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糖鎖認識を介したタンパク質社会の秩序維持機構の構造基盤の解明

公募研究

研究領域タンパク質社会の研究の総合的推進
研究課題/領域番号 22020039
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋大学 (2011)
大学共同利用機関法人自然科学研究機構(共通施設) (2010)

研究代表者

神谷 由紀子  名古屋大学, 工学研究科, 助教 (00527947)

研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,500千円 (直接経費: 4,500千円)
2011年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2010年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
キーワード糖鎖 / レクチン / 積荷輸送体 / 小胞体関連分解 / 立体構造解析 / 積荷輸送
研究概要

積荷輸送体の超分子形成と糖タンパク質の秩序制御の連関の解明
積荷輸送体の超分子形成メカニズムを解明するために、酵母のERGIC-53ホモログにあたるEmp46pとEmp47pのヘテロ多量体を研究対象とした。Emp46pおよびEmp47pのレクチン様ドメインと膜貫通領域の間に位置するコイルドコイル領域に着目し、超遠心解析等の手法を用いて溶液pHに依存した分子集合の様式を解析した。これにより、Emp46p/47pのコイルドコイル部位にはpHを感知する部位が備わっていることが示され、pH変化に応じてヘテロ多量体からホモ多量体へと変化する仕組みを明らかとすることができた。
ERADマシーナリーにおける標的糖タンパク質捕捉ユニットの分子間相互作用解析
ミスフォールド状態にある糖タンパク質は小胞体から細胞質へと逆行輸送されたのち、ユビキチンプロテアソームシステムによって分解される。糖タンパク質のERADに関わるタンパク質は、相互作用することにより超分子複合体を形成し、システムとしての作動効率を高めていると考えられる。ERADマシーナリーの構成因子の一つであるpeptide:N-glycanase(PNGase)は、プロテアソームによる分解に際して立体障害をもたらす糖鎖を、タンパク質から切除する酵素である。PNGaseは活性ドメインのN末端側にPUBドメインを有しているが、本ドメインがERADにおいていかなる役割を果たしているのか、その実体は不明であった。MRおよびフロンタルアフィニティークロマトグラフィー法を用いた相互作用解析の結果、PUBはHR23のUBLに対して特異的に結合することが明らかとなった。HR23はユビキチン鎖およびUBLと結合することができるUBAドメインを有しており、このドメインはUBLと分子内で相互作用している。このことから、PNGase-PUBがHR23のUBLを捕捉することにより、HR23のUBAがERAD基質のポリユビキチン鎖と結合することが可能な活性型へ変換されるものと考察される。

報告書

(2件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (13件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Molecular and structural basis for N-glycan-dependent determination of glycoprotein fates in cells2012

    • 著者名/発表者名
      Y.Kamiya, T.Satoh, K.Kato
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta-General Subjects

      巻: (in press) 号: 9 ページ: 1327-1337

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2011.12.017

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NMR characterization of the interaction between the PUB domain of peptide: N-glycanase and ubiquitin-like domain of HR23.2012

    • 著者名/発表者名
      Y.Kamiya, Y.Uekusa, A.Sumiyoshi, H.Sasakawa, T.Hirao, T.Suzuki, and K.Kato
    • 雑誌名

      FEBS Lett.

      巻: 586 号: 8 ページ: 1141-1146

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2012.03.027

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Overexpression of a homogeneous oligosaccharide with ^<13>C labeling by genetically engineered yeast strain.2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Kamiya, S.Yamamoto, Y.Chiba, Y.Jigami, and K.Kato
    • 雑誌名

      J. Biomol. NMR

      巻: 50 号: 4 ページ: 397-401

    • DOI

      10.1007/s10858-011-9525-1

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and molecular basis of carrbohydrate-protein interaction systems as potential therapeutic targets2011

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, Y., Yagi-Utsumi, M., Yagi, H., Kato, K.
    • 雑誌名

      Curr.Pharm.Des.

      巻: 17 ページ: 1672-1684

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] EDEM1 accelerates the trimming of α1,2-linked mannose on the C branch of N-glycans2010

    • 著者名/発表者名
      Hosokawa, N., Tremblay, L.O., Sleno, B., Kamiya, Y., Wada, I., Nagata, K., Kato, K., Herscovics, A
    • 雑誌名

      Glycobiology

      巻: 20 ページ: 567-575

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mannose 6-phosphate receptor homology domain-containing lectins in mammalian endoplasmic reticulum-associated degradation2010

    • 著者名/発表者名
      Hosokawa, N., Kato, K., Kamiya, Y.
    • 雑誌名

      Methods in Enzymology

      巻: 480 ページ: 181-197

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The role of MRH domain-containing lectins in ERAD2010

    • 著者名/発表者名
      Hosokawa, N., Kamiya, Y., Kato, K.
    • 雑誌名

      Glycobiology

      巻: 20 ページ: 651-660

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and molecular basis of carbohydrate-protein interaction systems as potential therapeutic targets

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, Y, Yagi-Utsumi M., Yagi H., Kato K.
    • 雑誌名

      Current Pharmaceutical Design

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 小胞体関連分解に関わる脱糖鎖酵素はPUBドメインを介してユビキチンおよびユビキチン様ドメインと結合する2012

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子、住吉晃、植草義徳、鈴木匡、加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会第132年会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • 年月日
      2012-03-29
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 糖鎖認識を介したタンパク質社会の秩序維持機構の構造基盤の解明2011

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子
    • 学会等名
      2011年度特定領域「タンパク質の社会」全体班会議
    • 発表場所
      別府湾ロイヤルホテル(大分県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-21
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Development of metabolic isotope-labeling techniques for NMR spectroscopic analyses of high-mannose-type oligosaccharides2011

    • 著者名/発表者名
      Yukiko Kamiya; Sayoko Yamamoto, Yasunori Chiba, Yoshifumi Jigami, Koichi Kato
    • 学会等名
      The International Symposium on Nuclear Magnetic resonance 2011
    • 発表場所
      OSNABASHI Hall (Yokohama, Japan)
    • 年月日
      2011-11-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Molecular basis of glycoprotein-fate determination through interactions with intracellular lectins2011

    • 著者名/発表者名
      Yukiko Kamiya
    • 学会等名
      Nagoya University Global COE Mini-Symposium : Toward Systems Glyoobiology "Biosynthesis and catabolism of glycoproteins"
    • 発表場所
      Nagoya University (Nagoya, Japan)(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子改変酵母を用いて安定同位体標識を施した高マンノース型糖鎖の超高磁場NMR解析2011

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子、山本さよこ、千葉靖典
    • 学会等名
      糖鎖科学名古屋拠点第9回「若手の力」フォーラム
    • 発表場所
      河合塾岐阜校(岐阜県)
    • 年月日
      2011-10-22
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Development of metabolic ^<13>C-labeling techniques for NMR analyses of high-mannose-type oligosaccharides using genetically engineered yeast strains2011

    • 著者名/発表者名
      Yukiko Kamiya, Sayoko Yamamoto, Yasunori Chiba, Yoshifumi Jigami, Koichi Kato
    • 学会等名
      The 71st Okazaki Conference on "New perspectives on molecular science of glycoconjugates"
    • 発表場所
      Okazaki Conference Center (Okazaki, Japan)
    • 年月日
      2011-10-13
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質の細胞内運命決定機構の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子
    • 学会等名
      生化学若い研究者の会第3回名古屋支部セミナー「生化名古屋・夏のセミナー」
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-19
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 安定同位体標識法と超高磁場NMR計測を用いた高マンノース型糖鎖の立体構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子、千葉靖典、喜多島敏彦、地神芳文、加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会 第131回年会
    • 発表場所
      ツインメッセ静岡(静岡県)
    • 年月日
      2011-03-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Development of metabolic ^<13>C-labeled techniques for NMR spectroscopic analyses of high-mannose-type oligosaccharides2010

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, Y, Chiba Y., Jigami Y., Kato K.
    • 学会等名
      The 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • 発表場所
      Hawaii (USA)
    • 年月日
      2010-12-14
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Molecular basis of the glycoprotein-fate determination governed by the intracellular lectins2010

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, Y, Nishio M., Kato K.
    • 学会等名
      Asian communications of glycobiology and glycotechnology
    • 発表場所
      Taipei (Taiwan)
    • 年月日
      2010-10-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Molecular basis of the glycoprotein-fate determination in cells2010

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, Y, Kamiya, D., Nishio M., Kato K.
    • 学会等名
      The 3^<rd> International Symposium on protein community
    • 発表場所
      Nara (Japan)
    • 年月日
      2010-09-13
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質の品質管理を担う超分子複合体の作動メカニズムの構造基盤の解明2010

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子、西尾美穂、加藤晃一
    • 学会等名
      第8回糖鎖名古屋拠点「若手の力」フォーラム
    • 発表場所
      名古屋大学 VBLホール(愛知県)
    • 年月日
      2010-09-06
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Development of metabolic ^<13>C-labeling techniques for NMR structural analyses of high-mannose-type oligosaccharides2010

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, Y, Chiba Y., Jigami Y., Kato K.
    • 学会等名
      21^<st> International Carbohydrate Symposium
    • 発表場所
      Makuhari(Japan)
    • 年月日
      2010-08-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] Protein Folding (E.C.Walters ed.)2011

    • 著者名/発表者名
      Serve O., Kamiya,Y, Kato K.
    • 出版者
      NOVA Science Publishers (New York)(in press)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2018-03-28  

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