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孤立ナノ空間を有する有機金属錯体での特異な光化学反応の分光解析

公募研究

研究領域分子高次系機能解明のための分子科学―先端計測法の開拓による素過程的理解
研究課題/領域番号 22018030
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関分子科学研究所

研究代表者

古谷 祐詞  分子科学研究所, 生命・錯体分子科学研究領域, 准教授 (80432285)

研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,000千円 (直接経費: 4,000千円)
2011年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
2010年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
キーワード超分子 / 赤外分光法 / 光化学 / 生体分子 / 生物物理
研究概要

本研究では、実在高次系である蛋白質そのものを研究する一方で、その触媒反応の本質のみを取り出したモデル系の研究も重要と考え、自己組織化により形成された「かご状有機金属錯体」のナノ空間中での光化学反応を赤外および可視分光法により明らかにすることを目指している。
これまでにアダマンタンを内包したかご状錯体に対する低温赤外分光解析により、光電子移動によるアダマンタンおよびかご状錯体の構造変化を検出した(Y.Furutani et al.,J.Am.Chem.Soc.,2009)。このような構造変化を実時間で捉えるために、新たに時間分解赤外分光計測系を立ち上げた。かご状錯体のアダマンタンの光酸化反応は不可逆的であるため、繰り返し励起が可能な[Ru(bpy)_3]^<2+>」・2Cl^-を用いて計測条件の最適化を行った。50ナノ秒での光反応誘起赤外差スペクトルの計測が可能であることを確認した。
光受容タンパク質であるバクテリオロドプシンに対して行った時間分解赤外分光計測のデータをSVDやGlobal Fittingにより詳細に解析した。バクテリオロドプシンの内部結合水の0-D伸縮振動やレチナールシッフ塩基のN-D伸縮振動を帰属した。これらの赤外スペクトル変化はプロトン移動が行われる中間体状態でのタンパク質内部の水素結合構造の変化を捉えたものである。
カリウムイオンチャネルであるKcsAはアルカリ金属イオンであるK^+を選択的に透過するイオンチャネルである。そのイオン透過孔での配位構造を明らかにするため、全反射赤外分光解析による研究を平成20年度から継続して行っている。カリウム濃度依存的な赤外差スペクトルを解析することにより、アミドIに特徴的な変化が見られることを明らかにした。

報告書

(2件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (37件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (28件)

  • [雑誌論文] Protein-Bound Water Molecules in Primate Red- and Green-Sensitive Visual Pigments2012

    • 著者名/発表者名
      Katayama, et al
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 51 号: 6 ページ: 1126-1133

    • DOI

      10.1021/bi201676y

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chimeric microbial rhodopsins containing the third cytoplasmic loop of bovine rhodopsin2011

    • 著者名/発表者名
      A.Nakatsuma, T.Yamashita, K.Sasaki, A.Kawanabe, K.Inoue, Y.Furutani, Y.Shichida, H.Kandori
    • 雑誌名

      Biophys.J

      巻: 100 号: 8 ページ: 1874-1882

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2011.02.054

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sensory rhodopsin-I as a Bidirectional Switch : Opposite conformational changes from the same photoisomerization2011

    • 著者名/発表者名
      J.Sasaki, H.Takahashi, Y.Furutani, H.Kandori, J.L.Spudich
    • 雑誌名

      Biophys.J.

      巻: 100 号: 9 ページ: 2178-2183

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2011.03.026

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 全反射赤外分光法による膜タンパク質の構造機能相関研究の現状と展望2011

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 雑誌名

      化学と工業

      巻: 64 ページ: 694-695

    • NAID

      10029523383

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [雑誌論文] Sodium or Lithium Ion-Binding-Induced Structural Changes in the K-ring of V-ATPase from Enterococcus hirae Revealed by ATR-FTIR Spectroscopy2011

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani, et al.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc.

