• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

膜タンパク質の膜組み込みの構造生物学

公募研究

研究領域タンパク質社会の研究の総合的推進
研究課題/領域番号 22020008
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

塚崎 智也  東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教 (80436716)

研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
6,400千円 (直接経費: 6,400千円)
2011年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2010年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
キーワード蛋白質 / 膜蛋白質 / 膜組み込み / 膜透過 / 機能発現 / Sec / 構造解析 / 構造生物学 / 膜組
研究概要

細胞におけるタンパク質の膜組み込み過程は,すべての生物に共通した必須の機構である。本研究では膜タンパク質の「機能発現システム」を詳細に理解する為に,真正細菌のタンパク質の膜組み込みに関わる膜タンパク質YidC(内膜への組込みに関与),BamA(外膜への膜組み込みに関与)の立体構造を決定し,その機能に迫ろうとした。YidC,BamAとも葉緑体とミトコンドリアにそのホモログが存在する。膜組込みに関わるタンパク質群の各構成因子の立体構造情報は得られつつあるが,YidC,BamAのX線結晶構造解析の例は(ホモログも含め)未だない。大きな構造変化を伴う膜組み込み過程を解明する為には,YidC,BamAの立体構造情報が必要不可欠である。本年度は,YidC,BamA共にX線結晶構造解析に適したサンプル調整を進めた。その結果,YidC,BamA共に,構造解析が可能となる分解能のX線回折点が観測され,構造決定に向けたデータの解析を進めた。また,YidCと相互作用してタンパク質の膜透過・膜組み込みに関与するSecDF膜タンパク質の構造を3.3Å分解能で決定した。SecDFの機能解析を平行して進め,「SecDFはproton-motive forceによってダイナミックな構造変化を繰り返しながら,ペリプラズム側で膜透過基質タンパク質と相互作用し,膜透過の高効率化に寄与する膜内在性シャペロンである」とのモデルを提唱し論文として発表した。

報告書

(2件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (8件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of the channelrhodopsin light-gated cation channel2012

    • 著者名/発表者名
      Hideaki E.Kato, Feng Zhang, Ofer Yizhar, Charu Ramakrishnan, Tomohiro Nishizawa, Kunio Hirata, Jumpei Ito, Yusuke Aita, Tomoya Tsukazaki, Shigehiko Hayashi, Peter Hegemann, Andres D.Maturana, Ryuichiro Ishitani, Karl Deisseroth, Osamu Nureki
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 482 号: 7385 ページ: 369-374

    • DOI

      10.1038/nature10870

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] tructure and function of SecDF, a protein export-enhancing membrane component2011

    • 著者名/発表者名
      Tsukazaki, T., et al
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 475 号: 7350 ページ: 235-238

    • DOI

      10.1038/nature09980

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction of the first periplasmic domain of SecDF, a translocon-associated membrane protein, from Thermus thermophilus2011

    • 著者名/発表者名
      越前友香, 他3名
    • 雑誌名

      Acta.Crystallograph.Sect.F Struct.Biol.Cryst.Commun.

      巻: 67 ページ: 1367-1370

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The mechanism of protein export enhancement by the SecDF membrane component2011

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也, 濡木理
    • 雑誌名

      BIOPHYSICS

      巻: 7 ページ: 129-133

    • NAID

      130001253088

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Secトランスロコンと共に機能するSecDF膜タンパク質の構造2011

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 51 ページ: 236-237

    • NAID

      10029482527

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [雑誌論文] タンパク質を膜透過させる分子装置2011

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也, 濡木理
    • 雑誌名

      化学工業

      巻: 62 ページ: 471-477

    • NAID

      40018847354

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [雑誌論文] Conformational Transition of Sec Machinery Inferred from Bacterial SecYE Structures2010

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也
    • 雑誌名

      SPring-8 Research Frontiers 2009

      ページ: 30-31

    • NAID

      10025975982

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Structure and function of a membrane component SecDF that enhances protein export2012

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也
    • 学会等名
      Gordon Conference on Protein Transport Across Cell Membranes
    • 発表場所
      ホテルガルベス(テキサス州アメリカ合衆国)
    • 年月日
      2012-03-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質の膜透過を促進する膜タンパク質SecDFの構造と機能2011

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也
    • 学会等名
      「過渡的複合体」公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学薬学部(東京都)(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-21
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Structure, function and evolution of the bacterial protein translocation machinery2010

    • 著者名/発表者名
      森博幸
    • 学会等名
      BMB2010
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • 年月日
      2010-12-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Secトランスロコンと共に機能するSecDF膜タンパク質の構造2010

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学川内キャンパス(宮城県)
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Crystal structure of SecDF, a Sec translocon-associated membrane protein2010

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium on Protein Community
    • 発表場所
      ホテル日航奈良(奈良県)
    • 年月日
      2010-09-14
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Crystallization trial of SecDF in space2010

    • 著者名/発表者名
      今吉啓一
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium on Protein Community
    • 発表場所
      ホテル日航奈良(奈良県)
    • 年月日
      2010-09-13
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Purification and crystallization of Thermus thermophilus SecYEG2010

    • 著者名/発表者名
      鹿島絢子
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium on Protein Community
    • 発表場所
      ホテル日航奈良(奈良県)
    • 年月日
      2010-09-13
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Secトランスロコンと共に機能するSecDF膜蛋白質の結晶構造2010

    • 著者名/発表者名
      塚崎智也
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • 年月日
      2010-06-18
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://first.lifesciencedb.jp/archives/2915

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2011/10.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2018-03-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi