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生細胞内1分子FRET法による回転モータータンパク質のダイナミクス計測

公募研究

研究領域分子高次系機能解明のための分子科学―先端計測法の開拓による素過程的理解
研究課題/領域番号 22018018
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関東京大学 (2011)
大阪大学 (2010)

研究代表者

飯野 亮太  東京大学, 大学院・工学系研究科, 講師 (70403003)

研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,000千円 (直接経費: 4,000千円)
2011年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
2010年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
キーワード1分子計測 / 蛍光共鳴エネルギー移動 / 分子モーター / 1分子イメージング / ATP合成酵素 / FRET / 大腸菌
研究概要

固定子aサブユニットにSNAPタグ、回転子εサブユニットにCLIPタグを導入したF_oF_1に
Alexa647-benzylguanineおよびTMR-benzylcytosineを反応させ特異的結合を確認した。またリポソームに再構成した蛍光標識FoF1の1分子FRET計測を行い、回転子の向きを反映した3段階(L,M,H)のFRET効率が得られた。しかしながらFRETの経時変化計測では、一方向の回転に対応するL→M→H→Lといった順序だったFRET変化をみせた分子の割合は約20%と低く、L→M→Lのように2状態を可逆的に遷移する分子が多くみられた。この原因として、1)タグの位置が適切でなく蛍光色素の位置が一意に決まらない、2)リポソーム膜にきちんと再構成されていないFoF1の割合が高い、等の可能性が考えられた。1)の可能性を検証するため、タグの位置を変えたFoF1を様々に作製し改善を試みた。しかしながら現在までのところ大幅な改善には至っていない(1)。よって2)の可能性が高いと考えられた。
一方、大腸菌ではFoF1の細胞膜への再構成の効率は問題にする必要はない。そこで大腸菌での1分子計測を行うため、蛍光色素で標識後に菌体を培養し蛍光標識FoF1の密度を低下させた。その結果、細胞膜上を拡散する1分子FoF1の観察に成功した。しかしながら、Alexa647-benzylguanineの細胞膜透過性が低く、大腸菌内での1分子FRET計測には至らなかった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

予想と反し、順序だったFRET変化をみせた分子の割合は約20%と低く、L→M→Lのように2状態を可逆的に遷移する分子が多くみられた。Alexa647-benzylguanineの細胞膜透過性が低く、大腸菌内での1分子FRET計測には至らなかった。これらの点を解決する必要が生じたため、やや遅れていると判断した。

今後の研究の推進方策

光活性化蛍光タンパク質を用いた1分子FRET計測に取り組む。またFRET計測だけでなく、回転子と固定子に導入した2種の色素の向きを蛍光偏光で同時に1分子計測して回転速度を見積もる手法も試す。

報告書

(2件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (9件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Principle role of the arginine finger in rotary catalysis of F1-ATPase2012

    • 著者名/発表者名
      Komoriya Y, Ariga T, Iino R, Imamura H, Okuno D, Noji H
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: (First published online) 号: 18 ページ: 15134-15142

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.328153

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-speed atomic force microscopy reveals rotary catalysis of rotorless F1-ATPase2011

    • 著者名/発表者名
      T. Uchihashi, R. Iino, T. Ando, and H. Noji
    • 雑誌名

      Science

      巻: 333 号: 6043 ページ: 755-758

    • DOI

      10.1126/science.1205510

    • NAID

      120006575873

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Activation and stiffness of the inhibited states of F_1-ATPase probed by single-molecule manipulation.2010

    • 著者名/発表者名
      Saita E, Iino R, Suzuki T, Feniouk BA, Kinosita K.Jr, Yoshida M.
    • 雑誌名

      J Biol Chem.

      巻: 285 ページ: 11411-11417

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] F1ナノモーターの1分子計測のこれから:観る、操作するを超えて2012

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      財団法人新世代研究所2011年度第2回バイオ単分子研究会
    • 発表場所
      千葉(招待講演)
    • 年月日
      2012-02-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 生体回転ナノモーターの1分子可視化計測2011

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      H23年度日本分光学会生細胞分光部会シンポジウム
    • 発表場所
      横浜(神奈川県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-25
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule imaging of ATP synthase in vitro and in living cells2011

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会シンポジウム,New experimental tools for structural changes of membrane proteins : Beyond X-ray structures
    • 発表場所
      姫路(兵庫県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule FRET measurement of rotary motor protein dynamics in living cells2011

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      The 5th Symposium "Molecular Science for Supra Functional Systems"
    • 発表場所
      Sapporo, Japan(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-13
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 分子モーターの性質を調べる1分子計測技術2011

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      (社)日本電気計測器工業会 関西支部 第29回戦略的基盤技術検討委員会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2011-02-07
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Subunit rotation in a single F_0F_1-ATP synthase in a living bacterium monitored by FRET.2011

    • 著者名/発表者名
      Seyfert K., Oosaka T., Yaginuma H., Ernst S.,, Noji H., Iino R., Borsch M.
    • 学会等名
      SPIE Photonics West 2011
    • 発表場所
      サンフランシスコ、米国
    • 年月日
      2011-01-22
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ATP合成酵素を1分子技術で視る・操る2010

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      光塾第2回研究会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-11
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule studies on the fluctuation and function of a rotary motor protein ATP synthase2010

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      The 4th International Symposium "Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions"
    • 発表場所
      大津
    • 年月日
      2010-11-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 1分子技術で生体回転ナノモーターを視る・操る2010

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      特定領域研究「高次系分子科学」若手の会研究会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2010-11-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] Fundamental Properties and Structure of F_1-ATPase. In "Encyclopedia of Biophysics" edited by Roberts G.C.2011

    • 著者名/発表者名
      Okuno D, Iino R, Noji H.
    • 出版者
      Springer (India)(In press)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] ATP synthase-Structure and dynamics of the smallest rotary motor proteins. In "Moleculaz Biology of Assemblies and Machines" edited by Baumeister W, Johnson L, Perham R, and Steven A.2011

    • 著者名/発表者名
      Noji H, Iino R.
    • 出版者
      Garland (England)(In press)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2018-03-28  

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