      巻: 133 ページ: 2860-2863

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Low-Temperature FTIR Study of Gloeobacter Rhodopsin : Presence of Strongly Hydrogen-Bonded Water and Long-Range Structural Protein Perturbation upon Retinal Photoisomerization2010

    • 著者名/発表者名
      Kyohei Hashimoto, et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 49 ページ: 3343-3350

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Protein Fluctuations as the Possible Origin of the Thermal Activation of Rod Photoreceptors in the Dark2010

    • 著者名/発表者名
      Victor Lorenz Fonfria, et al.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc.

      巻: 132 ページ: 5693-5703

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An FTIR Study of the Photoreaction of Bovine Rhodopsin in the Presence of Hydroxylamine2010

    • 著者名/発表者名
      Kouta Katayama, et al.
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem.B

      巻: 114 ページ: 9039-9046

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular insight into intrinsic heme distortion in ligand binding in hemoprotein2010

    • 著者名/発表者名
      Saburo Neya, et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 49 ページ: 5642-5650

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 全反射赤外分光法によるMg^<2+>輸送体MgtEのイオン選択機構の解析2012

    • 著者名/発表者名
      木村哲就
    • 学会等名
      2011年度日本生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 年月日
      2012-03-19
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Time-resolved infrared study on the light-driven chloride ion pump protein2012

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences : Experiments and Simulations
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良県)(招待講演)
    • 年月日
      2012-01-10
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Ion-selective mechanism of Mg^<2+> transporter MgtE studied by attenuated total reflection FTIR spectroscopy2012

    • 著者名/発表者名
      Tetsunari Kimura
    • 学会等名
      4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences : Experiments and Simulations
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良県)
    • 年月日
      2012-01-10
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Surface-enhanced ATR FTIR difference spectroscopy from a halorhodopsin monolayer on gold : dependence of spectral features on film properties2012

    • 著者名/発表者名
      Hao Guo
    • 学会等名
      5th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2011)
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Stepwise conformational changes upon anion pumping during the pharaonis halorhodopsin photocycle revealed by H/D unexchangeable amide-A vibrations2012

    • 著者名/発表者名
      Tetsunari Kimura
    • 学会等名
      5th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2011)
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Surface-enhanced ATR-FTIR difference spectroscopy from a halorhodopsin monolayer on gold island films2011

    • 著者名/発表者名
      Hao Guo
    • 学会等名
      The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Ion-selective mechanism of Mg^<2+> transporter MgtE studied by attenuated total reflection FTIR spectroscopy2011

    • 著者名/発表者名
      Tetsunari Kimura
    • 学会等名
      The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Development of stopped-flow attenuated total reflection FTIR spectroscopy for detecting dynamic structural changes in ion transporters2011

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Ion-protein interactions studied by ATR-FTIR spectroscopy2011

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      14th Asian Chemical Congress
    • 発表場所
      Queen Sirikit Convention Center (Bangkok, Thailand)(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-11
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 赤外分光法でみるV型ATPaseのイオン結合・解離に伴う構造変化2011

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      平成22年度日本生物物理学会中部支部討論会
    • 発表場所
      名古屋大学野依学術交流センター(愛知)
    • 年月日
      2011-03-31
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Ion-binding-induced Structural Changes in Membrane Proteins Studied by ATR-FTIR Spectroscopy2011

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      Third Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences : -Experiments and Simulations
    • 発表場所
      Lotte Hotel, Jeju,(韓国)
    • 年月日
      2011-02-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] FTIR Studies of Membrane Proteins2011

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      The Winter School of Sokendai/Asian CORE Program "Frontiers of Molecular Science-Life, Material, Energy, and Space"
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知)
    • 年月日
      2011-02-21
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 全反射赤外分光法によるMg^<2+>輸送体MgtEのイオン選択機構の解析2011

    • 著者名/発表者名
      木村哲就
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Spectroscopic Analysis of Specific Photochemical Reactions in an Isolated Nanospece Formed by a Well-Designed Organo-Metal Complex2011

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      The 5^<th> Symposium Molecular Science for Supra Functional Systems-Development of Advanced Methods for Exploring Elementary Processes-
    • 発表場所
      Royton Sapporo(北海道)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] SEIRA difference spectroscopy on a halorhodopsin monolayer tethered on gold surface2011

