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ドメイン構造をもたない天然変性タンパク質群における構造機能相関解析

公募研究

研究領域天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現
研究課題/領域番号 22113505
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京工業大学

研究代表者

相澤 康則  東京工業大学, バイオ研究基盤支援総合センター, 講師 (90418674)

研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
2011年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2010年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
キーワード天然変性 / シグナル伝達 / 分子認識 / ドメイン / タンパク質 / ゲノム / 構造機能相関 / ノンコーディング
研究概要

本研究では、天然変性タンパク質での「配列-構造-機能の対応関係」を追究するために、部分的にもドメイン構造を取り得ない、すなわちタンパク質全体が生理的条件下でランダムコイル状態にある"完全"天然変性タンパク質(NEDP(Naturally and Entirely Denatured protein))に対象を絞って、構造機能解析を進めた。23年度の構造解析として、22年度にクローニングした7種類の新規NEDP候補の二次構造を評価し、予想通り全長にわたって天然変性であるかどうかを検証した。具体的には、大腸菌内で組換えタンパク質としてタグ付き発現させた後、アフィニティーカラムで精製し、円二色分散計およびNMR(HSQC解析)を用いて二次構造を評価した。その結果、4種類のNEDPが生理的溶液条件下で全長にわたって天然変性であることが分かった。そこで次にこれら4種類の新規NEDPが細胞内で相互作用するタンパク質の同定を目指した。具体的には、各NEDPコード配列のN末端およびC末端に各種タグ配列が融合したタンパク質をヒト培養細胞内で発現させ、タグに対する抗体で免疫沈降後、質量分析を行った。得られた質量分析の結果をもとに変異体解析を進めたところ、主要な細胞内シグナル伝達の活性化制御に関わっているNEDPと、ミトコンドリア機能に関与するNEDPをそれぞれ発見することができた。本研究により、ドメインを持たないタンパク質の機能発現を研究する上で格好の事例を提示することができた。さらに上記とは別に新規NEDP候補42種類を、ヒトゲノムのヒトコーディング領域からクローニングし、機能性NEDPのさらなる探索のリソース構築を行った。

報告書

(2件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Genes that Integrate multiple adipogenic signaling pathways in human mesenchymal stem cells2011

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Tsuruta S, Tomita K, Kikuchi K, Yokoi T, Aizawa Y
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun.

      巻: 409(4) 号: 4 ページ: 786-791

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2011.05.089

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Basic and clinical studies on functional RNA molecules for advanced medical technologies.2010

    • 著者名/発表者名
      Takizawa T, Gemma A, Ui-Tei K, Aizawa Y, Sadovsky Y, Robinson JM, Seile M, Miyake K.
    • 雑誌名

      J.Nippon Med.Sch.

      巻: 77(2) ページ: 71-79

    • NAID

      130004147041

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] TUF study goes beyond RNA2011

    • 著者名/発表者名
      Yasunori Aizawa
    • 学会等名
      第9回Tokyo RNA Club
    • 発表場所
      慶応大学医学部(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ノンコーディング領域から発見された新規タンパク質群の構造機能相関2011

    • 著者名/発表者名
      福田牧葉、林宣宏、相澤康則
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場「エポカルつくば」
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ノンコーディング領域にコードされた短いタンパク質群の探索と構造機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      福田牧葉、伊藤智哉、林宣宏、中川裕之、相澤康則
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Small Protein World in the "Noncoding" Regions of the Human Genome2011

    • 著者名/発表者名
      Yasunori Aizawa
    • 学会等名
      Chemistry, Bioscience & Biomaterials for Bio-Eco & Bio-Med Technology (EPFL-ETHZ-Tokyo Tech Joint Symposium)
    • 発表場所
      EPFL, Lauzanne, Switzerland
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 比較ゲノム的手法を用いずに「保存性」の高い遺伝子を同定する2010

    • 著者名/発表者名
      相澤康則
    • 学会等名
      私立大学戦略的研究基盤形成支援事業セミナー
    • 発表場所
      日本医科大学
    • 年月日
      2010-11-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ペプチド創薬シーズとしてのノンコーディングRNA2010

    • 著者名/発表者名
      相澤康則
    • 学会等名
      医薬基盤研セミナー
    • 発表場所
      独立行政法人 医薬基盤研究所
    • 年月日
      2010-09-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Biomedical Application of Junk DNAs and RNAs2010

    • 著者名/発表者名
      相澤康則
    • 学会等名
      沖縄ゲノムサイエンス講演会
    • 発表場所
      沖縄健康バイオテクノロジーセンター
    • 年月日
      2010-08-09
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2018-03-28  

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