaaki Nara
    • 学会等名
      2022 MRS Fall Meeting & Exhibit
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 等角写像の最適化によるアクティブ・ネマティクスにおける欠陥位置制御2022

    • 著者名/発表者名
      宮廻裕樹, 奈良高明
    • 学会等名
      第34回自律分散システム・シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-10-22   更新日: 2023-12-25  

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