    • 著者名/発表者名
      Hao Guo
    • 学会等名
      5th Asia and Oceania Conference on Photobiology
    • 発表場所
      奈良県新公会堂(奈良県)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Modification of Gold Thin Film Suitable for Surface-enhanced Vibrational Spectroscopy on Membrane Proteins2010

    • 著者名/発表者名
      Hao Guo
    • 学会等名
      4^<th> International Symposium on Nanomedicine (ISNM2010)
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知)
    • 年月日
      2010-11-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 孤立ナノ空間を有する有機金属錯体での特異な光化学反応の分光解析2010

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      特定領域研究「高次系分子科学」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東北大学片平さくらホール(宮城)
    • 年月日
      2010-11-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 時間分解FTIR差スペクトル計測によるファラオニスハロロドプシンの陰イオン輸送過程での構造変化解析2010

    • 著者名/発表者名
      木村哲就
    • 学会等名
      第36回日本生体エネルギー研究会&特定領域研究「革新的ナノバイオ」合同シンポジウム
    • 発表場所
      大阪大学銀杏会館(大阪)
    • 年月日
      2010-11-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] X-D伸縮振動領域を含めた時間分解赤外分光法によるバクテリオロドプシンの光誘起構造変化解析2010

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      第36回日本生体エネルギー研究会&特定領域研究「革新的ナノバイオ」合同シンポジウム
    • 発表場所
      大阪大学銀杏会館(大阪)
    • 年月日
      2010-11-18
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Modification of Gold Thin Film Suitable for Surface-enhanced Vibrational Spectroscopy on Membrane Proteins2010

    • 著者名/発表者名
      Hao Guo
    • 学会等名
      The Overseas Sokendai Lecture in Bangkok 2010
    • 発表場所
      Chulalongkorn University, Bangkok,(タイ)
    • 年月日
      2010-10-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Stimulus-Induced Difference Infrared Spectroscopy for Membrane Proteins ; Visual and Archaeal-type Rhodopsins, and Flagella Motor Protein2010

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      Indo-Japan Joint Workshop on "New Frontiers of Molecular Spectroscopy ; from Gas Phase to Proteins"
    • 発表場所
      Hotel Kitano Plaza Rokkoso(兵庫)
    • 年月日
      2010-09-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Time-resolved FT-IR measurement of X-D stretching vibrations of Bacteriorhodopsin in micro- to mill- second time range2010

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      東北大学(宮城)
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Conformational Changes upon Chloride-ion Pumping During the pharaonis Halorhodopsin Photocycle Studied by Time-resolved FTIR Spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      Tetsunari Kimura
    • 学会等名
      The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      東北大学(宮城)
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 時間分解赤外分光法によるバクテリオロドプシンのX-D伸縮振動の解析2010

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      第4回分子科学討論会
    • 発表場所
      大阪大学(大阪)
    • 年月日
      2010-09-15
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ロドプシン-KcsA融合蛋白質の発現とFTIRによる構造変化解析2010

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      特定領域研究「高次系分子科学」第9回ミニ公開シンポジウム
    • 発表場所
      サギセミナーセンター(広島)
    • 年月日
      2010-08-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 赤外分光法によるイオン輸送蛋白質の構造変化解析2010

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      アドバンス生命理学特論:世話人;須藤雄気准教授(名大・院理)
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知)
    • 年月日
      2010-07-13
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 孤立ナノ空間を有する有機金属錯体での特異な光化学反応の分光解析2010

    • 著者名/発表者名
      古谷祐詞
    • 学会等名
      特定領域研究「高次系分子科学」第5回合同班会議
    • 発表場所
      南淡路ロイヤルホテル(兵庫)
    • 年月日
      2010-05-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Interaction between Membrane Proteins and Ions Studied by ATR-FTIR Spectroscopy : A Potential Tool for Drug Screening2010

    • 著者名/発表者名
      Yuji Furutani
    • 学会等名
      BIT's 1^<st> Annual International Conference of Medichem-2010
    • 発表場所
      Beijing International Convention Center, Beijing,(中国)
    • 年月日
      2010-05-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2018-03-28  

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